肺結(jié)核病血清生物學(xué)標(biāo)志物的篩
發(fā)布時(shí)間:2021-03-27 09:08
第一部分基于iTRAQ2D LC-MS/MS技術(shù)篩選與鑒定肺結(jié)核病血清蛋白生物學(xué)標(biāo)志物研究背景:結(jié)核病(Tuberculosis, TB)是由結(jié)核分枝桿菌(Mycobacterium tuberculosis, MTB)引起的一種嚴(yán)重危害人類健康的慢性呼吸道傳染病,以肺結(jié)核病最為常見(jiàn)。結(jié)核分枝桿菌的致病性與細(xì)菌增殖引起的炎癥反應(yīng)、以及機(jī)體產(chǎn)生遲發(fā)型變態(tài)反應(yīng)損傷相關(guān)。盡管直接觀察與短程治療(DOTS)戰(zhàn)略的擴(kuò)展及大量資金的投入,提高了治療完成率,但疾病的診斷仍然是全球結(jié)核病控制的主要障礙,結(jié)核病仍是發(fā)病率和死亡率最高的感染性疾病之一。疾病的早期診斷和及時(shí)治療對(duì)結(jié)核病的有效控制至關(guān)重要,是控制傳染源,遏制結(jié)核病流行的最重要措施。延誤診斷則導(dǎo)致疾病加重,增大死亡的風(fēng)險(xiǎn),促進(jìn)結(jié)核病的傳播。目前臨床上肺結(jié)核病的診斷方法有多種,但是鮮有改善結(jié)核病診斷的新技術(shù),使得結(jié)核病診斷方法陳舊。機(jī)體感染結(jié)核分枝桿菌后,通過(guò)固有免疫和獲得性免疫抵御病原菌,在相互作用過(guò)程中可能會(huì)引起宿主機(jī)體的病理生理改變,可以通過(guò)檢測(cè)這種變化,尋找肺結(jié)核病的早期診斷方法。血清具有易獲得、非侵入性、對(duì)疾病的反應(yīng)快速等優(yōu)點(diǎn),是疾病生...
【文章來(lái)源】:浙江大學(xué)浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:125 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
肺結(jié)核病的發(fā)病及免疫保護(hù)機(jī)制
由RUN1,RUN2表示。iTRAQ標(biāo)記樣本的質(zhì)譜圖以依賴于信息采集(IDA)模式獲得。從400-1500 M/Z掃描觀察分析獲得前20最強(qiáng)母離子而后進(jìn)行MS/MS。子離子光譜的質(zhì)量范圍在100-2000 m/z,低質(zhì)量離子的Q2過(guò)渡設(shè)置為2秒,使iTRAQ報(bào)告離子(丨13、114、115和116 m/z)的強(qiáng)度增強(qiáng)利于定量。iTRAQ報(bào)告離子峰面積的比值反映樣本中肽和蛋白質(zhì)的相對(duì)豐度。
理過(guò)程(23% ),刺激反應(yīng)過(guò)程(15% )和代謝過(guò)程(10% )。STRING軟件構(gòu)建蛋白-蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)圖見(jiàn)圖1.4。另外,根據(jù)蛋白差異倍數(shù)、是否有商品化試劍盒和生物信息分析,蹄選3個(gè)蛋白MMP9、S100A9和SOD3進(jìn)行后續(xù)驗(yàn)證。MMP9蛋白在健康對(duì)照組/TB組、肺炎組/TB組和肺癌組/TB組比值分別為0.56、0.56 和 0.47; S100A9 為 0.56、0.39 和 0.61; SOD3 為 0.49、0.58 和 0.56。MMP9、S100A9和S0D3蛋白鑒定與定量的MS/MS圖譜見(jiàn)圖1.5。A Cellular component D['* \ 一 KRT7SU L I —MM \ iM\ j tumw CI \l,__ ACTBB .MoJecularfunction \廣、\ — ? ^ T/7* \ ■fJllhllC ■?%?> 廣、KBT?} \ I?i5w ) — 一一 M / 口I aiBolnUi Uu?d*c? ?tftvtrt flipA /\ J ?tT^BtpcTMi trtnMs ?SiooA< / \C Biological process 7pf43mbti,h>pe?l *d%mHm? Molopcal r?vilattM ^-^KHT6C? fdiuUi roupoAMt ctfiBUSiioB at bi<^?v? flNl --^SI<i6dA^ ? \?t?Jbli*BimolkKalujiue tMk ^^S003 \? kukiMivsM ptotms 004■>n?liKdWai eipsiatl piocat‘rcqmn* 1? HinBlvt圖1.4差異蛋白的生物信息學(xué)分析。Fig. 1.4 Bio informatics analysis of the differentially expressed proteins. (A)Cellular component. (B) Molecular function. (C) Biological process. (D) The networkof proteins was analyzed by String software.
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Ficolins and infectious diseases[J]. Yushan Ren,Quanquan Ding,Xiaolian Zhang. Virologica Sinica. 2014(01)
[2]第四次全國(guó)結(jié)核病流行病學(xué)抽樣調(diào)查報(bào)告[J]. 全國(guó)結(jié)核病流行病學(xué)抽樣調(diào)查技術(shù)指導(dǎo)組. 中華結(jié)核和呼吸雜志. 2002(01)
本文編號(hào):3103246
【文章來(lái)源】:浙江大學(xué)浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:125 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
肺結(jié)核病的發(fā)病及免疫保護(hù)機(jī)制
由RUN1,RUN2表示。iTRAQ標(biāo)記樣本的質(zhì)譜圖以依賴于信息采集(IDA)模式獲得。從400-1500 M/Z掃描觀察分析獲得前20最強(qiáng)母離子而后進(jìn)行MS/MS。子離子光譜的質(zhì)量范圍在100-2000 m/z,低質(zhì)量離子的Q2過(guò)渡設(shè)置為2秒,使iTRAQ報(bào)告離子(丨13、114、115和116 m/z)的強(qiáng)度增強(qiáng)利于定量。iTRAQ報(bào)告離子峰面積的比值反映樣本中肽和蛋白質(zhì)的相對(duì)豐度。
理過(guò)程(23% ),刺激反應(yīng)過(guò)程(15% )和代謝過(guò)程(10% )。STRING軟件構(gòu)建蛋白-蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)圖見(jiàn)圖1.4。另外,根據(jù)蛋白差異倍數(shù)、是否有商品化試劍盒和生物信息分析,蹄選3個(gè)蛋白MMP9、S100A9和SOD3進(jìn)行后續(xù)驗(yàn)證。MMP9蛋白在健康對(duì)照組/TB組、肺炎組/TB組和肺癌組/TB組比值分別為0.56、0.56 和 0.47; S100A9 為 0.56、0.39 和 0.61; SOD3 為 0.49、0.58 和 0.56。MMP9、S100A9和S0D3蛋白鑒定與定量的MS/MS圖譜見(jiàn)圖1.5。A Cellular component D['* \ 一 KRT7SU L I —MM \ iM\ j tumw CI \l,__ ACTBB .MoJecularfunction \廣、\ — ? ^ T/7* \ ■fJllhllC ■?%?> 廣、KBT?} \ I?i5w ) — 一一 M / 口I aiBolnUi Uu?d*c? ?tftvtrt flipA /\ J ?tT^BtpcTMi trtnMs ?SiooA< / \C Biological process 7pf43mbti,h>pe?l *d%mHm? Molopcal r?vilattM ^-^KHT6C? fdiuUi roupoAMt ctfiBUSiioB at bi<^?v? flNl --^SI<i6dA^ ? \?t?Jbli*BimolkKalujiue tMk ^^S003 \? kukiMivsM ptotms 004■>n?liKdWai eipsiatl piocat‘rcqmn* 1? HinBlvt圖1.4差異蛋白的生物信息學(xué)分析。Fig. 1.4 Bio informatics analysis of the differentially expressed proteins. (A)Cellular component. (B) Molecular function. (C) Biological process. (D) The networkof proteins was analyzed by String software.
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Ficolins and infectious diseases[J]. Yushan Ren,Quanquan Ding,Xiaolian Zhang. Virologica Sinica. 2014(01)
[2]第四次全國(guó)結(jié)核病流行病學(xué)抽樣調(diào)查報(bào)告[J]. 全國(guó)結(jié)核病流行病學(xué)抽樣調(diào)查技術(shù)指導(dǎo)組. 中華結(jié)核和呼吸雜志. 2002(01)
本文編號(hào):3103246
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