腸道菌群在肝硬化合并自發(fā)性腹膜炎和發(fā)熱伴血小板減少綜合征患者中的變化研究
發(fā)布時間:2021-07-19 22:40
目的運用16S rDNA高通量測序技術對比肝硬化合并自發(fā)性細菌性腹膜炎(Spontaneous bacterial peritonitis,SBP)患者與健康人群腸道菌群的差異,探索腸道菌群多樣性和結(jié)構組成改變對SBP發(fā)生發(fā)展的影響,為研究SBP發(fā)病機制提供思路。基于二代測序技術研究發(fā)熱伴血小板減少綜合征(Severe fever with thrombocytopenia syndrome,SFTS)中腸道菌群的變化,對比SFTS患者腸道菌群與正常腸道微生態(tài)之間的差異,分析腸道菌群改變對SFTS疾病發(fā)展、轉(zhuǎn)歸的影響,為明確SFTS發(fā)病機制提供想法。材料與方法標本來源本研究收集16例SBP患者的糞便標本來源于安徽醫(yī)科大學第一附屬醫(yī)院感染科2015-2016年住院患者,SBP患者病例入選條件符合2010年歐洲肝病學會(EASL)發(fā)表的《肝硬化腹水、自發(fā)性細菌性腹膜炎和肝腎綜合征處理臨床實踐指南》中的診斷標準。與SBP組進行對比的14例健康對照組糞便標本來源于安徽醫(yī)科大學第一附屬醫(yī)院體檢中心,健康對照組樣本排除標準包括除外病毒性肝炎、肝硬化、自身免疫性肝炎等肝臟疾病,以及除外妊娠和其他原發(fā)...
【文章來源】:安徽醫(yī)科大學安徽省
【文章頁數(shù)】:57 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
門水平上自發(fā)性細菌性腹膜炎組和健康對照組細菌占比差異Fig1SummaryofbacterialphylumdetectedintotheSBPandhealthcontrols
31圖 2 Venn 圖展示 OTU 在 SFTS 和健康對照組中的分布情況Fig2 Venn diagram illustrating shared OTUs across the SFTS and health control groups注:SFTS 發(fā)熱伴血小板減少綜合征(Severe fever with thrombocytopenia syndrome,SFTS)HC 健康對照組(Health control group,HC)3.3 腸道菌群多樣性分析腸道菌群多樣性包括菌群中細菌數(shù)量和細菌種類,即為菌群豐度和多樣性個方面,主要通過 OTU 數(shù)量、Chao 指數(shù)和 Shannon 指數(shù)這個常用指標來描其中,豐度的高低通過 OTU 數(shù)量和 Chao 指數(shù)大小反應,后兩者越大代表菌豐度越高,菌群所含細菌數(shù)量越多。菌群的多樣性則由 Shannon 指數(shù)反應Shannon 指數(shù)越大,菌群多樣性越大即為腸道菌群中含有的細菌種類越多。如
圖 3 門水平上 SFTS 患者和健康對照組腸道菌群構成分布Fig3 Summary of bacterial phylum detected in SFTS patients and health control groups注:SFTS 發(fā)熱伴血小板減少綜合征(Severe fever with thrombocytopenia syndrome,SFTS)HC 健康對照組(Health control group,HC)3.4.1 擬桿菌門無論是 SFTS 患者還是健康對照組,擬桿菌門都是腸道菌群中含量最高的菌門,雖然兩組的擬桿菌門的含量在門水平上的差異不明顯,但是將兩組細菌再次分析后發(fā)現(xiàn),在科水平上,隸屬于擬桿菌門的細菌可以細分為擬桿菌科(Bacteroidaceae)和普雷沃氏菌科(Prevotellaceae)。其中,普雷沃氏菌科在SFTS 患者腸道菌群中顯著降低(見表 8),且這種降低是由于普雷沃氏菌屬細
【參考文獻】:
期刊論文
[1]Gut microbiota imbalance and colorectal cancer[J]. Johan Gagnière,Jennifer Raisch,Julie Veziant,Nicolas Barnich,Richard Bonnet,Emmanuel Buc,Marie-Agnès Bringer,Denis Pezet,Mathilde Bonnet. World Journal of Gastroenterology. 2016(02)
[2]Gut microbiota and host metabolism in liver cirrhosis[J]. Makoto Usami,Makoto Miyoshi,Hayato Yamashita. World Journal of Gastroenterology. 2015(41)
[3]Role of gut microbiota and Toll-like receptors in nonalcoholic fatty liver disease[J]. Kouichi Miura,Hirohide Ohnishi. World Journal of Gastroenterology. 2014(23)
本文編號:3291564
【文章來源】:安徽醫(yī)科大學安徽省
【文章頁數(shù)】:57 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
門水平上自發(fā)性細菌性腹膜炎組和健康對照組細菌占比差異Fig1SummaryofbacterialphylumdetectedintotheSBPandhealthcontrols
31圖 2 Venn 圖展示 OTU 在 SFTS 和健康對照組中的分布情況Fig2 Venn diagram illustrating shared OTUs across the SFTS and health control groups注:SFTS 發(fā)熱伴血小板減少綜合征(Severe fever with thrombocytopenia syndrome,SFTS)HC 健康對照組(Health control group,HC)3.3 腸道菌群多樣性分析腸道菌群多樣性包括菌群中細菌數(shù)量和細菌種類,即為菌群豐度和多樣性個方面,主要通過 OTU 數(shù)量、Chao 指數(shù)和 Shannon 指數(shù)這個常用指標來描其中,豐度的高低通過 OTU 數(shù)量和 Chao 指數(shù)大小反應,后兩者越大代表菌豐度越高,菌群所含細菌數(shù)量越多。菌群的多樣性則由 Shannon 指數(shù)反應Shannon 指數(shù)越大,菌群多樣性越大即為腸道菌群中含有的細菌種類越多。如
圖 3 門水平上 SFTS 患者和健康對照組腸道菌群構成分布Fig3 Summary of bacterial phylum detected in SFTS patients and health control groups注:SFTS 發(fā)熱伴血小板減少綜合征(Severe fever with thrombocytopenia syndrome,SFTS)HC 健康對照組(Health control group,HC)3.4.1 擬桿菌門無論是 SFTS 患者還是健康對照組,擬桿菌門都是腸道菌群中含量最高的菌門,雖然兩組的擬桿菌門的含量在門水平上的差異不明顯,但是將兩組細菌再次分析后發(fā)現(xiàn),在科水平上,隸屬于擬桿菌門的細菌可以細分為擬桿菌科(Bacteroidaceae)和普雷沃氏菌科(Prevotellaceae)。其中,普雷沃氏菌科在SFTS 患者腸道菌群中顯著降低(見表 8),且這種降低是由于普雷沃氏菌屬細
【參考文獻】:
期刊論文
[1]Gut microbiota imbalance and colorectal cancer[J]. Johan Gagnière,Jennifer Raisch,Julie Veziant,Nicolas Barnich,Richard Bonnet,Emmanuel Buc,Marie-Agnès Bringer,Denis Pezet,Mathilde Bonnet. World Journal of Gastroenterology. 2016(02)
[2]Gut microbiota and host metabolism in liver cirrhosis[J]. Makoto Usami,Makoto Miyoshi,Hayato Yamashita. World Journal of Gastroenterology. 2015(41)
[3]Role of gut microbiota and Toll-like receptors in nonalcoholic fatty liver disease[J]. Kouichi Miura,Hirohide Ohnishi. World Journal of Gastroenterology. 2014(23)
本文編號:3291564
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