2013年聊城市手足口病流行病學與EV71和CVA16基因特征分析
本文關(guān)鍵詞: 手足口病 病原學 腸道病毒71型 柯薩奇病毒A組16型 出處:《山東大學》2014年碩士論文 論文類型:學位論文
【摘要】:一、研究背景 手足口病and,foot,and mouth disease,HFMD)是由多種腸道病毒引起的急性傳染病,以嬰幼兒常見,多發(fā)生在5歲以下的兒童,以手、足、口腔發(fā)生皰疹為主要臨床特征,少數(shù)患者可出現(xiàn)中樞神經(jīng)系統(tǒng)、呼吸系統(tǒng)的損害,導致肺水腫、心肌炎、腦水腫、無菌性腦膜炎、急性遲緩性麻痹等,個別重癥患者病情發(fā)展快,容易導致死亡,嚴重威脅患兒的身體健康和生命安全。山東省是手足口病的高發(fā)省份之一,1984年山東省棗莊市就第一次報告了手足口病暴發(fā)疫情。自2007年以后,聊城市手足口病發(fā)病率和重癥病例發(fā)生率逐年增長,疫情急劇上升,對社會造成的危害極其嚴重。因此,闡明聊城市手足口病的流行病學特點及病原體特征,對本地區(qū)手足口病防控、降低發(fā)病率和病死率都具有重要的意義。 二、研究目的 本研究通過對2013年聊城市手足口病的流行病學特點及病原學特征的分析,了解聊城市手足口病的流行規(guī)律及特點,明確2013年引起聊城市手足口病的主要病原體,并對EV71和CVA16進行基因特征分析,進一步闡明其遺傳進化規(guī)律及特點。為本市手足口病的預防和控制工作提供科學依據(jù)。 三、研究方法 1.采用描述性流行病學方法對2013年聊城市手足口病監(jiān)測系統(tǒng)中的病例,進行流行病學特征分析。 2.采用RT-PCR方法對2013年聊城市HFMD疑似病例標本進行核酸檢測和病原鑒定,使用RD細胞和Vero細胞對部分核酸檢測陽性標本進行病毒分離。應用RT-PCR方法對病毒分離產(chǎn)物進行鑒定,對鑒定為腸道病毒71型(Enterovirus71,EV71)和柯薩奇病毒A組16型(Coxsackievirus A16,CVA16)的部分陽性病毒分離物,進行VP1編碼區(qū)基因擴增及核苷酸序列測定。 3.隨機挑選3株不同臨床類型的EV71病毒分離株進行序列測定,和其它基因型及亞型的代表株序列構(gòu)建親緣性進化樹,對他們進行核苷酸和氨基酸同源性分析;隨機選取9株CVA16病毒分離株進行序列測定,和其它各基因型及亞型的代表株序列構(gòu)建親緣性進化樹,并進行核苷酸和氨基酸同源性分析。 四、研究結(jié)果 1.聊城市2013年HFMD的發(fā)病率,各年、月和縣市之間不同,差異有統(tǒng)計學意義;發(fā)病高峰主要集中在4-8月,與往年相似,發(fā)病人群主要集中在1-10歲,尤其是5歲以下,占總發(fā)病人數(shù)的96.30%;發(fā)病率男性較高于女性,男女性別比例為1.77:1,差別具有統(tǒng)計學意義,同時高唐縣人口的發(fā)病率比其他縣市人口的發(fā)病率高(P0.01)。 2.2013年聊城市共檢測手足口病病例標本961例,陽性747例,陽性率79.29%。其中EV71為74例,占陽性標本的9.91%,CVA16為130例,占17.40%;其它腸道病毒543例,占72.69%。其中2例重癥病例均進行了病原學檢測,經(jīng)鑒定均為EV71陽性。 3.應用BioEdit和MEGA4軟件對3株EV71進行VP1核苷酸和氨基酸分析,發(fā)現(xiàn)其彼此間同源性較高,其核苷酸之間的同源性為95.9%~97.9%;氨基酸之間的同源性為99.3%~99.6%,這3株EV71毒株均屬于C4a亞型。與U22521BrCr的核苷酸和氨基酸同源性分別為:81.8%~81.9%和94.2%~94.6%;與B基因型核苷酸和氨基酸同源性分別為:82.6%~85%和95.9%~97.6%;與C基因型核苷酸和氨基酸同源性分別為:86.1%~97.6%和96.6%~100%;而與C4基因亞型核苷酸和氨基酸同源性高達90.6%~97.6%和96.6%~100%;其中與C4a亞型的核苷酸和氨基酸同源性最高分別為:92.8%~97.6%和97.9%~100%;而與C4b亞型的核苷酸和氨基酸同源性分別為:90.6%~92.7%和96.6%~99.3%。 應用BioEdit和MEGA4軟件對9株CVA16進行VPl核苷酸和氨基酸分析,發(fā)現(xiàn)其彼此間同源性較高,其核苷酸之間的同源性為:97.7%-100%;氨基酸之間的同源性為:99.3%~100%,這9株CVA16毒株均屬于B2b亞型。與U05876G10(原型株)的核苷酸和氨基酸同源性分別為:75.8%~76.2%和91.5%~91.9%;與B基因型核苷酸和氨基酸同源性分別為:88.8%~98.5%和96.6%~100%;其中與B2b亞型的核苷酸和氨基酸同源性最高分別為:92.8%~100%和96.6%~100%;與B2a亞型的核苷酸和氨基酸同源性分別為:90.5%~94.0%和98.3%-99.6%。 五、結(jié)論 1.2013年引起聊城市手足口病的主要病原體以其它腸道病毒為主、兼有EV71和CVA16參與致本病。引起手足口病重癥病例均為EV71。 2.經(jīng)序列測定及比對發(fā)現(xiàn),2013年聊城市EV71病毒流行株均為C4a亞型,CVA16病毒流行株均為B2b亞型,與國內(nèi)其他地區(qū)報道相一致。 3.聊城市自2007年開展病原學檢測以來,EV71和CVA16交替出現(xiàn),2010年以EV71為主,2011年轉(zhuǎn)為CVA16為主,2012年又轉(zhuǎn)回以EV71為主,2013年手足口病主要病原體類型為其他腸道病毒,手足口病的病原譜正在發(fā)生改變,應加強EV71、CVA16及其他腸道病毒的監(jiān)測,密切觀察,有助于更好地預防和控制手足口病。
[Abstract]:......
【學位授予單位】:山東大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2014
【分類號】:R512.5
【參考文獻】
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,本文編號:1556191
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