研究背景:結(jié)核病是由結(jié)核分枝桿菌感染引起的最常見(jiàn)的肺部流行性疾病之一,我國(guó)目前仍是全球結(jié)核負(fù)擔(dān)最重的國(guó)家之一,耐藥結(jié)核高發(fā)對(duì)衛(wèi)生安全構(gòu)成嚴(yán)重的威脅。目前診斷結(jié)核的手段存在特異性及敏感性不高、耗費(fèi)時(shí)間長(zhǎng)等缺點(diǎn),成為早期診斷、早期治療、根除傳染源并切斷傳播途徑的主要障礙。探索可以早期診斷且具有高度敏感性及特異性的生物標(biāo)記物對(duì)阻斷結(jié)核傳播乃至消滅結(jié)核意義重大。miRNA作為一種進(jìn)化高度保守的內(nèi)源性的非編碼微小RNA（microRNA,miRNA）,對(duì)基因表達(dá)的調(diào)控已經(jīng)被廣泛應(yīng)用于多種傳染病的研究。miRNA通過(guò)識(shí)別、結(jié)合靶基因mRNA的互補(bǔ)序列,或通過(guò)阻斷mRNA的翻譯,或促進(jìn)其降解發(fā)揮生物學(xué)效應(yīng),成為轉(zhuǎn)錄后基因表達(dá)水平上的關(guān)鍵調(diào)節(jié)因子。單個(gè)的mRNA接受多個(gè)miRNA的調(diào)控,同時(shí)單個(gè)miRNA調(diào)控多個(gè)mRNA,并且不同miRNA之間的相互作用決定最后的生物學(xué)效應(yīng),因而呈現(xiàn)出復(fù)雜的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。病原體侵入人體細(xì)胞后可以引起細(xì)胞miRNA的表達(dá)發(fā)生快速改變�；顒�(dòng)性結(jié)核患者外周血單個(gè)核細(xì)胞（PBMC）、血清及痰液中miRNA表達(dá),與健康人群相比存在顯著差異并且已經(jīng)被多個(gè)研究所證實(shí),從而提示miR... 

【文章來(lái)源】：浙江大學(xué)浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】：64 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖１與健康供體樣本相比，結(jié)核病中差異表達(dá)的ｍｉＲＮＡ和ｍＲＮＡ

運(yùn)用ＧＯ功能分析、ＫＥＧＧ途徑富集分析和ＤＡＶＩＤ數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)已經(jīng)識(shí)別的??ＤＥ－ｍＲＮＡｓ進(jìn)行分析，富集閾值取ＥＡＳＥ得分為０．１，得到前１０位的ＤＥ－ｍＲＮＡ功能??注釋和明顯增加的生物學(xué)過(guò)程、通路、細(xì)胞成分和分子功能如圖２Ａ所示。顯著增??多的生物過(guò)程如信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、白細(xì)胞遷移和血管生成以及增多的ＭＡＰＫ??信號(hào)通路、黏著斑、Ｒａｐｌ信號(hào)通路、ｃＡＭＰ和ＥｒｂＢ信號(hào)通路見(jiàn)于圖２Ｂ。質(zhì)膜和胞??質(zhì)溶膠內(nèi)的ＤＥ－ｍＲＮＡ編碼蛋白顯著增多（圖２Ｃ）。顯著增強(qiáng)的分子功能如蛋白結(jié)??合，ＡＴＰ結(jié)合，蛋白異二聚化活性，蛋白激酶活性見(jiàn)于圖２Ｄ。??Ａ?Ｂ??＜ｎ?ｃａｎｃｖ?？?ｅｌｇｎｅｆ?ＩｍｎｅＡｘｉｎｎ?？??Ｆｏｃａｌ?ａｄｈＭｗ?〇〇〇〇＞?”〇ｕｎ＞ｏｎｏ？＞？ｎ？ｅｒｔｐ＞ｏｗ?ＰＮＡ－－＿ｎ＿＿＿ｎ＿?？?０?ＯＯＱＩＯ??Ｒａｐ１?？？？？？？?？?Ｂ?０?０００２?ｆ？ｇ？ｒｔ—ｅｎ?〇？?ｅ—?ｎ?＿??■?００００，?■?０?０００１０??？ＣＴｎｃｔ?ａｎｇｌａ｜ＢｎＭＭ＇?０００００５??ｃＭＫＰ?Ｍ〇ｎ？ｎｅ?ｐａｖ＜ｗ＾?？?ｐｏａＷ？？?ｃｓｇｕｌＭｏｎ?ａｔ?〇？■?ｍｇｒａｔｔｏｎ．??ｃ〇ｕｍ??Ａｒｔ＿ｎ＿ｌ＞：?ｔｕｍａｎｇ?Ｉｎ?？?３０?Ｍｎｃｙｔｏ?ｍｇｒａｂｏｎ．??…一ｎ？?一＾?＊?＊＞?一－一一＾?？’?＝??Ｎ＊ｎ

３．３蛋白質(zhì)間相互作用（ＰＰ丨）與基因免疫通路網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建??上傳相應(yīng)蛋白名稱至Ｓｔｒｉｎｇｓ數(shù)據(jù)庫(kù)并數(shù)據(jù)處理可以得到由６７０個(gè)節(jié)點(diǎn)和丨９４４??條邊組成的復(fù)雜ＤＥ－ｍＲＮＡ網(wǎng)絡(luò)見(jiàn)圖３。應(yīng)用ＭＣＯＤＥ提取了?４個(gè)具有２０個(gè)以上??節(jié)點(diǎn)的子網(wǎng)絡(luò)。最大的子網(wǎng)絡(luò)包括６１個(gè)節(jié)點(diǎn)和３０５個(gè)邊，可以根據(jù)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)逬一??步劃分為６個(gè)較小的網(wǎng)絡(luò)。對(duì)最大的子網(wǎng)絡(luò)的免疫進(jìn)程進(jìn)行了更深一步的分析，??可發(fā)現(xiàn)基因？免疫途徑網(wǎng)絡(luò)由１８?jìng)�(gè)下調(diào)基因和７個(gè)上調(diào)基因以及２２個(gè)免疫過(guò)程組??成，具體的基因－免疫逬程連接見(jiàn)圖４。最大的前１０個(gè)節(jié)點(diǎn)分別是Ｃ３ＡＲ１、ＣＣＲ７、??ＣＸＣＬ２、ＣＸＣＬ１、ＥＤＮ１、ＴＨＢＳ１、ＴＧＦＢ２、ＶＥＧＦＡ、ＥＤＮＲＢ?和?ＳＥＲＰＩＮ１。同??時(shí)可以發(fā)現(xiàn)，活動(dòng)性結(jié)核的免疫過(guò)程顯著增多，主要包括白細(xì)胞遷移、細(xì)胞趨化、??趨化因子介導(dǎo)的信號(hào)通路，急性期反應(yīng)、ＳＭＡＤ蛋白磷酸化和進(jìn)入細(xì)胞核、白細(xì)??胞介素－１２產(chǎn)生、巨噬細(xì)胞遷移和受體介導(dǎo)的內(nèi)吞作用。??皇??．＇參—?嫌么??圖３蛋白質(zhì)－蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)和一個(gè)子網(wǎng)絡(luò)被確定。??紅點(diǎn)，上調(diào)基因；藍(lán)點(diǎn)，下調(diào)基因。節(jié)點(diǎn)大小指示直接連接的通路數(shù)量的多少。??１３??

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]MicroRNAs as novel predictive biomarkers and therapeutic targets in colorectal cancer[J]. Verena Stiegelbauer,Samantha Perakis,Alexander Deutsch,Hui Ling,Armin Gerger,Martin Pichler.  World Journal of Gastroenterology. 2014(33)



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