本文選題：風疹病毒　切入點：基因型　出處：《中國疫苗和免疫》2017年01期

【摘要】：目的分析珠海市2015-2016年風疹病毒基因型別和特征,為風疹控制和消除提供分子流行病學基線數(shù)據(jù)。方法采集2015-2016年珠海市疑似風疹病例出疹后3天內的咽拭子,使用熒光逆轉錄-聚合酶鏈反應(RT-PCR)方法檢測風疹病毒核酸,對陽性標本進行風疹病毒E1基因739個核苷酸片段(nt8731-nt9469)的擴增、序列測定和分析,與32株13個基因型的WHO參考株、中國其他省份流行的2B基因型分別構建基因親緣性關系樹。結果2015-2016年共收集疑似風疹病例的42份咽拭子標本,其中23份病毒核酸檢測陽性,經(jīng)進一步擴增,18份標本獲得了靶基因序列。基因親緣性關系分析顯示,18份標本均為2B基因型風疹病毒,核苷酸和氨基酸序列同源性分別為98.2%-100%和99.1%-100%,并可分成兩個進化分支,不同的進化分支包含了其他省份2B基因型分離株,無地理局限性和年代相關性。18株2B基因型風疹病毒在N-型糖基化位點、抗原表位、中和抗原決定簇和血凝抑制位點沒有發(fā)生突變。結論 2015-2016年珠海市流行2B基因型風疹病毒,與全國流行趨勢一致。應繼續(xù)加強珠海市風疹病毒分子流行病學監(jiān)測。
[Abstract]:Objective to analyze the gene types and characteristics of rubella virus from 2015 to 2016 in Zhuhai, and to provide molecular epidemiological baseline data for the control and elimination of rubella.Methods pharyngeal swabs of suspected rubella cases from 2015 to 2016 in Zhuhai were collected within 3 days after rash. The nucleic acid of rubella virus was detected by fluorescence reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR).The 739 nucleotide fragments of rubella virus E1 gene were amplified, sequenced and analyzed. The genetic relationship tree was constructed with 32 WHO reference strains of 13 genotypes and 2B genotypes prevalent in other provinces of China.Results A total of 42 pharyngeal swabs of suspected rubella cases were collected from 2015 to 2016, 23 of which were positive for nucleic acid detection, and 18 samples were further amplified to obtain the target gene sequence.Genetic analysis showed that all 18 samples were rubella virus of 2B genotype, the homology of nucleotide and amino acid sequences were 98.2-100% and 99.1-100%, respectively, and could be divided into two evolutionary branches.There were no mutations in N-type glycosylation sites, antigen epitopes, neutralizing antigenic determinants and hemagglutination inhibition sites of rubella virus with no geographical limitation and age correlation.Conclusion the prevalence of rubella virus genotype 2B in Zhuhai from 2015 to 2016 is consistent with the trend of epidemic in China.Molecular epidemiological surveillance of rubella virus should continue to be strengthened in Zhuhai City.
【作者單位】： 珠海市疾病預防控制中心;中國疾病預防控制中心病毒病預防控制所;
【分類號】：R511.2

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本文編號：1712241