本文關(guān)鍵詞：宿主免疫基因IL-10、IL-4及TAP多態(tài)性與慢性HCV感染的相關(guān)性研究，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：背景：丙型肝炎病毒(hepatitis C virus, HCV)感染是引起慢性肝炎,肝硬化和肝癌的主要原因之一。宿主免疫系統(tǒng)在HCV病毒的感染及清除中起到重要作用,正確的抗原呈遞能夠誘導有效的細胞免疫和體液免疫應(yīng)答,同時細胞因子的適量表達也是機體有效應(yīng)答的重要保障。研究表明：作為MHC-I類抗原呈遞通路基因的一部分,抗原加工相關(guān)轉(zhuǎn)運體(Transporter associated with antigen presentation, TAP1 and TAP2 subunits)能夠?qū)⒖乖膹募毎|(zhì)轉(zhuǎn)運到內(nèi)質(zhì)網(wǎng),保證MHC抗原復合體的正確呈遞,誘導有效的細胞免疫應(yīng)答。而TAP1和TAP2基因序列的差異可能導致蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的不同,進而改變其功能,最終影響抗原呈遞過程。此外,細胞因子在病原感染和清除中的作用也不容忽視。研究證實,宿主免疫系統(tǒng)中的白介素10(interleukin 10, IL-10)在調(diào)節(jié)細胞疫和致炎細胞因子方面起重要作用；白介素4 (interleukin 4, IL-4)可促進MHC-Ⅱ類抗原、FcεR Ⅱ/CD23和CD40的表達,并增強B細胞提呈抗原的能力,在體液免疫應(yīng)答中發(fā)揮作用。目前,國內(nèi)外已報道了IL-10、IL-4以及TAP基因多態(tài)性分別與HCV慢性感染的關(guān)聯(lián)研究結(jié)果,但由于人種以及研究方法等因素的差異,結(jié)果并不完全一致。本研究旨在探討中國漢族人群中,IL-10、IL-4以及TAP基因多態(tài)性與HCV慢性感染的相關(guān)性,為丙肝的診治提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。方法：本研究分以云南漢族人群HCV慢性感染組和健康正常對照為研究對象,TaqMan探針基因分型方法對IL-10,IL-4和TAP基因多個SNPs進行基因分型,分別從等位基因、基因型以及單倍型水平分析以上免疫基因與HCV慢性感染的相關(guān)性。研究包括3部分：第一部分對IL-10基因啟動子SNPs-rs1800896、rs1800871和rs1800872的3個位點進行基因分型；第二部分對IL-4基因5’和3’非編碼區(qū)域6個SNPs-rs2243247、rs2243248、rs2243250、rs2070874、rs2227284和rs2243292進行基因分型；第三部分對7個TAP1SNPs-rs9276811、rs41555220、rs17879632、rs1057141、rs1135216、rs1057149和rs41551515以及3個TAP2SNPs-rs1042116、rs2228396和rs4148876進行基因分型,分別構(gòu)建單倍型,比較等位基因、基因型及單倍型頻率在病例組和對照組中的差異,評估以上免疫基因與HCV慢性感染的相關(guān)性。結(jié)果：(1)IL-10基因SNPs-rs1800896、rs1800871和rs1800872基因型頻率和等位基因頻率差異在病例組和正常對照組中無統(tǒng)計學意義(P0.05), SNPs-rs1800896、rs1800871和rsl800872構(gòu)建的單倍型頻率差異在病例組和對照組中無統(tǒng)計學意義(P0.05)。(2)IL-4基因SNPs-rs2243247、rs2243292在病例組和對照組中無多態(tài)性,SNPs-rs2243248、rs2243250、rs2070874和rs2227284的基因型頻率和等位基因頻率在病例組和對照組中差異無統(tǒng)計學意義(P0.05), SNPs-rs2243248、 rs2243250、rs2070874和rs2227284構(gòu)建的單倍型頻率在病例組和對照組中差異無統(tǒng)計學意義(P0.05)。 (3)TAP1中的rs1057141在病例組和對照組中有顯著性差異,基因型GG純合子在病例組中高于對照組(P=0.009, OR=2.617,95%CI1.238-5.530)。并且,單倍型TAP1*03:01-TAP2*01:01在病例組中的頻率高于對照組,1rAP1*03:01-TAP2*01:02/01:04頻率在病例組中的頻率低于對照組。結(jié)論：雖然本研究中未觀察到IL-10基因啟動子區(qū)以及IL-4基因5’和3’非編碼區(qū)域SNP位點在HCV慢性感染組和健康對照組中的顯著差異,但兩組中TAP1及TAP2基因則顯示出顯著差異。結(jié)果提示TAPI-1057141基因型GG以及單倍型TAP1*03:01-TAP2*01:01可能是云南漢族人群中HCV慢性感染的易感性因素,單倍型TAP1*03:01-TAP2*01:02/01:04可能是HCV慢性感染的保護性因素；而IL-10基因啟動子SNP-rs1800896、rs1800871和rs1800872及IL-4基因5’和3’非編碼區(qū)域SNP-rs 2243247、rs2243248、rs2243250、rs2070874、rs2227284 和 rs2243292可能不是云南漢族人群HCV慢性感染的易感或保護性因素。
【關(guān)鍵詞】：HCV IL-10基因 IL-4基因 TAP基因 單核苷酸多態(tài)性 關(guān)聯(lián)研究
【學位授予單位】：北京協(xié)和醫(yī)學院
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2015
【分類號】：R512.63
【目錄】：

• 摘要6-8
• Abstract8-11
• 一、前言11-15
• 二、實驗內(nèi)容15-66
• 第一部分 IL-10基因多態(tài)性與HCV感染的相關(guān)性研究15-33
• (一) 實驗材料15-17
• 1. 實驗對象15
• 2. 主要試劑15-16
• 3. 主要儀器16-17
• (二) 實驗方法17-26
• 1. DNA的提取及定量17-19
• 2. 樣本臨床指標的檢測19-21
• 3. IL-10基因單核苷酸多態(tài)性(SNP)位點基因分型21-25
• 4. 統(tǒng)計學處理25-26
• (三) 實驗結(jié)果與分析26-33
• 1. 研究對象的基本特征26
• 2. TaqMan探針基因分型結(jié)果26-28
• 3. 病例組和對照組IL-10基因的Hardy-Weinberg平衡檢驗28-29
• 4. IL-10多態(tài)性位點在病例組與對照組中的等位基因頻率與基因型頻率29-31
• 5. IL-10多態(tài)性位點在病例組與對照組中的連鎖不平衡分析31-32
• 6. IL-10多態(tài)性位點在病例組與對照組中單倍型構(gòu)建及其頻率32-33
• 第二部分 IL-4基因多態(tài)性與HCV慢性感染的相關(guān)性研究33-47
• (一) 實驗材料33
• 1. 實驗對象33
• 2. 主要試劑33
• 3. 主要儀器33
• (二) 實驗方法33-37
• 1. DNA的提取及定量33
• 2. 樣本臨床指標的檢測33
• 3. IL-4基因單核苷酸多態(tài)性(SNP)位點基因分型33-36
• 4. 統(tǒng)計學處理36-37
• (三) 實驗結(jié)果與分析37-47
• 1. 研究對象的基本特征37
• 2. TaqMan探針基因分型結(jié)果37-42
• 3. 病例組和對照組IL-4基因的Hardy-Weinberg平衡檢驗42-43
• 4. IL-4多態(tài)性位點在病例組與對照組中的等位基因頻率與基因型頻率43-45
• 5. IL-4多態(tài)性位點在病例組與對照組中的連鎖不平衡分析45-46
• 6. IL-4多態(tài)性位點在病例組與對照組中的單倍型構(gòu)建及其頻率46-47
• 第三部分 TAP基因多態(tài)性與HCV慢性感染的相關(guān)性研究47-66
• (一) 實驗材料47
• 1. 實驗對象47
• 2. 主要試劑47
• 3. 主要儀器47
• (二) 實驗方法47-51
• 1. DNA的提取及定量47
• 2. 樣本臨床指標的檢測47
• 3. TAP基因單核苷酸多態(tài)性(SNP)位點基因分型47-51
• 4. 統(tǒng)計學處理51
• (三) 實驗結(jié)果與分析51-66
• 1. 研究對象的基本特征51
• 2. TaqMan探針基因分型結(jié)果51-57
• 3. 病例組和對照組TAP基因的Hardy-Weinberg平衡檢驗57-58
• 4. TAP基因多態(tài)性位點在病例組與對照組中的等位基因頻率和基因型頻率58-63
• 5. HCV病例組和對照組TAP等位基因型分布63-65
• 6. TAP1-TAP2單倍型分布65-66
• 三、討論66-72
• 四、小結(jié)72-73
• 參考文獻73-78
• 附錄78-86
• 附錄1 縮略語表78-79
• 附錄2 部分樣本測序原始圖譜79-85
• 附錄3 主要溶液配制85-86
• 致謝86-87
• 研究生簡歷87-90

【參考文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 宋春輝;程云;;HCV感染過程中相關(guān)細胞因子研究進展[J];傳染病信息;2007年05期

中國博士學位論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 趙志海;丙型肝炎病毒慢性感染臨床免疫學研究[D];中國人民解放軍軍醫(yī)進修學院;2008年

  本文關(guān)鍵詞：宿主免疫基因IL-10、IL-4及TAP多態(tài)性與慢性HCV感染的相關(guān)性研究，，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

本文編號：313826