廣東省江門市HIV-1亞型及流行毒株gag基因特征分析
發(fā)布時(shí)間:2021-07-31 14:29
目的了解廣東省江門市1型艾滋病病毒(HIV-1)基因亞型分布狀況及其主要流行株CRF01AE的傳播和基因變異特征。方法收集江門市2018-2019年新確證為HIV-1感染且未經(jīng)抗病毒治療的208例樣本,采用巢式熒光定量聚合酶鏈反應(yīng)法(PCR)擴(kuò)增gag基因序列并測(cè)序,應(yīng)用Genotyping Tool進(jìn)行基因分型、PhyML3.0軟件構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,利用Entropy和VESPA程序?qū)RF01AE毒株亞簇進(jìn)行氨基酸序列特征分析。結(jié)果成功測(cè)得gag序列173條,異性性傳播占72.83%(126條),同性性傳播占17.92%(31條);亞型分析結(jié)果顯示,CRF01AE 69例(39.88%),CRF07BC 57例(32.95%),19例(10.98%)CRF5501B,12例(6.94%)B亞型,其他亞型包括CRF08BC、CRF5901B、C亞型和URFs共16例(9.25%)。CRF01AE在系統(tǒng)進(jìn)化樹上形成...
【文章來源】:中國(guó)艾滋病性病. 2020,26(09)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:5 頁(yè)
【部分圖文】:
CRF01_AE毒株兩個(gè)主要傳播簇氨基酸多態(tài)性分析
本文編號(hào):3313637
【文章來源】:中國(guó)艾滋病性病. 2020,26(09)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:5 頁(yè)
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CRF01_AE毒株兩個(gè)主要傳播簇氨基酸多態(tài)性分析
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