本文選題：諾如病毒(Norovirus) + 急性胃腸炎　； 參考：《病毒學(xué)報(bào)》2017年05期

【摘要】：為了解2016年夏季一起發(fā)生在某赴內(nèi)蒙古旅游團(tuán)游客中的急性胃腸炎暴發(fā)流行的病毒病原。分別采集此次胃腸炎暴發(fā)流行中兩名患病游客腹瀉癥狀發(fā)生后第3天、5天和7天的糞便標(biāo)本,提取核酸后首先用熒光定量PCR擴(kuò)增諾如病毒核酸進(jìn)行檢測,陽性標(biāo)本分別用RT-PCR擴(kuò)增病毒VP1基因和RdRp區(qū)域基因,通過基因測序和序列比對進(jìn)行基因分型,構(gòu)建進(jìn)化樹確定進(jìn)化同源性。通過熒光定量PCR法檢測到兩名患者的糞便標(biāo)本均為諾如病毒陽性,提示此次胃腸炎暴發(fā)流行的病原為諾如病毒,進(jìn)一步的RT-PCR擴(kuò)增病毒基因分析顯示檢測到的諾如病毒為GII.P17-GII.G17型;構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹分析顯示本次與2014~2015年度廣州、中國香港、中國臺灣和日本等地的病毒親緣關(guān)系更為接近;氨基酸序列分析顯示該基因型與2014年以來流行的毒株同源性較近,與2014年之前流行的毒株相比變異較大,氨基酸變異主要出現(xiàn)在主要衣殼蛋白的P結(jié)構(gòu)域。提示GII.P17-GII.G17型諾如病毒也是引起內(nèi)蒙地區(qū)急性胃腸炎暴發(fā)流行的病毒病原。
[Abstract]:In order to understand the viral pathogens of acute gastroenteritis outbreak in a tourist group in Inner Mongolia in summer 2016.Stool samples of two tourists with diarrhea symptoms during the outbreak of gastroenteritis were collected respectively on the 3rd and 7th days after the onset of gastroenteritis. The nucleic acids were extracted and detected by fluorescence quantitative PCR amplification of norovirus nucleic acid.RT-PCR was used to amplify the VP1 gene and the RdRp region gene of the virus respectively. The gene was sequenced and sequenced to determine the evolutionary homology.The stool samples of the two patients were positive for norovirus by fluorescence quantitative PCR, indicating that the pathogen of the outbreak of gastroenteritis was Norovirus. Further RT-PCR amplification of the virus gene analysis showed that the detected norovirus was GII.P17-GII.G17 type.The phylogenetic tree analysis showed that the phylogenetic relationship was closer to that in Guangzhou, Hong Kong, China, Taiwan and Japan, and the amino acid sequence analysis showed that the genotype was close to that of the virus strains that had been prevalent since 2014.Compared with the prevalent strains before 2014, the variation of amino acids mainly occurred in the P domain of the main capsid protein.It is suggested that GII.P17-GII.G17 type Norovirus is also the pathogen causing the outbreak of acute gastroenteritis in Inner Mongolia.
【作者單位】： 首都兒科研究所病毒研究室兒童病毒病病原學(xué)北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】：北京市科委項(xiàng)目(項(xiàng)目號:Z11110705056811041),題目:北京兒童急性傳染病監(jiān)測體系的建立~~
【分類號】：R512.5

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本文編號：1737232