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中國5個(gè)地區(qū)獻(xiàn)血人群HCV基因型分布及進(jìn)化分析

發(fā)布時(shí)間:2018-06-17 03:23

  本文選題:丙型肝炎病毒 + HCV基因; 參考:《中國輸血雜志》2017年05期


【摘要】:目的了解國內(nèi)不同地區(qū)獻(xiàn)血人群中HCV基因型、亞型分布及系統(tǒng)發(fā)育情況以及不同地區(qū)人群中HCV流行病毒株。方法收集來自重慶、新疆烏魯木齊、河南洛陽、四川綿陽和廣西柳州5地?zé)o償獻(xiàn)血人群的抗-HCV陽性血漿標(biāo)本802(人)份,采用逆轉(zhuǎn)錄巢式PCR對其HCV core基因片段擴(kuò)增并測序;應(yīng)用MEGA 6.0軟件構(gòu)建HCV分子進(jìn)化樹并對其做基因分型,用Arlequin和DNAsp軟件對不同地區(qū)不同HCV基因型做群體動(dòng)力學(xué)研究。采用SPSSStatistics17.0軟來分析HCV基因亞型和人口統(tǒng)計(jì)學(xué)特征的相關(guān)性。結(jié)果 5個(gè)地區(qū)獻(xiàn)血者抗-HCV陽性血漿標(biāo)本獲得HCV core基因片段成功擴(kuò)增的比例為52.24%(419/892),其中重慶為47.37%(116/247)、烏魯木齊為54.17%(104/192)、綿陽為64.35%(74/115)、洛陽為38.95%(67/172)、柳州為76.32%(58/76);所有陽性PCR產(chǎn)物經(jīng)雙向測序后均獲得核苷酸序列,共檢測出8個(gè)HCV基因亞型:HCV-1a 0.72%(3/419)、1b 59.90%(251/419),2a 16.95%(71/419),3a 4.53%(19/419)、3b 3.82%(16/419),6a 12.41%(52/419)、6e 0.95%(4/419)、6n 0.72%(3/419),未檢測到HCV-4和5型。5地獻(xiàn)血人群中比例較高的2種HCV基因亞型:重慶為1b 46.55%(54/116)、6a18.97%(22/52),烏魯木齊為1b 67.62%(71/104)、2a 21.90%(22/104)、洛陽為1b 64.18%(43/67)、2a 29.85%(20/67),綿陽為1b 80.00%(60/75)、2a 10.67%(8/75),柳州為1b 41.38%(24/58)、6a 36.21%(21/58)。HCV基因亞型和年齡、民族之間有明顯的差異(P0.05)。結(jié)論本組我國5個(gè)地區(qū)獻(xiàn)血人群HCV基因亞型豐度較高,以1b為主,2a次之,其余呈散在分布或未檢出;不同地區(qū)人群的優(yōu)勢基因型均以1b比例為最高,其次分別是2a或6a。HCV基因亞型和年齡、民族存在相關(guān)性。
[Abstract]:Objective to understand the HCV genotypes, subtype distribution and phylogeny of blood donors in different regions of China and HCV epidemic strains in different populations. Methods the anti -HCV positive plasma specimens from 5 free blood donors from Chongqing, Urumqi, Xinjiang, Henan, Luoyang, Sichuan Mianyang and Guangxi Liuzhou were collected and the reverse transcriptase was used. The HCV core gene fragment was amplified and sequenced by nested PCR, and MEGA 6 software was used to construct the HCV molecular evolution tree and make a genotyping. The group dynamics of different HCV genotypes in different regions was studied with Arlequin and DNAsp software. The correlation between the HCV gene subtypes and the demographic characteristics was analyzed by SPSSStatistics17.0 soft. Results 5 The successful amplification of HCV core gene fragment was 52.24% (419/892), among which Chongqing was 47.37% (116/247), Urumqi was 54.17% (104/192), Mianyang was 64.35% (74/115), Luoyang was 38.95% (67/172), and Liuzhou was 76.32% (58/76); all positive PCR products were sequenced by bidirectional sequencing. A total of 8 subtypes of HCV genes were detected: HCV-1a 0.72% (3/419), 1b 59.90% (251/419), 2a 16.95% (71/419), 3a 4.53% (19/419), 3b 3.82% (16/419), 6a 12.41% (0.95%), 0.72% (0.72%). 2) Urumqi is 1b 67.62% (71/104), 2a 21.90% (22/104), Luoyang is 1b 64.18% (43/67), 2a 29.85% (20/67), Mianyang is 1b 80% (60/75), 2a 10.67% (8/75), Liuzhou is 41.38%, and there are significant differences among ethnic groups in 5 regions of China. The abundance of type was higher, 1b was dominant, 2a was the second, and the rest were distributed or undetected. The dominant genotypes in different regions were the highest in 1b, followed by 2A or 6a.HCV subtypes and age, and the relationship between ethnic groups.
【作者單位】: 中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院輸血研究所;四川血液安全和血液代用品國際科技合作基地;
【基金】:國家自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目(81572089)
【分類號】:R512.63

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本文編號:2029442

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