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廣東省人感染H7N9禽流感疫情與禽類市場污染等環(huán)境因素關(guān)系的研究

發(fā)布時間:2020-03-19 08:40
【摘要】:目的研究基于廣東省2013-2017年人感染H7N9禽流感疫情的暴發(fā)模式、傳播趨勢和時空聚集性的特點,探索人感染H7N9禽流感疫情的發(fā)生與禽類市場污染等環(huán)境因素的關(guān)系,并量化它們對人感染H7N9禽流感疫情的影響,為人感染H7N9禽流感疫情的預(yù)測預(yù)警、風(fēng)險評估提供參考,為及早提出針對性的防控策略,減少未來疫情發(fā)生和傳播的風(fēng)險提供科學(xué)依據(jù)。方法通過國家傳染病信息報告管理系統(tǒng)收集廣東省2013.06-2017.05期間的人感染H7N9禽流感病例個案信息,基于地理信息系統(tǒng)技術(shù)對我省人感染H7N9禽流感疫情的時空分布特點、空間分布格局以及時空聚集模式進(jìn)行研究;以廣東省2013-2017年人感染H7N9禽流感疫情季節(jié)性期間每周疫情發(fā)生與否為響應(yīng)變量,選取每周疫情前一周的禽類市場環(huán)境H7亞型禽流感病毒污染數(shù)據(jù)、氣象數(shù)據(jù)為預(yù)測變量,采用受試者工作特征(Receiver Operating Characteristic,ROC)曲線分析預(yù)測變量的臨界值。此外,以每周病例數(shù)為響應(yīng)變量,采用Spearman秩相關(guān)分析響應(yīng)變量與預(yù)測變量之間的相關(guān)性,利用增強回歸樹(Boosted Regression Tree,BRT)模型定量分析相關(guān)環(huán)境因素對每周疫情規(guī)模的相對貢獻(xiàn)。結(jié)果(1)截至2017年5月,廣東省人感染H7N9禽流感累計報告了258例實驗室確診病例。全局自相關(guān)分析結(jié)果顯示,全局Moran’I指數(shù)是0.236(Z=4.089,P0.001),提示疫情總體上呈空間聚集性。標(biāo)準(zhǔn)差橢圓分析結(jié)果顯示,疫情空間分布格局經(jīng)歷了初始于珠三角地區(qū)—沿珠三角地區(qū)向東北方向粵東地區(qū)蔓延—由粵東地區(qū)向西南方向回到珠三角地區(qū)擴散的過程。通過時空重排掃描聚類分析,發(fā)現(xiàn)了珠三角地區(qū)和粵東地區(qū)是兩個具有顯著性的疫情時空聚集區(qū)(P0.05)。(2)疫情前一周環(huán)境因素ROC曲線下面積(Area Under ROC Curve,AUC)范圍在0.666-0.817(P0.001),對于區(qū)分人感染H7N9禽流感疫情發(fā)生風(fēng)險有一定的準(zhǔn)確性。疫情前一周的H7亞型禽流感病毒市場陽性率為15.10%、H7亞型禽流感病毒樣品陽性率為2.24%、平均降水量為79.98mm、平均氣壓為1011.11hPa、平均相對濕度為75.65%、平均氣溫為17.30℃和平均氣溫差為8.22℃分別是疫情發(fā)生風(fēng)險的臨界值,總符合率范圍在65.63%-76.56%。(3)BRT分析結(jié)果顯示,訓(xùn)練數(shù)據(jù)的相關(guān)性為0.812,交叉驗證的相關(guān)性為0.672,標(biāo)準(zhǔn)誤0.051。此外,模擬值與實測值的標(biāo)化平均總偏差4.266%,標(biāo)化平均殘差1.276%,AUC為0.886,模型擬合效果較好。廣東省人感染H7N9禽流感疫情季節(jié)性期間每周病例數(shù)的前一周相關(guān)環(huán)境因素貢獻(xiàn)率從大到小依次是H7亞型禽流感病毒市場陽性率(28.27%)、平均氣溫差(27.09%)、平均氣溫(22.07%)、H7亞型禽流感病毒樣品陽性率(11.01%)、平均相對濕度(5.48%)、平均氣壓(4.17%)和平均累積降水量(1.90%)。其中,在對每周病例數(shù)貢獻(xiàn)率大于5%的環(huán)境因素中,每周病例數(shù)與市場陽性率、平均氣溫差和樣品陽性率呈正相關(guān),與平均氣溫和平均相對濕度呈負(fù)相關(guān)。結(jié)論本周H7亞型禽流感病毒市場陽性率、H7亞型禽流感病毒樣品陽性率、溫度和濕度等環(huán)境因素對H7N9病毒在人群傳播中起著重要的預(yù)警作用,可用于未來一周疫情發(fā)生風(fēng)險及規(guī)模大小的短期預(yù)測判斷。
【圖文】:

技術(shù)路線圖,疫情,藥科大學(xué),響應(yīng)變量


廣東藥科大學(xué)碩士研究生學(xué)位論文的疫情數(shù)據(jù),將每周病例數(shù)作為響應(yīng)變量,基于人感染 H7N9 禽流感疫情是小概率事件,發(fā)病人數(shù)實際分布近似 Poisson 分布。將疫情前一周的氣象因素及禽類市場 H7 亞型 AIV 環(huán)境因素作為預(yù)測變量。調(diào)用 R 語言中的 gbm 包以及 Elith編寫的 BRT 方程包進(jìn)行分析[39],設(shè)置學(xué)習(xí)速率為 0.001,每次隨機抽取 50%的數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,并進(jìn)行 10 折交叉驗證。貢獻(xiàn)率低于 5%的因素不具有顯著性。報告BRT 的標(biāo)化平均總偏差和標(biāo)化平均殘差,使用 AUC 評估 BRT 的預(yù)測能力[34]。2.5 技術(shù)路線圖

空間分布,禽流感,疫情,廣東省


圖 3.4 廣東省人感染 H7N9 禽流感病例空間分布 廣東省人感染 H7N9 禽流感疫情時空特點1 疫情空間自相關(guān)分析自相關(guān)分析結(jié)果顯示,,廣東省 2013-2017 年人感染 H7N9 禽流感疫an I 指數(shù)是 0.236(Z=4.089,P<0.001),提示疫情總體上呈空間,2013.06-2014.05 期間疫情全局 Moran I 指數(shù)是 0.229(Z=4.,疫情呈空間聚集性;2014.06-2015.05 期間疫情全局 Moran I(Z=2.886,P=0.004),疫情呈空間聚集性;2015.06-2016.05 期間an I 指數(shù)是 0.053(Z=1.107,P=0.269),疫情呈隨機分布;201期間疫情全局 Moran I 指數(shù)是 0.166(Z=2.887,P=0.004),疫情。結(jié)果見表 3.1。
【學(xué)位授予單位】:廣東藥科大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:R511.7;R181.3

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號:2589992

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