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新疆漢族與哈薩克族HLA-DRB1、DQB1、DPB1等位基因頻率與結(jié)核病相關(guān)性研究及新基因的發(fā)現(xiàn)

發(fā)布時(shí)間:2019-05-18 01:27
【摘要】:目的:1、探討新疆漢族HLA-DRB1、DQB1和DPB1基因頻率與結(jié)核病的關(guān)聯(lián)性,尋找與結(jié)核病可能相關(guān)的HLA易感基因。2、研究新疆哈薩克族HLA-DRB1、DQB1和DPB1基因多態(tài)性與結(jié)核病的關(guān)聯(lián),尋找與哈薩克族結(jié)核病可能相關(guān)的HLA易感基因。3、尋找HLA新等位基因。方法:1、采用回顧性病例—對(duì)照分析法,應(yīng)用以DNA測(cè)序?yàn)榛A(chǔ)的基因分型方法(PCR-SBT)對(duì)我國(guó)新疆石河子漢族92例肺結(jié)核患者和96例健康對(duì)照者在HLA-DRB1、DPB1 DQB1位點(diǎn)進(jìn)行位點(diǎn)分型。2、采用同樣方法,對(duì)新疆沙灣哈薩克族45例肺結(jié)核病例者和90例新疆哈薩克健康對(duì)照者分別進(jìn)行HLA-DRB1DQB1及DPB1位點(diǎn)的等位基因分型,統(tǒng)計(jì)采用P檢驗(yàn)、P值計(jì)算、單倍型計(jì)算,研究不同等位基因頻率與新疆哈薩克族結(jié)核病關(guān)聯(lián)性。3、采用基因克隆和DNA測(cè)序技術(shù),對(duì)懷疑新基因樣本"wp47"進(jìn)行深入研究,鑒定出新的等位基因。結(jié)果:1、研究發(fā)現(xiàn)漢族人病例組中,HLA-DRB1*07:01、DQB1*03:01頻率高于對(duì)照組(15.8% vs 8.3%,X2=4.92,P=0.027,PO.05;28.3% vs 13.5%,X2=14.144,P=0.000, P0.05);肺結(jié)核組中DPB 1*02:01基因頻率明顯低對(duì)照組(18.5% vs 28.1%,X2=4.877, P=0.027,P0.05)。單倍型中,DRB1*11:01-DQB1*03:01- DPB1*05:01、 DRB1*09:01-DQB1*03:03-DPB1*05:01、DRB1*07:01-DQB1*02:02、 DQB1*03:01-DPB1*05:01和DQB1*03:03-DPB1*05:01單倍型頻率病例組顯著高于對(duì)照組(5.6% vs 1%,X2=5.86,P=0.015,P0.05;8.9% vs 1.6%,X2=9.964,P=0.002,P0.05; 10.9% vs 4.7%,X2=5.045,P=0.025,P0.05;15.8% vs 7.5%,=6.65,P=0.01,P0.05;9.8% vs 2.3%,X2=8.431,P=0.004,P0.05),通過(guò)檢驗(yàn)發(fā)現(xiàn)病例-對(duì)照有顯著差異。2、哈薩克族人群HLA-DRB1基因頻率在病例組與對(duì)照組之間的差異無(wú)顯著性(P0.05);病例組DQB1*03:02基因頻率明顯低于對(duì)照組(3.3% vs 11.7%,X2=5.145, P=0.023,P0.05,OR:0.261[0.076-0.900]),差異具有顯著性;而病例組DQB1*05:01和DPB1*04:01基因頻率較對(duì)照組顯著增高(13.3% vs 5.6%,X2=4.850,P=0.028,P0.05, OR=2.615,95% CI[1.084-6.312];36.7% vs 23.3%,X2=5.317,P=0.021,P0.05,OR=1.902, [1.097-3.299] 95% CI),運(yùn)用分析得出病例-對(duì)照差異顯著。病例組DRB1*03:01-DQB1*02:01-DPB1*04:01單倍型頻率顯著高于對(duì)照組(8.9% vs 2.4%, P=0.023,P0.05,OR=4.29,95%[1.257-14.664]),統(tǒng)計(jì)學(xué)分析提示差異具有顯著性。3、證實(shí)新等位基因:“WP47”樣本DRB1基因型為HLA-DRB1*12:01,16:new.新等位基因HLA-DRB1*16:new與DRB1*16:23相比,在2號(hào)外顯子第227位上AT,在第236位置上TC堿基,被國(guó)際組織指定為:DRB1*16:36。結(jié)論:1、新疆漢族人群HLA-Ⅱ,DR區(qū)的DRB1*07:01及DQ區(qū)的DQB1*03:01基因可能為結(jié)核病易感基因;DPB1*02:01基因可能是保護(hù)基因;單倍型DQB1*03:01-DPB1-*05:01、DQB1*03:03-DPB1*05:01 DRB1*11:01-DQB1*03:01-DPB1*05:01、DRB1*09:01-DQB1*03:03-DPB1*05:01可能是漢族人群患肺結(jié)核的風(fēng)險(xiǎn)單倍型。2、在新疆哈薩克族肺結(jié)核患者與健康人群之間未發(fā)現(xiàn)HLA-DRB1基因頻率有明顯統(tǒng)計(jì)學(xué)差異;DQB1*03:02在健康對(duì)照組中基因頻率明顯增高,提示可能為哈薩克族結(jié)核病保護(hù)基因;病例組DQB1*05:01和DPB1*04:01基因頻率明顯高于對(duì)照組,提示可能為哈薩克族結(jié)核病易感基因,病例組DRB1*03:01-DQB1*02:01-DPB1*04:01單倍型頻率顯著高于對(duì)照組,統(tǒng)計(jì)學(xué)分析提示差異具有顯著性,提示可能為哈薩克族易感單倍型。3、證實(shí)新的人類主要組織相容性復(fù)合體等位基因HLA-DRB1*16:36,并被正式命名。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】:華中科技大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號(hào)】:R52

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本文編號(hào):2479559

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