結核易感基因多態(tài)性與新疆哈薩克族結核病易感性的相關性研究
發(fā)布時間:2020-02-14 18:50
【摘要】:背景:結核病是主要的公共健康問題,每年有1000萬新病例被診斷為結核病,造成200萬受害者的死亡代價。然而,據(jù)估計在最初已經(jīng)感染了結核分枝桿菌的20億人中,只有5%到10%進展成為有癥狀的結核病。為什么有一些感染的個體進展成為活動性的疾病而其他人卻沒有,具體原因至今仍然不完全清楚。結核病在不同人種、種族和家族中以不同的比率發(fā)生表明了遺傳素質對結核易感性可能有重要作用。結核分枝桿菌與環(huán)境和宿主遺傳因素復雜的交互作用在結核病發(fā)展中扮演著關鍵性的作用。宿主遺傳因素至少部分解釋了為什么一些人對感染更敏感或不敏感。結核易感基因在結核病發(fā)生發(fā)展過程中具有重要作用。已知功能研究和作用機制比較明確的宿主基因有自然抗性相關巨噬細胞蛋白1(natural resistance associated macrophage protein1, NRAMP1)基因、維生素D受體(vitamin D receptor, VDR)基因、]HLA(human leukocyte antigen, HLA)-DRB1和HLA-DQB1基因等,結核病發(fā)生發(fā)展與這些基因某些位點多態(tài)性有關聯(lián),國內外多個研究團隊對于基因多態(tài)性與結核病易感性的相關性開展了大量研究,然而研究結果在不同的人種和種族并不一致,有的結果甚至截然相反,顯示出這些宿主基因多態(tài)性與結核病易感性之間的種族差異性,因此本研究主要探討結核易感基因與新疆哈薩克族結核病之間的關聯(lián)。 目的:研究NRAMP1基因的3’端非編碼區(qū)(3'untranslated region,3'UTR)、VDR基因(Fokl、TaqI位點)、HLA-DRB1和HLA-DQB1基因多態(tài)性與哈族人群結核病易感性是否相關。 方法:采用病例-對照研究的思路設計實驗。對于NRAMP1基因3’UTR位點,VDR基因兩個多態(tài)性(FokI、TaqI)位點進行基因分型選擇聚合酶鏈反應-限制性片斷長度多態(tài)性(Polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism, PCR-RFLP)分析的方法;而對于HLA-DRB1和HLA-DQB1基因進行基因分型則采用聚合酶鏈反應-序列特異性引物(Polymerase chain reaction-sequence specific primers, PCR-SSP)分析的方法。采用x2檢驗等統(tǒng)計方法分析NRAMP1基因3'UTR、VDR基因(FokI、TaqI位點)及HLA-DRB1和HLA-DQB1基因多態(tài)性與哈族結核病易感性的關系。 結果:1.NRAMP1基因3’UTR位點多態(tài)性在病例組與對照組問的分布差異有統(tǒng)計學意義(P=0.002, OR=1.859,95%CI=1.182-2.926). NRAMPI基因3'UTR位點的TGTG-頻率在病例組高于對照組,組間差異有統(tǒng)計學意義(P=0.000)。2. VDR基因FokI位點多態(tài)性在病例組與對照組間的分布差異有統(tǒng)計學意義(P=0.001,OR=1.530,95%CI=1.007-2.325)。VDR基因TaqI位點多態(tài)性在病例組與對照組間的分布差異無統(tǒng)計學意義(P0.05)。VDR基因FokI位點的f等位基因頻率在病例組和對照組中的分布差異有統(tǒng)計學意義(P=0.000);而VDR基因TaqI位點的t等位基因頻率在病例組低于對照組,組間差異無統(tǒng)計學意義(P=0.260)。3.病例組HLA-DRB1*04和HLA-DQB1*0201等位基因頻率明顯高于對照組,有統(tǒng)計學意義(P=0.011and0.002, OR=1.889and1.802,95%CI=1.153-3.095and1.230-2.639)。 結論:在新疆哈薩克族人群中,NRAMPI基因3'UTR位點多態(tài)性可能與結核病易感性有關聯(lián),攜帶TGTG-等位基因增加了患結核病的風險;VDR基因的FokI位點多態(tài)性可能與結核病易感性相關,攜帶f等位基因增加了該人群患結核病的風險;TaqI位點多態(tài)性與結核病易感性不相關;VDR基因這兩個多態(tài)性位點之間不存在連鎖不平衡;攜帶HLA-DRB1*04和HLA-DQB1*0201等位基因增加了該人群患結核病的風險。
【圖文】:
華中科技大學博士學位論文結果基因多態(tài)性憸切分析結果.1 NRAMP1基因3’ UTR位點多態(tài)性酶切分析結果研究人群中發(fā)現(xiàn)NRAMP1基因3’UTR位點存在三種基因型:TGTG-/-、TGTG+/-、GTG+/+0用限制性內切酶Fokl消化PCR產(chǎn)物,結果顯示:如果TGTG缺失則不存Fokl酶切位點,PCR產(chǎn)物被酶切后電泳出現(xiàn)240bp—個片段;而TGTG無缺失則存在Fokl酶切位點,,PCR產(chǎn)物被酶切后電泳出現(xiàn)211bp和33bp兩個片段。雜合基因則產(chǎn)生240bp,211bp和33bp三個片段。酶切結果見圖1。
圖2 VDR基因(Fokl) PCR產(chǎn)物的酶切電泳圖M;DNA marker; 1: ff 型;2,4: FF 型;3: Ff 型DR基因TaqI位點多態(tài)性憸切分析結果研宄人群中發(fā)現(xiàn)VDR基因TaqI位點存在三種基因型:TT、Tt、tt。用限制性TaqI消化PCR產(chǎn)物,結果顯示:如果TaqI位點的T/C單核苷酸位點處是C,TaqI酶切位點,PCR產(chǎn)物被酶切后電泳形成290bp及165bp兩個片段;如果核苷酸處是T,則沒有TaqI酶切位點,PCR產(chǎn)物被酶切后電泳形成455bp段。雜合基因型則產(chǎn)生455bp,290bp及165bp三個片段。酶切結果見圖3。SOO bp > 'C ASS 1>P
【學位授予單位】:華中科技大學
【學位級別】:博士
【學位授予年份】:2014
【分類號】:R52
【圖文】:
華中科技大學博士學位論文結果基因多態(tài)性憸切分析結果.1 NRAMP1基因3’ UTR位點多態(tài)性酶切分析結果研究人群中發(fā)現(xiàn)NRAMP1基因3’UTR位點存在三種基因型:TGTG-/-、TGTG+/-、GTG+/+0用限制性內切酶Fokl消化PCR產(chǎn)物,結果顯示:如果TGTG缺失則不存Fokl酶切位點,PCR產(chǎn)物被酶切后電泳出現(xiàn)240bp—個片段;而TGTG無缺失則存在Fokl酶切位點,,PCR產(chǎn)物被酶切后電泳出現(xiàn)211bp和33bp兩個片段。雜合基因則產(chǎn)生240bp,211bp和33bp三個片段。酶切結果見圖1。
圖2 VDR基因(Fokl) PCR產(chǎn)物的酶切電泳圖M;DNA marker; 1: ff 型;2,4: FF 型;3: Ff 型DR基因TaqI位點多態(tài)性憸切分析結果研宄人群中發(fā)現(xiàn)VDR基因TaqI位點存在三種基因型:TT、Tt、tt。用限制性TaqI消化PCR產(chǎn)物,結果顯示:如果TaqI位點的T/C單核苷酸位點處是C,TaqI酶切位點,PCR產(chǎn)物被酶切后電泳形成290bp及165bp兩個片段;如果核苷酸處是T,則沒有TaqI酶切位點,PCR產(chǎn)物被酶切后電泳形成455bp段。雜合基因型則產(chǎn)生455bp,290bp及165bp三個片段。酶切結果見圖3。SOO bp > 'C ASS 1>P
【學位授予單位】:華中科技大學
【學位級別】:博士
【學位授予年份】:2014
【分類號】:R52
【參考文獻】
相關期刊論文 前10條
1 王春梅,李輝,曹峰林;HLA—Ⅲ類基因多態(tài)性與漢族肺結核病易感性關系的研究[J];哈爾濱醫(yī)藥;1999年01期
2 劉麗紅,孫晶,施秀琴,曹峰林;HLA與結核病相關性研究[J];哈爾濱醫(yī)藥;2001年01期
3 陳雪融;馮玉麟;馬s
本文編號:2579581
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