發(fā)布時(shí)間：2018-06-25 13:52

  本文選題：禽類場(chǎng)所 + 環(huán)境　； 參考：《中國人獸共患病學(xué)報(bào)》2017年03期

【摘要】：目的了解2014年長沙市禽類場(chǎng)所環(huán)境中H9N2亞型禽流感病毒(Avian influenza virus,AIV)血凝素(Hemagglutinin,HA)、神經(jīng)氨酸酶(Neuraminidase,NA)和非結(jié)構(gòu)蛋白(ron-structural,NS)基因的分子進(jìn)化特征,為人感染H9N2亞型AIV防控提供實(shí)驗(yàn)室科學(xué)證據(jù)支持。方法對(duì)2014年長沙市禽類場(chǎng)所中采集的501份環(huán)境標(biāo)本(禽類飲水263份,污水221份,其他標(biāo)本17份)利用real-time PCR方法進(jìn)行A型、H5、H7和H9亞型流感病毒核酸檢測(cè),然后對(duì)單獨(dú)H9陽性標(biāo)本利用HA和NA基因通用引物進(jìn)行RT-PCR擴(kuò)增和核苷酸測(cè)序,病毒HA、NA及NS基因測(cè)序結(jié)果在線BLAST分析,利用Bioedit和Mega5軟件進(jìn)行氨基酸比對(duì)和進(jìn)化樹構(gòu)建。結(jié)果從501份環(huán)境標(biāo)本中檢出A型AIV核酸陽性標(biāo)本350份,H9亞型核酸陽性標(biāo)本191份,占總標(biāo)本數(shù)量的38.12%,H5亞型核酸陽性標(biāo)本177份(35.33%),H7亞型核酸陽性11份(2.20%),H5和H9亞型混合核酸陽性標(biāo)本68份(13.57%)。部分單獨(dú)H9亞型核酸陽性標(biāo)本經(jīng)RT-PCR和核苷酸測(cè)序鑒定出陽性H9N2亞型病毒核酸標(biāo)本23份,分子進(jìn)化分析表明2014年長沙市禽類場(chǎng)所環(huán)境中的絕大部分H9N2亞型AIV HA、NA、NS基因來源于A/Chicken/Shanghai/F/98(F98)類似株病毒,屬于新的S基因型,HA蛋白受體結(jié)合位點(diǎn)(Receptor binding site,RBS)第235位(對(duì)應(yīng)H3流感第226位)氨基酸為Leu(L),表現(xiàn)為特異性結(jié)合人流感病毒受體特征,病毒HA、NA及NS蛋白關(guān)鍵分子位點(diǎn)表現(xiàn)為低致病性的分子特征。結(jié)論 2014年長沙市禽類場(chǎng)所環(huán)境中H9亞型AIV核酸陽性率最高,H9N2亞型AIV的HA、NA和NS基因表現(xiàn)為低致病性的分子特征,但具有容易感染人類的特征,需要進(jìn)一步加強(qiáng)監(jiān)測(cè)。
[Abstract]:Objective to investigate the molecular evolutionary characteristics of hemagglutinin (HA), neuraminidase (na) and nonstructural protein (ron-structuralNS) genes of H9N2 subtype avian influenza virus (Avian influenza virusus AIV) in poultry environment of Changsha City in 2014, and to provide scientific evidence for the prevention and control of human infection with H9N2 subtype AIV. Methods 501 environmental specimens collected from poultry sites in Changsha City in 2014 (263 birds drinking water, 221 sewage samples and 17 other specimens) were detected by real-time polymerase chain reaction (real-time) for influenza virus type A H5H7 and H9 subtype influenza virus nucleic acid. Then the H9 positive samples were amplified by RT-PCR and nucleotide sequencing using HA and na gene universal primers. The results of Hana and NS gene sequencing were analyzed online by blast. The amino acid alignment and phylogenetic tree were constructed by Bioedit and Mega5 software. Results out of 501 environmental samples, 350 AIV positive samples were found to be positive for H9 subtype nucleic acid, 191 samples were positive for H9 subtype nucleic acid. Of the total samples, 177 (35.33%) were positive for nucleic acid of H5 subtype and 68 (13.57%) were mixed nucleic acid positive for H5 and H9 subtypes in 11 (2.20%) of H7 subtype nucleic acid positive specimens. A total of 23 H9N2 subtype nucleic acid samples were identified by RT-PCR and nucleotide sequencing. Molecular evolution analysis showed that most of the H9N2 subtype AIV HNANAN NS gene in the poultry environment of Changsha City in 2014 was derived from a similar strain of A / Chickenr / Shanghai / F / 98 (F98) virus. Leu (L) is the amino acid at the 235th position (corresponding to the 226th position of H3 influenza) in the receptor binding site of the new S genotype of the HA protein, which exhibits the characteristic of specific binding to human influenza virus receptor. The key molecular loci of HAN na and NS protein were characterized by low pathogenicity. Conclusion the H9 subtype AIV nucleic acid positive rate in the poultry environment of Changsha City in 2014 is the highest, the H9N2 subtype AIV gene shows the low pathogenicity molecular characteristic, but has the characteristic of easy to infect the human, needs to strengthen the surveillance.
【作者單位】： 長沙市疾病預(yù)防控制中心;
【基金】：湖南省衛(wèi)生計(jì)生委2015年度科研計(jì)劃項(xiàng)目(No.B2015-153)~~
【分類號(hào)】：R511.7

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：2066198