發(fā)布時間：2020-12-08 03:04

　　目的:分析HBs Ab滴度>10 000 m U/ml外周血BCR CDR3受體庫的組成及特征,尋找可能的HBs Ab序列,為維持后續(xù)研究提供數(shù)據基礎。方法:提取HBs Ab滴度高于10 000 m U/ml樣本的PBMC總DNA,外送美國Adaptive Biotechnologies Immuno SEQ平臺行Illumina Solexa高通量測序,用IMGT數(shù)據庫中的High V-QUEST軟件初步分析BCR CDR3受體庫IGHV、IGHJ和IGHD基因亞群的分布情況、IGHV-J配對取用情況、CDR3區(qū)氨基酸長度分布及氨基酸取用情況,并與NCBI數(shù)據庫中HBs Ab序列進行比對。結果:實驗樣本均高頻取用基因亞群IGHV3、IGHV4,IGHJ4、IGHJ6,IGHD3、IGHD6;高頻取用配對IGHV3-J4、IGHV3-J6。CDR3區(qū)氨基酸長度均以14及15個氨基酸長度為中線呈正態(tài)分布,高頻取用的氨基酸依次為Y、G、D、A、R、S,在107、108、109、113、114位點呈現(xiàn)氨基酸多樣性取用,在105、106、115、116、117位點上取用氨基酸保守。與NC... 

【文章來源】：中國免疫學雜志. 2015年03期 第300-303頁 北大核心

【文章頁數(shù)】：4 頁

【部分圖文】：

IGHV/D/J基因家族的分布

圖1IGHV/D/J基因家族的分布Fig．1DistributionofIGHV/D/Jgenesubgroups圖2IGHV-J配對取用Fig．2IGHV-Jmatching圖3CDＲ3區(qū)長度分布及氨基酸取用情況Fig．3CDＲ3lengthandaminoacidsfrequency表3與NCBI數(shù)據庫HBsAbH-CDＲ3比對結果Tab．3ComparisonresultsbetweenB4B5withNCBIHBsAbH-CDＲ3NCBIsequenceIDV-GENEJ-GENECDＲ3lengthV-ＲEGIONidentity(%)J-ＲEGIONidentity(%)B4totalB4uniqueB5totalB5uniqueM88318.1IGHV4-39*01IGHJ3*022292.3684.004421074M883161IGHV4-39*01IGHJ2*012291.4188.681302942M88309.1IGHV1-2*02IGHJ5*021691.6780.3963515910U66189.1IGHV3-33*01IGHJ6*031192.7186.440000AB012909.1IGHV3-30*04IGHJ4*021193.0691.670000HW259028.1IGHV1-18*01FIGHJ4*02F1092.0187.23161531916AF236816.1IGHV3-11*01FIGHJ4*03F1398.9670.8399200SUM49716679322.4與NCBI數(shù)據庫中HBsAb比對結果從NCBI數(shù)據庫中獲得人源HBsAb序列13條，人工合成的HBsAb序列105條，B4、B5BCＲCDＲ3受體庫與其比較，未發(fā)現(xiàn)完全相同的CDＲ3序列。通過IMGT/HighV-QUEST分析，獲得7條可比對分析序列，將B4、B5BCＲCDＲ3序列與之比對，得到V基因、J基因、CDＲ3長度完全一致的總序列數(shù)為1160條，獨特序列48條，見表3。3討論生物體在長期的種系進化過程中形成一系列防御機制，包括固有免疫和適應性免疫，同時形成了多種抗原識別機制，其中B細胞特異性識別抗原和抗體形成及分泌作為適應性免疫的核心問題，一直受·302·中國免疫學雜志2015年第31卷

圖1IGHV/D/J基因家族的分布Fig．1DistributionofIGHV/D/Jgenesubgroups圖2IGHV-J配對取用Fig．2IGHV-Jmatching圖3CDＲ3區(qū)長度分布及氨基酸取用情況Fig．3CDＲ3lengthandaminoacidsfrequency表3與NCBI數(shù)據庫HBsAbH-CDＲ3比對結果Tab．3ComparisonresultsbetweenB4B5withNCBIHBsAbH-CDＲ3NCBIsequenceIDV-GENEJ-GENECDＲ3lengthV-ＲEGIONidentity(%)J-ＲEGIONidentity(%)B4totalB4uniqueB5totalB5uniqueM88318.1IGHV4-39*01IGHJ3*022292.3684.004421074M883161IGHV4-39*01IGHJ2*012291.4188.681302942M88309.1IGHV1-2*02IGHJ5*021691.6780.3963515910U66189.1IGHV3-33*01IGHJ6*031192.7186.440000AB012909.1IGHV3-30*04IGHJ4*021193.0691.670000HW259028.1IGHV1-18*01FIGHJ4*02F1092.0187.23161531916AF236816.1IGHV3-11*01FIGHJ4*03F1398.9670.8399200SUM49716679322.4與NCBI數(shù)據庫中HBsAb比對結果從NCBI數(shù)據庫中獲得人源HBsAb序列13條，人工合成的HBsAb序列105條，B4、B5BCＲCDＲ3受體庫與其比較，未發(fā)現(xiàn)完全相同的CDＲ3序列。通過IMGT/HighV-QUEST分析，獲得7條可比對分析序列，將B4、B5BCＲCDＲ3序列與之比對，得到V基因、J基因、CDＲ3長度完全一致的總序列數(shù)為1160條，獨特序列48條，見表3。3討論生物體在長期的種系進化過程中形成一系列防御機制，包括固有免疫和適應性免疫，同時形成了多種抗原識別機制，其中B細胞特異性識別抗原和抗體形成及分泌作為適應性免疫的核心問題，一直受·302·中國免疫學雜志2015年第31卷


本文編號：2904341