肝細(xì)胞癌合并乙型肝炎肝硬化患者癌組織中長(zhǎng)鏈非編碼RNA表達(dá)譜分析
本文選題:乙型肝炎 + 肝硬化; 參考:《鄭州大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版)》2015年02期
【摘要】:目的:觀察長(zhǎng)鏈非編碼RNA(LncRNA)在肝細(xì)胞癌及癌旁肝硬化組織中表達(dá)譜的差異。方法:運(yùn)用LncRNA表達(dá)譜芯片檢測(cè)3例肝細(xì)胞癌組織及配對(duì)癌旁肝硬化組織中的LncRNA,對(duì)芯片檢測(cè)的原始數(shù)據(jù)進(jìn)行均一化處理和統(tǒng)計(jì)分析,采用分層聚類分析將2組間差異表達(dá)的LncRNA進(jìn)行分類。從差異表達(dá)的LncRNA中選取4個(gè)LncRNA在10例中進(jìn)行q PCR驗(yàn)證,以判斷芯片檢測(cè)結(jié)果的可靠性。結(jié)果:肝細(xì)胞癌組與癌旁肝硬化組2倍以上差異表達(dá)的LncRNA共2 225條,其中表達(dá)上調(diào)的747條(33.6%),表達(dá)下調(diào)的1 478條(66.4%),5倍以上表達(dá)上調(diào)的123條,5倍以上表達(dá)下調(diào)的353條。q PCR檢測(cè)結(jié)果與芯片檢測(cè)結(jié)果一致。結(jié)論:與癌旁肝硬化組織比較,肝細(xì)胞癌組織中LncRNA的表達(dá)譜具有顯著變化。
[Abstract]:Aim: to observe the difference of LncRNAs expression profiles in hepatocellular carcinoma and paracancerous liver cirrhosis. Methods: LncRNA expression microarray was used to detect LncRNAs in 3 hepatocellular carcinoma tissues and matched liver cirrhosis tissues. The original data were homogenized and statistically analyzed. Stratified cluster analysis was used to classify the differentially expressed LncRNA between the two groups. Four LncRNA samples from differentially expressed LncRNA were selected for Q PCR verification in 10 cases to determine the reliability of the chip detection results. Results: there were 2 225 LncRNA differentially expressed in hepatocellular carcinoma group and paracancerous cirrhosis group. Among them, 747 up-regulated and 1 478 down-regulated 1 478 or 66.4 times more than 5 times of up-regulated expression were detected with 353.Q PCR. The results were consistent with the results of microarray detection. Conclusion: the expression profile of LncRNA in hepatocellular carcinoma is significantly different from that in paracancerous liver cirrhosis.
【作者單位】: 深圳市第三人民醫(yī)院病理科;
【基金】:深圳市科技創(chuàng)新計(jì)劃項(xiàng)目JCYJ201404111137484100 深圳市科技計(jì)劃項(xiàng)目(醫(yī)療衛(wèi)生類)201202060
【分類號(hào)】:R735.7;R512.62;R575.2
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,本文編號(hào):1801646
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