河北省鼠疫菌CRISPR基因分型及流行病學(xué)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-06-16 18:03
目的對河北省鼠疫菌株進(jìn)行規(guī)律聚集間隔短回文重復(fù)序列CRISPR)基因分型。方法利用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR),采用3對CRISPR引物,對河北省分離的128株鼠疫菌進(jìn)行擴(kuò)增,測定擴(kuò)增產(chǎn)物核酸序列并進(jìn)行分析,確定河北省菌株CRISPR基因型。結(jié)果 128株鼠疫菌在3個(gè)CRISPR位點(diǎn)上有8種間隔序列,包括al、a2、a3、b1、b2、c1、c2、c3,分為2個(gè)基因型。118株鼠疫菌株為Cb2型,另外10株鼠疫菌均為新基因型(命名為Cc△1型)。結(jié)論通過CRISPR分析顯示河北省鼠疫菌株遺傳進(jìn)化比較穩(wěn)定,建立了CRISPR基因庫,為鼠疫菌種群遺傳進(jìn)化和鼠疫防控的研究提供參考。
【文章來源】:中華衛(wèi)生殺蟲藥械. 2020,26(04)
【文章頁數(shù)】:3 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 菌株來源
1.2 儀器設(shè)備
1.3 試劑
1.4 引物及實(shí)驗(yàn)方法
1.5 基因測序
1.6 數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果
2.1 河北菌株的間隔序列及其陣列結(jié)果
2.2 河北菌株CRISPR分型結(jié)果
2.3 基于基因分型結(jié)果的流行病學(xué)分析
3 討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]2017年河北長爪沙鼠疫源地鼠疫菌的生態(tài)及差異區(qū)段分型研究[J]. 楊曉燕,杜國義,劉合智,史獻(xiàn)明,閆東,陳永明,周松,王海峰,胡樂樂. 中華衛(wèi)生殺蟲藥械. 2019(03)
[2]云南省鼠疫耶爾森菌規(guī)律成簇間隔短回文重復(fù)序列分型[J]. 楊光璨,石麗媛,郭英,張蓉,董珊珊,崔志剛,李偉,王鵬. 中華流行病學(xué)雜志. 2014 (08)
[3]鼠疫耶爾森氏菌的進(jìn)化研究:從系統(tǒng)發(fā)育學(xué)到系統(tǒng)發(fā)育基因組學(xué)[J]. 崔玉軍,宋亞軍,楊瑞馥. 中國科學(xué):生命科學(xué). 2013(01)
[4]河北省鼠疫自然疫源地內(nèi)自然染疫蚤的研究[J]. 劉合智,劉滿福,李玉貴. 中國媒介生物學(xué)及控制雜志. 2005(03)
[5]河北省康保鼠疫自然疫源地動物流行病學(xué)調(diào)查分析[J]. 李玉貴,孔祥驪,李振海,馮祿,吳曉明,劉煥文,董國潤,王鋼元,王惠孝,張彩虹. 中國媒介生物學(xué)及控制雜志. 1992(02)
本文編號:3233535
【文章來源】:中華衛(wèi)生殺蟲藥械. 2020,26(04)
【文章頁數(shù)】:3 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 菌株來源
1.2 儀器設(shè)備
1.3 試劑
1.4 引物及實(shí)驗(yàn)方法
1.5 基因測序
1.6 數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果
2.1 河北菌株的間隔序列及其陣列結(jié)果
2.2 河北菌株CRISPR分型結(jié)果
2.3 基于基因分型結(jié)果的流行病學(xué)分析
3 討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]2017年河北長爪沙鼠疫源地鼠疫菌的生態(tài)及差異區(qū)段分型研究[J]. 楊曉燕,杜國義,劉合智,史獻(xiàn)明,閆東,陳永明,周松,王海峰,胡樂樂. 中華衛(wèi)生殺蟲藥械. 2019(03)
[2]云南省鼠疫耶爾森菌規(guī)律成簇間隔短回文重復(fù)序列分型[J]. 楊光璨,石麗媛,郭英,張蓉,董珊珊,崔志剛,李偉,王鵬. 中華流行病學(xué)雜志. 2014 (08)
[3]鼠疫耶爾森氏菌的進(jìn)化研究:從系統(tǒng)發(fā)育學(xué)到系統(tǒng)發(fā)育基因組學(xué)[J]. 崔玉軍,宋亞軍,楊瑞馥. 中國科學(xué):生命科學(xué). 2013(01)
[4]河北省鼠疫自然疫源地內(nèi)自然染疫蚤的研究[J]. 劉合智,劉滿福,李玉貴. 中國媒介生物學(xué)及控制雜志. 2005(03)
[5]河北省康保鼠疫自然疫源地動物流行病學(xué)調(diào)查分析[J]. 李玉貴,孔祥驪,李振海,馮祿,吳曉明,劉煥文,董國潤,王鋼元,王惠孝,張彩虹. 中國媒介生物學(xué)及控制雜志. 1992(02)
本文編號:3233535
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