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浙江省結(jié)核分枝桿菌基因多態(tài)性及耐藥相關(guān)基因突變研究

發(fā)布時(shí)間:2018-10-19 19:23
【摘要】:目的:了解浙江省結(jié)核病耐藥譜動態(tài)變化趨勢;探討耐多藥結(jié)核分枝桿菌耐藥相關(guān)基因突變規(guī)律;分析浙江省結(jié)核分枝桿菌基因型分布和流行特征及其相關(guān)影響因素。 方法:回顧性分析浙江省3次結(jié)核病耐藥監(jiān)測數(shù)據(jù);利用基因測序方法,檢測結(jié)核病耐藥監(jiān)測項(xiàng)目中獲得的耐多藥結(jié)核分枝桿菌rpoB、katG、inhA基因序列;應(yīng)用Spoligotyping和MIRU-VNTR進(jìn)行菌株的基因分型,經(jīng)聚類分析并結(jié)合藥敏結(jié)果、流行病學(xué)等資料,采用χ2檢驗(yàn)和logistic回歸分析耐藥性產(chǎn)生的相關(guān)影響因素。 結(jié)果:1、從1998年-2008年,浙江省從涂陽肺結(jié)核病患者分離的結(jié)核分枝桿菌總耐藥率由21.5%上升到28.9%,其中初治肺結(jié)核總耐藥率由14.8%上升到26.5%,復(fù)治肺結(jié)核總耐藥率由59.0%下降至50.0%;總耐多藥率、初治耐多藥率和復(fù)治耐多藥率分別由9.1%、4.4%和34.7%下降至5.9%、3.3%和28.1%。 2、利福平表型耐藥菌株中MDR菌株的比例平均為76.1%,其中初治患者中比例為68.9,復(fù)治患者中比例為82.7%。 3、2008年浙江省耐藥監(jiān)測共分離耐多藥結(jié)核分枝桿菌55株,經(jīng)基因測序,94.6%(52/55)檢測到rpoB基因發(fā)生突變,92.7%(51/55)的菌株在507-533位利福平耐藥性決定區(qū)(RRDR)檢測到突變。rpoB基因最常見的突變位于531位,突變頻率為51.9%(27/52),相關(guān)的氨基酸改變存在S531F、S531L2種形式;其次為526位,突變頻率為21.2%(11/52),相關(guān)的氨基酸改變存在H526D、 H526Y2種形式。katG基因突變率為65.5%(36/55),最常見的突變?yōu)?15位點(diǎn)的AGC-ACC突變,占所有位點(diǎn)突變的77.8%。有6株菌株在inhA啟動子區(qū)檢測到突變,其中5株為C15T,1株為G17T。 4、Spoligotyping基因分型結(jié)果顯示北京家族基因型(占71.6%)和T家族基因型(占16.6%)是浙江省主要流行基因型,其中北京基因型流行率高于全國(62.2%)和南方(53.2%)水平,低于北方(76.5%)水平,在浙江省內(nèi)存在地域性差異。北京家族基因型與耐藥性、與性別、年齡、病人分類、戶籍和職業(yè)等之間不存在統(tǒng)計(jì)學(xué)意義上的相關(guān)性。經(jīng)過ETRA-E5個(gè)位點(diǎn)進(jìn)一步分型,發(fā)現(xiàn)42436基因型在MDR中的比例顯著高于敏感菌株。 5、Spoligotyping分型方法用于浙江省結(jié)核分枝桿菌的分型,其H僅僅為0.53,剔除北京家族基因型后,H高達(dá)0.93,顯示出高分辨率。21個(gè)MIRU-VNTR位點(diǎn)基因分型,顯示出高度的基因多態(tài)性,HGI指數(shù)從0.1-0.88不等。不同的位點(diǎn)組合顯示不同的分辨率和基因型成簇率,當(dāng)采用ETRA-E位點(diǎn)組合時(shí),分辨率為0.9554,菌株成簇率為78%;當(dāng)采用10個(gè)位點(diǎn)組合時(shí),HGI為0.9995,成簇率為8%;當(dāng)采用12個(gè)位點(diǎn)組合時(shí),分辨率為0.9998,成簇率為3%;采用18個(gè)和全部21個(gè)位點(diǎn)時(shí),HGI為0.99998,成簇率為0.6%,基本上所有的菌株都被分型為單個(gè)的基因型。 6、以ETRA-E5個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行聚類分析,結(jié)果顯示菌株的成簇率與耐藥性、基因型、性別、年齡、病人分類、職業(yè)有相關(guān)性,與戶籍沒有相關(guān)性。 結(jié)論:1、浙江省利福平耐藥菌株中MDR的比例較低,用利福平耐藥作為MDR-TB的篩選指針有待商榷。2、浙江省MDR-TB的耐藥基因突變特征大部分與國內(nèi)外研究相似,但也存在一些罕見的突變類型。3、北京家族基因型是浙江省的主要流行基因型,北京基因型分布與地域有相關(guān)性,與耐藥性、與結(jié)核病患者的流行病學(xué)特征無相關(guān)。4、浙江省的結(jié)核分枝桿菌的基因型成簇率低,分散程度高,42436基因型可以作為MDR-TB的監(jiān)測基因型?傊,此研究結(jié)果為浙江省進(jìn)一步開展結(jié)核分枝桿菌分子流行病學(xué)研究奠定了基礎(chǔ),也為浙江省結(jié)核病防治規(guī)劃的制訂和實(shí)施提供了可以參考的科學(xué)依據(jù)。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】:中國疾病預(yù)防控制中心
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2014
【分類號】:R52

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號:2282128

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