本文選題：風(fēng)疹病毒　切入點(diǎn)：基因型　出處：《中國(guó)疫苗和免疫》2017年01期

【摘要】：目的分析珠海市2015-2016年風(fēng)疹病毒基因型別和特征,為風(fēng)疹控制和消除提供分子流行病學(xué)基線數(shù)據(jù)。方法采集2015-2016年珠海市疑似風(fēng)疹病例出疹后3天內(nèi)的咽拭子,使用熒光逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR)方法檢測(cè)風(fēng)疹病毒核酸,對(duì)陽(yáng)性標(biāo)本進(jìn)行風(fēng)疹病毒E1基因739個(gè)核苷酸片段(nt8731-nt9469)的擴(kuò)增、序列測(cè)定和分析,與32株13個(gè)基因型的WHO參考株、中國(guó)其他省份流行的2B基因型分別構(gòu)建基因親緣性關(guān)系樹(shù)。結(jié)果2015-2016年共收集疑似風(fēng)疹病例的42份咽拭子標(biāo)本,其中23份病毒核酸檢測(cè)陽(yáng)性,經(jīng)進(jìn)一步擴(kuò)增,18份標(biāo)本獲得了靶基因序列。基因親緣性關(guān)系分析顯示,18份標(biāo)本均為2B基因型風(fēng)疹病毒,核苷酸和氨基酸序列同源性分別為98.2%-100%和99.1%-100%,并可分成兩個(gè)進(jìn)化分支,不同的進(jìn)化分支包含了其他省份2B基因型分離株,無(wú)地理局限性和年代相關(guān)性。18株2B基因型風(fēng)疹病毒在N-型糖基化位點(diǎn)、抗原表位、中和抗原決定簇和血凝抑制位點(diǎn)沒(méi)有發(fā)生突變。結(jié)論 2015-2016年珠海市流行2B基因型風(fēng)疹病毒,與全國(guó)流行趨勢(shì)一致。應(yīng)繼續(xù)加強(qiáng)珠海市風(fēng)疹病毒分子流行病學(xué)監(jiān)測(cè)。
[Abstract]:Objective to analyze the gene types and characteristics of rubella virus from 2015 to 2016 in Zhuhai, and to provide molecular epidemiological baseline data for the control and elimination of rubella.Methods pharyngeal swabs of suspected rubella cases from 2015 to 2016 in Zhuhai were collected within 3 days after rash. The nucleic acid of rubella virus was detected by fluorescence reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR).The 739 nucleotide fragments of rubella virus E1 gene were amplified, sequenced and analyzed. The genetic relationship tree was constructed with 32 WHO reference strains of 13 genotypes and 2B genotypes prevalent in other provinces of China.Results A total of 42 pharyngeal swabs of suspected rubella cases were collected from 2015 to 2016, 23 of which were positive for nucleic acid detection, and 18 samples were further amplified to obtain the target gene sequence.Genetic analysis showed that all 18 samples were rubella virus of 2B genotype, the homology of nucleotide and amino acid sequences were 98.2-100% and 99.1-100%, respectively, and could be divided into two evolutionary branches.There were no mutations in N-type glycosylation sites, antigen epitopes, neutralizing antigenic determinants and hemagglutination inhibition sites of rubella virus with no geographical limitation and age correlation.Conclusion the prevalence of rubella virus genotype 2B in Zhuhai from 2015 to 2016 is consistent with the trend of epidemic in China.Molecular epidemiological surveillance of rubella virus should continue to be strengthened in Zhuhai City.
【作者單位】： 珠海市疾病預(yù)防控制中心;中國(guó)疾病預(yù)防控制中心病毒病預(yù)防控制所;
【分類(lèi)號(hào)】：R511.2

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本文編號(hào)：1712241