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廣西邊境與非邊境地區(qū)結(jié)核分枝桿菌耐藥及基因型分析

發(fā)布時間:2020-09-12 10:55
   目的本研究旨在通過對廣西與越南接壤的邊境地區(qū)和未接壤的非邊境地區(qū)2016?2017年結(jié)核分枝桿菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)的耐藥情況和基因型進行調(diào)查和比較分析,了解兩地區(qū)間結(jié)核分枝桿菌耐藥性和基因型的差異,為加強結(jié)核病(Tuberculosis,TB)防控、制定針對性防控措施提供參考依據(jù)。方法選取與越南接壤的、有代表性的百色、崇左、防城港作為邊境監(jiān)測點(邊境組),選取未與越南接壤的有代表性的桂林、貴港作為非邊境監(jiān)測點(非邊境組),于2016?2017年在結(jié)核病防治機構(gòu)按照監(jiān)測病例納入標準,連續(xù)納入登記治療且痰涂片抗酸桿菌陽性的TB患者。收集患者的問卷信息及MTB,對MTB進行耐藥性檢測,并采用溶解曲線間隔區(qū)寡核苷酸分型(Melting curve analysis-based Spoligotyping,McSpoligotyping)技術進行基因分型,最后將數(shù)據(jù)錄入Epidata 3.0數(shù)據(jù)庫中,并用SPSS 17.0進行統(tǒng)計分析。結(jié)果1.廣西邊境與非邊境地區(qū)MTB耐藥情況及影響因素比較:共納入TB患者1306例,其中邊境組631例,非邊境組675例。比較邊境組和非邊境組納入患者的分布情況,結(jié)果顯示,民族、家庭人均年收入、文化水平和患者類型在兩組間的分布差異有統(tǒng)計學意義(P0.05),邊境組和非邊境組患者分別以壯族、漢族為主,邊境組家庭人均年收入≤4000元、文化水平為高中以下及復治患者所占比例均高于非邊境組。本次研究共檢測了異煙肼(INH)、利福平(RFP)、乙胺丁醇(EMB)、鏈霉素(SM)、氧氟沙星(Ofx)、卡那霉素(Km)共6種藥物,邊境組總耐藥率、單耐藥率、多耐藥率和耐多藥率(分別為:18.07%、9.51%、2.69%和5.86%)均高于非邊境組(分別為:11.11%、7.70%、1.78%和1.63%),其中總耐藥率和耐多藥率在兩組間的差異有統(tǒng)計學意義(P0.05);邊境組對6種檢測藥物的任一耐藥率均高于非邊境組,其中INH和RFP的任一耐藥率在兩組間差異有統(tǒng)計學意義(P0.05);經(jīng)單因素和多因素Logistic回歸分析,結(jié)果顯示,邊境組和非邊境組的耐藥影響因素均為患者類型,復治是兩組TB患者耐藥的危險因素,其OR值在邊境組為1.86(95%CI:1.13?3.05),在非邊境組為2.72(95%CI:1.39?5.33)。2.廣西邊境地區(qū)與非邊境地區(qū)MTB基因型比較:從邊境組和非邊境組各隨機抽取450株MTB進行McSpoligotyping試驗,共獲得881株MTB的基因分型結(jié)果,其中邊境組435株,非邊境組446株。Spoligotyping分型結(jié)果顯示,兩組菌株均可分為北京基因型和非北京基因型,其中非邊境組北京型菌株比例高于邊境組(65.25%VS 55.63%),差異有統(tǒng)計學意義(P0.05);非北京型菌株中,邊境組可進一步分為T族、H族、EAI族、LAM族和MANU族(所占比例分別為:22.76%、3.45%、1.84%、0.46%和0.23%),非邊境組可進一步分為T族、H族和EAI族(所占比例分別為:19.51%、3.58%和0.22%),其中EAI族在兩組間的分布差異有統(tǒng)計學意義(P0.05);基因型聚類分析結(jié)果顯示,非邊境組MTB基因成簇率高于邊境組(80.04%VS 73.33%),差異有統(tǒng)計學意義(P0.05);分析北京基因型與菌株耐藥的相關性,結(jié)果顯示,非邊境組北京基因型菌株總耐藥率高于非北京基因型,差異有統(tǒng)計學意義(P0.05),邊境組菌株耐藥率在北京基因型與非北京基因型之間的分布差異無統(tǒng)計學意義(P0.05)。結(jié)論廣西邊境地區(qū)經(jīng)濟、文化水平低和復治的TB患者所占比例均高于非邊境地區(qū),其耐藥結(jié)核病(Drug-resistant tuberculosis,DR-TB)尤其是耐多藥結(jié)核病(Multiple drug-resistant tuberculosis,MDR-TB)疫情較非邊境地區(qū)嚴峻,應予以重視;復治是兩地TB患者發(fā)生耐藥的危險因素;邊境地區(qū)和非邊境地區(qū)均以北京基因型MTB為主要流行菌株,但非邊境地區(qū)北京基因型比例高于邊境地區(qū);邊境地區(qū)EAI族MTB流行比例高于非邊境地區(qū);非邊境地區(qū)MTB基因成簇率高于邊境地區(qū);邊境地區(qū)MTB基因型與耐藥性之間無關聯(lián),而非邊境地區(qū)北京基因型MTB的總耐藥率高于非北京基因型。
【學位單位】:廣西醫(yī)科大學
【學位級別】:碩士
【學位年份】:2019
【中圖分類】:R52;R181.3
【部分圖文】:

類型,影響因素分析,耐藥


圖 1-1 邊境、非邊境結(jié)核分枝桿菌耐藥類型構(gòu)成情況Figure1-1 Composition of drug resistance types of MTB in border group and non-border group2.3 耐藥影響因素分析2.3.1 單因素分析

溶解曲線,菌株,國際型,分類變量


圖 2-1 典型溶解曲線結(jié)果圖Figure2-1 Dissolution curve of typical results1.3 統(tǒng)計分析將試驗所得的 43 位二進制碼按 n=1、o=0 轉(zhuǎn)換成 0 和 1 的格式,同對應的樣本編號一起錄入 Excel 表中,然后將數(shù)據(jù)表提交至國際數(shù)據(jù)庫MIRU-VNTRplus (https://www.miru-vntrplus.org/MIRU/index.faces)中,與Spol DB 4.0 數(shù)據(jù)庫進行比對,得到每個菌株基因所對應的 Spoligotyping 國際型別編碼(SIT)和所屬基因家族,并進行聚類分析,生成菌株基因型聚類球狀圖;統(tǒng)計分析軟件為 SPSS 17.0,分類變量差異的比較采用χ2檢驗以及 Fisher 確切概率法。檢驗均為雙側(cè)概率檢驗,檢驗水準均為α=0.05。1.4 質(zhì)量控制DNA 樣本提取中,刮取菌株時應注意避免刮到培養(yǎng)基,吸取 DNA 上

分布情況,基因族,布圖,基因型


圖 2-2 邊境組、非邊境組各基因族群分布圖Figure2-2 Distribution of various gene families in border group and non-border group2.1.2 北京基因型菌株在不同人群中的分布情況分別對邊境組和非邊境組北京基因型 MTB 在不同人群中的分布情況進行分析,結(jié)果顯示,邊境組北京基因型菌株在不同性別、年齡、現(xiàn)住址、職業(yè)和患者類型間分布無差異(P>0.05),但在不同民族間分布有差異,經(jīng)兩兩比較發(fā)現(xiàn)漢族患者的臨床分離株中北京基因型 MTB 所占比例高于壯族(χ2=6.09,P=0.014),(詳見表 2-4);非邊境組中北京基因型菌株在不同性別、現(xiàn)住址、職業(yè)和患者類型間分布無差異(P>0.05),而在不同年齡和民族間的分布有差異,表現(xiàn)為≥60 歲患者的臨床分離株中北京基因型 MTB所占比例低于 30 59 歲患者(χ2=6.58,P=0.010)和<30 歲患者(χ2=12.28,P=0.000)、壯族患者的臨床分離株中北京基因型 MTB 所占比例高于漢族

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