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干擾素誘導跨膜蛋白3 rs12252單核苷酸多態(tài)性與乙型流感臨床嚴重程度的相關性研究

發(fā)布時間:2019-08-24 10:46
【摘要】:為了研究干擾素誘導的跨膜蛋白3(Interferon-induced transmembrane protein 3,IFITM 3)rs12252單核苷酸多態(tài)性(Single nucleotide polymorphism,SNP)與乙型流感臨床嚴重程度的相關性,在吉林省和湖南省收集了181名乙型流感輕癥病例和83名乙型流感重癥病例全血標本,提取兩組病例基因組DNA并擴增相應的目的片段后,采用Sanger測序的方法對ITIM3rs12252SNP進行基因分型。同時選用千人基因組103名中國北京地區(qū)漢族人(CHB)為一般人群對照。統(tǒng)計分析結果表明,輕癥病例IFITM 3rs12252基因型頻率分布與一般人群對照無顯著性差異,但重癥病例rs12252CC基因型頻率顯著高于一般人群對照組。乙型流感重癥病例IFITM3rs12252C等位基因頻率顯著高于輕癥病例(P0.05),攜帶rs12252-C等位基因發(fā)展為乙型流感重癥的風險是rs12252-T等位基因的1.818倍(Odds Ratio=1.818,95%CI:1.241~2.664)。并且重癥病例中rs12252CC基因型頻率顯著高于輕癥病例(P0.05),表明rs12252CC基因型與乙型流感重癥相關。
[Abstract]:In order to study the correlation between the polymorphism of the interferon-induced transmembrane protein 3 (IFITM 3) rs12252 and the clinical severity of influenza B, In Jilin province and Hunan province,181 cases of influenza B and 83 of the whole blood of the severe case of influenza B were collected. The genomic DNA of the two groups was extracted and the corresponding target fragment was amplified, and the gene of the ITIM3rs12252SNP was genotyped by using the method of Sanger sequencing. At the same time,103 Chinese Han people (CHB) were selected as the control of the general population. The results of the statistical analysis showed that the frequency distribution of the IITM 3 rs12252 genotype was not significantly different from that of the control group in the general population, but the frequency of rs12252CC in the severe case was significantly higher than that of the control group in the general population. The frequency of the IFITMrs12252C allele in the severe case of influenza B was significantly higher than that of the mild case (P0.05). The risk of the development of the rs12252-C allele was 1.818 times that of the rs12252-T allele (Ods Ratio = 1.818,95% CI: 1.241-2.664). The genotype frequency of rs12252CC was significantly higher in the severe cases (P0.05), indicating that the rs12252CC genotype was related to the severe type of influenza B.
【作者單位】: 中國疾病預防控制中心病毒病預防控制所世界衛(wèi)生組織全球流感參比和研究合作中心感染性疾病診治協(xié)同創(chuàng)新中心衛(wèi)生和計劃生育委員會醫(yī)學病毒和病毒病重點實驗室;湖南省疾病預防控制中心;吉林省疾病預防控制中心;
【基金】:國家重點研發(fā)計劃(項目號:2016YFC1200201),題目:新發(fā)突發(fā)病原體發(fā)生和演化過程中的關鍵調頻分子及其機制研究 國家杰出青年科學基金(項目號:81525017),題目:流感病原生物學研究~~
【分類號】:R511.7

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本文編號:2528909

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