研究背景:結(jié)核病是由結(jié)核分枝桿菌感染引起的最常見的肺部流行性疾病之一,我國目前仍是全球結(jié)核負擔(dān)最重的國家之一,耐藥結(jié)核高發(fā)對衛(wèi)生安全構(gòu)成嚴重的威脅。目前診斷結(jié)核的手段存在特異性及敏感性不高、耗費時間長等缺點,成為早期診斷、早期治療、根除傳染源并切斷傳播途徑的主要障礙。探索可以早期診斷且具有高度敏感性及特異性的生物標(biāo)記物對阻斷結(jié)核傳播乃至消滅結(jié)核意義重大。miRNA作為一種進化高度保守的內(nèi)源性的非編碼微小RNA（microRNA,miRNA）,對基因表達的調(diào)控已經(jīng)被廣泛應(yīng)用于多種傳染病的研究。miRNA通過識別、結(jié)合靶基因mRNA的互補序列,或通過阻斷mRNA的翻譯,或促進其降解發(fā)揮生物學(xué)效應(yīng),成為轉(zhuǎn)錄后基因表達水平上的關(guān)鍵調(diào)節(jié)因子。單個的mRNA接受多個miRNA的調(diào)控,同時單個miRNA調(diào)控多個mRNA,并且不同miRNA之間的相互作用決定最后的生物學(xué)效應(yīng),因而呈現(xiàn)出復(fù)雜的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。病原體侵入人體細胞后可以引起細胞miRNA的表達發(fā)生快速改變。活動性結(jié)核患者外周血單個核細胞（PBMC）、血清及痰液中miRNA表達,與健康人群相比存在顯著差異并且已經(jīng)被多個研究所證實,從而提示miR... 

【文章來源】：浙江大學(xué)浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：64 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖１與健康供體樣本相比，結(jié)核病中差異表達的ｍｉＲＮＡ和ｍＲＮＡ

運用ＧＯ功能分析、ＫＥＧＧ途徑富集分析和ＤＡＶＩＤ數(shù)據(jù)庫對已經(jīng)識別的??ＤＥ－ｍＲＮＡｓ進行分析，富集閾值取ＥＡＳＥ得分為０．１，得到前１０位的ＤＥ－ｍＲＮＡ功能??注釋和明顯增加的生物學(xué)過程、通路、細胞成分和分子功能如圖２Ａ所示。顯著增??多的生物過程如信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、白細胞遷移和血管生成以及增多的ＭＡＰＫ??信號通路、黏著斑、Ｒａｐｌ信號通路、ｃＡＭＰ和ＥｒｂＢ信號通路見于圖２Ｂ。質(zhì)膜和胞??質(zhì)溶膠內(nèi)的ＤＥ－ｍＲＮＡ編碼蛋白顯著增多（圖２Ｃ）。顯著增強的分子功能如蛋白結(jié)??合，ＡＴＰ結(jié)合，蛋白異二聚化活性，蛋白激酶活性見于圖２Ｄ。??Ａ?Ｂ??＜ｎ?ｃａｎｃｖ?？?ｅｌｇｎｅｆ?ＩｍｎｅＡｘｉｎｎ?？??Ｆｏｃａｌ?ａｄｈＭｗ?〇〇〇〇＞?”〇ｕｎ＞ｏｎｏ？＞？ｎ？ｅｒｔｐ＞ｏｗ?ＰＮＡ－－＿ｎ＿＿＿ｎ＿?？?０?ＯＯＱＩＯ??Ｒａｐ１?？？？？？？?？?Ｂ?０?０００２?ｆ？ｇ？ｒｔ—ｅｎ?〇？?ｅ—?ｎ?＿??■?００００，?■?０?０００１０??？ＣＴｎｃｔ?ａｎｇｌａ｜ＢｎＭＭ＇?０００００５??ｃＭＫＰ?Ｍ〇ｎ？ｎｅ?ｐａｖ＜ｗ＾?？?ｐｏａＷ？？?ｃｓｇｕｌＭｏｎ?ａｔ?〇？■?ｍｇｒａｔｔｏｎ．??ｃ〇ｕｍ??Ａｒｔ＿ｎ＿ｌ＞：?ｔｕｍａｎｇ?Ｉｎ?？?３０?Ｍｎｃｙｔｏ?ｍｇｒａｂｏｎ．??…一ｎ？?一＾?＊?＊＞?一－一一＾?？’?＝??Ｎ＊ｎ

３．３蛋白質(zhì)間相互作用（ＰＰ丨）與基因免疫通路網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建??上傳相應(yīng)蛋白名稱至Ｓｔｒｉｎｇｓ數(shù)據(jù)庫并數(shù)據(jù)處理可以得到由６７０個節(jié)點和丨９４４??條邊組成的復(fù)雜ＤＥ－ｍＲＮＡ網(wǎng)絡(luò)見圖３。應(yīng)用ＭＣＯＤＥ提取了?４個具有２０個以上??節(jié)點的子網(wǎng)絡(luò)。最大的子網(wǎng)絡(luò)包括６１個節(jié)點和３０５個邊，可以根據(jù)拓撲結(jié)構(gòu)逬一??步劃分為６個較小的網(wǎng)絡(luò)。對最大的子網(wǎng)絡(luò)的免疫進程進行了更深一步的分析，??可發(fā)現(xiàn)基因？免疫途徑網(wǎng)絡(luò)由１８個下調(diào)基因和７個上調(diào)基因以及２２個免疫過程組??成，具體的基因－免疫逬程連接見圖４。最大的前１０個節(jié)點分別是Ｃ３ＡＲ１、ＣＣＲ７、??ＣＸＣＬ２、ＣＸＣＬ１、ＥＤＮ１、ＴＨＢＳ１、ＴＧＦＢ２、ＶＥＧＦＡ、ＥＤＮＲＢ?和?ＳＥＲＰＩＮ１。同??時可以發(fā)現(xiàn)，活動性結(jié)核的免疫過程顯著增多，主要包括白細胞遷移、細胞趨化、??趨化因子介導(dǎo)的信號通路，急性期反應(yīng)、ＳＭＡＤ蛋白磷酸化和進入細胞核、白細??胞介素－１２產(chǎn)生、巨噬細胞遷移和受體介導(dǎo)的內(nèi)吞作用。??皇??．＇參—?嫌么??圖３蛋白質(zhì)－蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)和一個子網(wǎng)絡(luò)被確定。??紅點，上調(diào)基因；藍點，下調(diào)基因。節(jié)點大小指示直接連接的通路數(shù)量的多少。??１３??

【參考文獻】：
期刊論文
[1]MicroRNAs as novel predictive biomarkers and therapeutic targets in colorectal cancer[J]. Verena Stiegelbauer,Samantha Perakis,Alexander Deutsch,Hui Ling,Armin Gerger,Martin Pichler.  World Journal of Gastroenterology. 2014(33)



本文編號：3217237