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轉(zhuǎn)錄介導(dǎo)的擴(kuò)增技術(shù)與real-time RT-PCR在人類免疫缺陷病毒檢測(cè)中的應(yīng)用

發(fā)布時(shí)間:2018-03-22 15:09

  本文選題:轉(zhuǎn)錄介導(dǎo)的擴(kuò)增技術(shù) 切入點(diǎn):人類免疫缺陷病毒 出處:《中南大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版)》2017年07期  論文類型:期刊論文


【摘要】:目的:利用轉(zhuǎn)錄介導(dǎo)的擴(kuò)增技術(shù)(transcription mediated amplification,TMA)擴(kuò)增HIV RNA,探討TMA技術(shù)擴(kuò)增HIV RNA的敏感性及其與實(shí)時(shí)熒光定量反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)的比較。方法:利用Taq Man探針、特異性引物、鼠白血病反轉(zhuǎn)錄酶、T7-RNA聚合酶及PCR底物等建立TMA擴(kuò)增體系。通過(guò)擴(kuò)增一組10倍梯度稀釋的HIV RNA轉(zhuǎn)錄標(biāo)準(zhǔn)品,評(píng)價(jià)TMA體系的靈敏性。收集60例HIV感染患者的血漿,同時(shí)采用TMA試劑與Cobas Amplicor HIV-1 Monitor 1.5版試劑進(jìn)行檢測(cè),比較兩種方法的陽(yáng)性檢出率,并利用線性回歸和Bland-Altman法分析兩種技術(shù)的相關(guān)性和一致性。結(jié)果:成功建立了TMA擴(kuò)增體系,這種技術(shù)可以檢測(cè)低至10 copies/m L的HIV轉(zhuǎn)錄標(biāo)準(zhǔn)品。60份HIV感染者血漿樣本中,TMA及Cobas均檢測(cè)到陽(yáng)性46份,均陰性12份,TMA檢測(cè)陰性而Cobas檢測(cè)陽(yáng)性樣本2份,檢測(cè)一致率為96.7%。兩種技術(shù)陽(yáng)性檢出率差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05)。對(duì)其中46份TMA檢測(cè)和Cobas檢測(cè)均有定量結(jié)果的血漿進(jìn)行線性回歸分析,兩種技術(shù)有非常好的相關(guān)性(r=0.997,P0.001)。Bland-Altman分析顯示兩種檢測(cè)方法定量Lg差值平均值為0.02,44份(95.7%)樣本在95%的一致性界限內(nèi)。結(jié)論:TMA技術(shù)具有高靈敏性潛能。TMA與real-time RT-PCR檢測(cè)血漿中HIV RNA具有非常好的相關(guān)性與一致性。
[Abstract]:Objective: to investigate the sensitivity of TMA to HIV RNA amplification and its comparison with real-time fluorescence quantitative reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR) using transcription mediated amplification technique (TMA). Methods: Taq Man probes, specific primers were used to amplify HIV RNAs. Mouse leukemia reverse transcriptase T7-RNA polymerase and PCR substrate were used to establish TMA amplification system. The sensitivity of TMA system was evaluated by amplification of a 10-fold gradient diluted HIV RNA transcriptional standard. The plasma samples of 60 patients with HIV infection were collected. At the same time, TMA reagent and Cobas Amplicor HIV-1 Monitor 1.5 reagent were used to compare the positive rate of the two methods, and the correlation and consistency between the two methods were analyzed by linear regression and Bland-Altman. Results: the TMA amplification system was successfully established. This technique can be used to detect as low as 10 copies/m L of HIV transcription standard. Among 60 plasma samples of HIV infected patients, 46 samples were positive for TMA and Cobas, 12 samples were negative for TMA and 2 samples were positive for Cobas. There was no significant difference in positive detection rate between the two techniques (P 0.05). A linear regression analysis was performed on 46 plasma samples with quantitative results of TMA and Cobas. There was a very good correlation between the two methods. Bland-Altman analysis showed that the average value of quantitative LG difference between the two methods was 0.02n.44 samples were within the 95% consistency limit. Conclusion the ratio TMA technique has high sensitivity potential. TMA and real-time RT-PCR can be used to detect HIV in plasma. RNA has very good correlation and consistency.
【作者單位】: 中南大學(xué)湘雅醫(yī)院感染病科病毒性肝炎湖南省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;傳染病診治國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室感染病診治協(xié)同創(chuàng)新中心;中南大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院微生物學(xué)系;
【基金】:湖南省科技廳科技計(jì)劃項(xiàng)目(2013SK3025)~~
【分類號(hào)】:R512.91

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):1649185

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