發(fā)布時(shí)間：2020-07-11 00:16

【摘要】：研究目的：對(duì)2010-2014年間江蘇省13個(gè)地級(jí)市流感哨點(diǎn)醫(yī)院流感樣病例的監(jiān)測(cè)結(jié)果進(jìn)行流行病學(xué)特征分析,探討流感流行狀況、疫情趨勢(shì)和防控對(duì)策,對(duì)可能的流感爆發(fā)或流行發(fā)出及時(shí)預(yù)警,對(duì)江蘇省2010-2014年甲型H1N1(09pdm)流感病毒全基因組變異情況進(jìn)行分析,掌握甲型H1N1分子遺傳進(jìn)化特征,為其疫苗研制提供科學(xué)依據(jù),研究方法：(1)實(shí)驗(yàn)及數(shù)據(jù)采集按《全國(guó)流行性感冒(甲型H1N1流感)監(jiān)測(cè)工作方案》要求,收集哨點(diǎn)醫(yī)院流感樣病例(ILI)信息,采集病例咽拭子進(jìn)行流感病毒檢測(cè),陽(yáng)性樣本經(jīng)病毒分離培養(yǎng)及亞型鑒定,并將病例信息及結(jié)果錄入國(guó)家流感網(wǎng)絡(luò)監(jiān)測(cè)系統(tǒng)；隨機(jī)選取2010-2014年不同時(shí)間段,不同地區(qū)的具有代表性的48株甲型H1N1(09pdm)陽(yáng)性分離株,利用特異性引物分段擴(kuò)增并測(cè)定HA、NA、M、NP、MS、 PA、PB1、PB2八個(gè)基因片段。(2)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析利用EXCEL對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行整理,PASW (Predictive Analytics Software) 18.0軟件對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,并利用Frocasting模塊對(duì)流感樣病例周病例數(shù)進(jìn)行預(yù)測(cè)分析；從Genbank數(shù)據(jù)庫(kù)中下載甲型H1N1流感疫苗株作為參考序列,利用Lasergene 7.0 DNAstar軟件包中MegAlign、Edit Seq的對(duì)PCR產(chǎn)物測(cè)序結(jié)果進(jìn)行比對(duì)拼接,得到全長(zhǎng)的各片段序列;采用Molecular Evolutionary Genetics Analysis version (MEGA) 5.2.1軟件進(jìn)行對(duì)比,構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,對(duì)基因及氨基酸的序列分析；利用Data monkey (http://www.datamonkey.org/dataupload.php)在線軟件進(jìn)行HA、NA基因選擇壓力分析研究結(jié)果：(1)流感樣病例及陽(yáng)性分離率：時(shí)間分布,五年累計(jì)報(bào)告ILI病例123330例,分離陽(yáng)性流感病毒14238株,分離陽(yáng)性率為11.54%。2010年-2012年流感樣病例呈下降趨勢(shì),2013年流感樣病例數(shù)增多,并超過(guò)2010年,到2014年流感樣病例繼續(xù)上升,達(dá)到2010-2014年間的最高值；職業(yè)分布,以托幼兒童及散居兒童為主；年齡分布,以0～歲組所占比例最大,60歲以上老年人病例較少；性別分布,男女性流感樣病例數(shù)差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義；地區(qū)分布,蘇南地區(qū)IL1分離陽(yáng)性率高于蘇北和蘇中。(2)病原學(xué)監(jiān)測(cè)：2009年甲型H1N1暴發(fā)后,2010年仍有甲型H1N1的余波,但隨后B型和季節(jié)性H3取代了甲型H1N1成為主要流感流行株,自2013年春季開始,甲型H1N1再次流行起來(lái),并且全年都有監(jiān)測(cè)到甲型H1N1,與季節(jié)性H3成為2013年的主要優(yōu)勢(shì)株,2014年繼續(xù)甲型H1N1的流行。甲型H1N1及B型流感的高發(fā)季節(jié)主要為冬春季節(jié),季節(jié)性H3高峰期主要為夏季；年齡分布,5-24歲組主要感染B型流感,其余年齡段人群主要感染A型流感；性別分布,男女性感染各亞型流感差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義：地區(qū)分布,不同地區(qū)感染甲乙型流感之間差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。(3)以2010第1周至2014年第50周流感樣病例數(shù)進(jìn)行建模,預(yù)測(cè)得到預(yù)測(cè)模型ARIMA(0,1, 1)。(4)核苷酸平均總的遺傳距離HA=NS1PB2M2=PANANS2= PB1=NPM1,氨基酸平均總的遺傳距離HANAM2=NS1NS2PB2M1PAPB1NP。各序列核甘酸及氨基酸隨著時(shí)間的增加,在一定程度上,呈現(xiàn)出遺傳距離增大的趨勢(shì)。(5)系統(tǒng)發(fā)育樹,2009-2010年毒株與早期甲型H1N1流行毒株同源性較高,在2011及2012年期間甲型H1N1流感甚少,自從2013年開始,大部分毒株出現(xiàn)較大變異,使得2013與2014年毒株與早期毒株分枝較為明顯。(6)關(guān)鍵位點(diǎn)分析：HA蛋白,除具有8個(gè)固定的糖基化位點(diǎn),部分毒株新增2個(gè)糖基化位點(diǎn),在受體結(jié)合位點(diǎn)130環(huán)發(fā)生A135S(1株)突變,220環(huán)發(fā)生了V220E(1株)、D222N(1株)、D222G(3株)、Q223R(7株)、G225A(1株)突變,在突變率較高的190螺旋,發(fā)生S190I(1株)、L191I(4株)、L191F(1株)突變,13個(gè)變異發(fā)生在抗原位點(diǎn)上(Ca 2個(gè),Cb 1個(gè),Sa 5個(gè),Sb 5個(gè)),1株毒株在HA蛋白裂解位點(diǎn)發(fā)生非堿性氨基酸變異；NA蛋白,共有6個(gè)固定的糖基化位點(diǎn),此外,部分毒株糖基化位點(diǎn)增加,還有部分毒株出現(xiàn)位點(diǎn)突變,導(dǎo)致糖基化位點(diǎn)轉(zhuǎn)換或消失。NA蛋白酶活性中心及周圍輔助位點(diǎn)、耐藥位點(diǎn)上均未發(fā)現(xiàn)變異；M,M2序列L26、V27、A30、G34均未發(fā)生改變,同時(shí),所有毒株均存在S31N位點(diǎn)的變異；NS,關(guān)鍵位點(diǎn)未出現(xiàn)特異性變異；NP,分離毒株發(fā)生N202S(1株),K198R(1株)突變；PA,分離毒株在關(guān)鍵位點(diǎn)發(fā)生T173N(1株)、D189E(1株)、L226F(1株)、N228T(1株)、P224S(48株)、1690V(1株)、D111E(1株)突變：PB1,關(guān)鍵位點(diǎn)未出現(xiàn)特異性變異；PB2,關(guān)鍵位點(diǎn)未出現(xiàn)特異性變異；PB1-F2,毒株均在第12位、58位、88位提前出現(xiàn)終止密碼子,此外,還有三株毒株在第9位出現(xiàn)終止密碼子。(7)通過(guò)正向壓力選擇分析,得到HA氨基酸正向選擇壓力位點(diǎn)208、240、310,NA氨基酸正向選擇壓力位點(diǎn)4。研究結(jié)論(1)江蘇省流感的兩個(gè)高峰期為冬季延至初春(11～12月到來(lái)年1-3月)與夏季小高峰(7-9月),2010-2012年,流感流行株為B型和季節(jié)性H3N2(季H3),自2013年開始,流感主要流行株為甲型H1N1和季H3。建議根據(jù)江蘇省流感三間分布特征,采取相應(yīng)的預(yù)防控制措施。(2)通過(guò)運(yùn)用ARIMA模型對(duì)流感樣病例進(jìn)行預(yù)測(cè),早期預(yù)警,及時(shí)采取預(yù)防措施,盡可能的減少不必要的傷害和損失。(3)江蘇省甲型H1N1(09pdm)流感病毒基因變異加快,遺傳多樣性增加,未來(lái)的遺傳進(jìn)化值得進(jìn)一步關(guān)注。
【學(xué)位授予單位】：東南大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號(hào)】：R511.7;R181.3

【參考文獻(xiàn)】

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1 何敏;石利民;王燕;王璇;喬夢(mèng)凱;丁潔;;2013年南京市甲型H1N1流感病毒NA基因的進(jìn)化分析[J];南京醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2014年12期

2 葛愛(ài)華;鮑倡俊;祁賢;朱葉飛;許可;秦圓方;鄧斐;余慧燕;湯奮揚(yáng);;江蘇省2009-2012年流感監(jiān)測(cè)結(jié)果分析[J];中華疾病控制雜志;2014年02期

3 謝劍鋒;沈曉娜;王美愛(ài);楊式芹;黃萌;張炎華;修文瓊;翁育偉;嚴(yán)延生;鄭奎城;;福建省甲型H1N1流感病毒基因特征研究[J];病毒學(xué)報(bào);2014年01期

4 任娟娟;王晶鈺;劉紅彥;劉萬(wàn)華;武寧;邱淵皓;唐攀;江躍德;;陜西省avian-like H1N1豬流感病毒的遺傳進(jìn)化分析[J];中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué);2013年18期

5 李偉;羅鵬飛;鄧斐;秦圓方;資海榮;湯奮揚(yáng);祁賢;衛(wèi)平民;;江蘇省2011年乙型流感病毒血凝素和神經(jīng)氨酸酶分子流行特征[J];中華微生物學(xué)和免疫學(xué)雜志;2012年12期

6 呂燕;王春榮;龐立麗;楊國(guó)j;趙紅;張?chǎng)?關(guān)恒云;;2009～2011年濟(jì)南市流感樣病例哨點(diǎn)監(jiān)測(cè)資料分析[J];預(yù)防醫(yī)學(xué)論壇;2012年05期

7 張強(qiáng);展鵬;劉新泳;;RNA聚合酶——抗流感病毒的新靶點(diǎn)[J];生命的化學(xué);2012年01期

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9 楊慧萍;潘明;黃婷;劉李;劉磊;李天舒;;四川省2010~2011年度流感監(jiān)測(cè)分析[J];現(xiàn)代預(yù)防醫(yī)學(xué);2011年24期

10 李鈞;邵鐵娟;于新芬;葉榕;寇宇;;2009-2011年杭州地區(qū)甲型H1N1流感病毒神經(jīng)氨酸酶基因的遺傳進(jìn)化分析[J];中國(guó)預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志;2011年10期

本文編號(hào)：2749664