目的了解安徽省某高校一起急性胃腸炎暴發(fā)疫情的病原體基因分型和分子特征。方法采用實時熒光定量PCR法（Real-time PCR）對6份糞便/肛拭子標(biāo)本檢測諾如病毒核酸,檢出的陽性標(biāo)本經(jīng)傳統(tǒng)RT-PCR擴增衣殼蛋白區(qū)（ORF2）部分序列、基因測序和型別鑒定,利用Clustal X 2.0和Mega 6.0軟件對測定序列進行核苷酸同源性比對和構(gòu)建基因進化和親緣性關(guān)系樹。結(jié)果檢出4份標(biāo)本諾如病毒核酸陽性,陽性率為66.67%（4/6）;基因序列比對和進化親緣性關(guān)系顯示:諾如病毒基因型為GII.4型;2毒株序列之間核苷酸同源性為100%;與2014²015年上海株、香港株核酸同源性最高,均為100%;與2012澳大利亞Sydney株（JX459908）同源性為99.6%;與上海和香港兩地區(qū)毒株親緣性關(guān)系最近,聚為獨立一簇,同屬GII.4/Sydney 2012分支。結(jié)論引發(fā)該起急性胃腸炎暴發(fā)的病原體為GII.4型諾如病毒,且屬于GII.4 Sydney 2012變異株。 

【文章來源】：安徽預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志. 2016,22(06)

【文章頁數(shù)】：4 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 標(biāo)本來源
    1.2 核酸抽提和Real-time PCR檢測
    1.3 RT-PCR擴增和序列測定
    1.4 序列比對和進化分析
2 結(jié)果
    2.1 Real-time PCR檢測
    2.2 普通RT-PCR擴增和序列測定及提交
    2.3 ORF2區(qū)核苷酸同源性比較
    2.4 ORF2區(qū)基因進化樹與親緣性分析
3 討論


【參考文獻】：
期刊論文
[1]一起水源性諾如病毒引起的急性胃腸炎疫情的調(diào)查分析[J]. 汪金生,孫琴,曹孟嬋,李賢相,史永林,金愛武.  安徽預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志. 2016(02)
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[3]一起校園諾如病毒暴發(fā)疫情調(diào)查分析[J]. 夏俊瑞,吳金菊,姜凌,代金龍,張文艷.  安徽預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志. 2015(04)
[4]2011-2012年安徽省哨點醫(yī)院嬰幼兒病毒性腹瀉分子流行病學(xué)特征[J]. 史永林,查震球,胡萬富,吳家兵,王建軍.  中華疾病控制雜志. 2014(06)
[5]新型GⅡ.4諾如病毒重組株感染疫情的分子流行病學(xué)研究[J]. 宋燦磊,袁佳春,曹志城,李瀾,鐘海明,朱建明,高霞.  中華預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志. 2013 (12)
[6]江蘇省近期急性胃腸炎暴發(fā)中諾如病毒分子特征分析[J]. 付建光,艾靜,靳淼,劉成,沙丹,姚萍,吳斌,祁賢,鮑昌俊,朱葉飛,湯奮揚.  中華流行病學(xué)雜志. 2013 (08)



本文編號：3047821