本文關(guān)鍵詞：北京市29例新確證HIV-1感染者多區(qū)段序列病毒亞型分析

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【摘要】：目的了解北京市男男性行為人群(MSM)中,29例新確證HIV-1感染者病毒株的基因序列特征。方法對(duì)HIV-1感染者進(jìn)行流行病學(xué)調(diào)查,采集全血,分離血漿提取病毒核酸,應(yīng)用套式反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(nested reverse transcription-polymerase chain reaction,nested RT-PCR)分別擴(kuò)增gag、env和pol基因的部分片段,并對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行測(cè)序,用Mega 5.0軟件將測(cè)序結(jié)果與各亞型國(guó)際參考株比對(duì),根據(jù)基因序列離散度確定系統(tǒng)進(jìn)化樹,綜合三個(gè)區(qū)域的分型結(jié)果分析基因型及其特征。結(jié)果分析樣本中擴(kuò)增陽(yáng)性的基因序列,結(jié)果表明至少存在5種不同的HIV-1亞型和重組模式,包括3種常見CRF01_AE(48.4%),CRF07/08_BC(24.1%),B/B'亞型(10.3%),以及罕見重組型CRF01_AE/CRF07_BC(6.9%)和CRF01_AE/B(10.3%);V3環(huán)頂端四肽分析發(fā)現(xiàn),共有五種類型的頂端四肽:GPGQ、GPGR、GPGG、GPGL和GPGP,主要以GPGQ為主(73.3%);輔助受體分析結(jié)果發(fā)現(xiàn),CRF01_AE亞型和CRF01_AE/B亞型的樣本中出現(xiàn)了預(yù)測(cè)為X4嗜性的毒株。結(jié)論北京地區(qū)MSM人群中29例HIV-1感染者病毒株遺傳多樣性高,來(lái)源復(fù)雜,且存在罕見CRF01_AE/CRF07_BC和CRF01_AE/B重組型,應(yīng)當(dāng)繼續(xù)加強(qiáng)HIV-1分子流行病學(xué)特征的監(jiān)測(cè)。
【作者單位】： 首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京地壇醫(yī)院傳染病研究所新發(fā)突發(fā)傳染病研究北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】：北京市醫(yī)院管理局“青苗”人才計(jì)劃(QML20151701)
【分類號(hào)】：R512.91
【正文快照】： 男男性行為人群(men who have sex with men,MSM)由于其特殊的高危性行為,已經(jīng)成為艾滋病(ac-quired immunodeficiency syndrome,AIDS)傳播的重要易感人群[1]。近年來(lái),北京市MSM人群中HIV感染率呈上升趨勢(shì)[2],同時(shí),由于HIV序列具有高度的變異性,在病毒傳播過(guò)程中可重組產(chǎn)生相，

本文編號(hào)：1251537