本文關(guān)鍵詞：SNP研究概況及其在傳染病學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

《浙江林學(xué)院》 2008年

山核桃群體結(jié)構(gòu)及多樣性的研究

郭金劍  

【摘要】：本文采用擴(kuò)增片段多態(tài)性(AFLP)和微衛(wèi)星(SSR)分子標(biāo)記,研究了我國特有、浙江省重要的經(jīng)濟(jì)樹種山核桃(Carya cathayensis)的群體結(jié)構(gòu)與遺傳多樣性。主要研究結(jié)果如下: 建立了適合于山核桃葉片AFLP分析的體系,該體系的要點如下:(1)改良CTAB法適用于從山核桃葉中提取高質(zhì)量的DNA,提取的DNA可用于AFLP的分析。(2)采用EcoR I/MseⅠ酶切組合,酶切與接頭連接一步完成。(3)從256對引物中篩選適合于山核桃葉AFLP分析的引物組合為E-ACG+M-CTG、E-AAT+M-CCC、E-AGT+M-CCC、E-AGT+M-CGT、E-AAT+M-CGA、E-AGA+M-CCA、E-AGT+M8CCA、E-AGA+M-CGC。擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)6%變性聚丙烯酰胺凝膠電泳后進(jìn)行銀染,條帶信號強(qiáng)度一致性好,條帶分布均勻、清晰,分辨率較高。 用8對AFLP引物在100個來自天然群體的山核桃樣品中共產(chǎn)生了32個多態(tài)標(biāo)記,說明山核桃多態(tài)性水平低。兩點分析獲得495個標(biāo)記組合,其中60個組合具有顯著的LD,占所有分析標(biāo)記組合的12.10%;三點分析獲得4952個標(biāo)記組合,其中779個組合具有顯著的LD,占所有分析標(biāo)記組合的15.70%。 研究結(jié)果表明,山核桃天然群體中存在顯著的連鎖不平衡(LD),等位基因間緊密連鎖,重組率低,雜合度低,遺傳多樣性水平低。目前山核桃的分布具有極強(qiáng)的地域性,與我國其它的山核桃屬的種是分離的,沒有基因交流,推斷山核桃群體在進(jìn)化發(fā)育過程中經(jīng)歷了瓶頸過程,并伴隨著顯著的遺傳漂移,這個過程可以產(chǎn)生顯著的LD。山核桃半同胞在分子水平與母本相似,可能多數(shù)位點對的LD源自母本,存在同型配對,可能有孤雌生殖的現(xiàn)象存在。 山核桃作為一種木本經(jīng)濟(jì)樹種,其天然群體AFLP分析數(shù)據(jù)的LD分析,支持了鄔榮領(lǐng)研究小組所發(fā)展的適用于代表性不足的林木用顯性標(biāo)記來估計、檢測連鎖不平衡的模型,是該模型在林木中的具體應(yīng)用,同時也驗證了“三點分析可以更好地估計連鎖不平衡,且與二點分析相比,在檢測連鎖不平衡方面能力更強(qiáng)”的觀點。 山核桃母本與半同胞AFLP分析結(jié)果也表明,山核桃DNA水平多態(tài)性程度很低,母本與子代間幾乎沒有差異。 美國人在美國山核桃中開發(fā)的19對SSR引物不適用于山核桃,盡管山核桃與美國山核桃為同屬的兩個種。

【關(guān)鍵詞】：
【學(xué)位授予單位】：浙江林學(xué)院
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2008
【分類號】：S664.1
【目錄】：

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【引證文獻(xiàn)】

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中國重要報紙全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 本報記者 周兆木　通訊員 徐軍 管光前;[N];中國環(huán)境報;2009年

2 臨安記者站 管光前　王維;[N];杭州日報;2009年

3 大杜杜;[N];中華工商時報;2009年

4 孫鍵韻;[N];中國綠色時報;2010年

5 記者 吳永輝　通訊員 劉亮;[N];隴南日報;2010年

6 臨安記者站 管光前;[N];杭州日報;2010年

7 臨安記者站 管光前　通訊員 朱永軍;[N];杭州日報;2010年

8 吳志輝;[N];中國綠色時報;2011年

9 記者 張健康　何曉玲 通訊員 張慧;[N];中國綠色時報;2011年

10 李玉勝;[N];中國綠色時報;2011年

中國博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 寧紅;玉米彎孢菌葉斑病菌檢測技術(shù)及遺傳多樣性研究[D];四川大學(xué);2002年

2 逯曉萍;高丹草遺傳圖譜構(gòu)建及重要農(nóng)藝性狀的基因定位研究[D];內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué);2005年

3 馬守才;小麥多子房性狀的遺傳研究及AFLP分子標(biāo)記[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2005年

4 趙輝;玉米大斑病菌（Exserohilum turcicum）生理分化和遺傳多態(tài)性研究[D];沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué);2009年

5 劉振虎;中國苜蓿品種資源遺傳多樣性研究[D];北京林業(yè)大學(xué);2004年

6 楊元明;四川省玉米雜交種種質(zhì)研究[D];四川農(nóng)業(yè)大學(xué);2004年

7 李振俠;蘋果砧木耐鹽突變體的篩選及其鑒定[D];河北農(nóng)業(yè)大學(xué);2006年

8 王保通;中國小麥條銹菌優(yōu)勢種群預(yù)測及主要流行菌系的AFLP指紋分析[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2007年

9 鄭紅梅;西藏幾種嵩草種子萌發(fā)特性與分子系統(tǒng)發(fā)育研究[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2008年

10 申雪艷;孔雀魚微衛(wèi)星DNA標(biāo)記的研制及其遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建[D];中國海洋大學(xué);2007年

中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 劉丹;小麥光腥黑粉菌（Tilletia foetida）AFLP分析及其種的特異性SCAR標(biāo)記的發(fā)掘[D];四川農(nóng)業(yè)大學(xué);2005年

2 郭金劍;山核桃群體結(jié)構(gòu)及多樣性的研究[D];浙江林學(xué)院;2008年

3 賈璇;小麥抗葉銹基因Lr38的AFLP分子標(biāo)記[D];河北農(nóng)業(yè)大學(xué);2003年

4 溫小杰;我國陸地棉抗枯黃萎病品種遺傳多樣性分析[D];河北農(nóng)業(yè)大學(xué);2004年

5 洪丕征;刺槐耐鹽優(yōu)良無性系初步選育及AFLP遺傳多樣性分析[D];山東農(nóng)業(yè)大學(xué);2011年

6 廖勇;AFLP分子標(biāo)記與米產(chǎn)量雜種優(yōu)勢的關(guān)系的研究[D];中國農(nóng)業(yè)大學(xué);2003年

7 潘文嘉;利用AFLP技術(shù)對谷子抗銹基因進(jìn)行分子標(biāo)記[D];河北農(nóng)業(yè)大學(xué);2010年

8 朱肖艷;嫁接對西瓜品質(zhì)性狀的影響及AFLP多態(tài)性分析[D];河南大學(xué);2011年

9 沈恩健;利用AFLP和SSR對南海區(qū)域馬氏珠母貝群體的遺傳結(jié)構(gòu)分析[D];廣東海洋大學(xué);2010年

10 趙宏;我國棉花抗枯黃萎病部分骨干品種的AFLP研究[D];河北農(nóng)業(yè)大學(xué);2002年

  本文關(guān)鍵詞：SNP研究概況及其在傳染病學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

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本文編號：187701