本文關(guān)鍵詞：伴HBV感染性肝癌調(diào)控樞紐基因篩選與初步鑒定

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【摘要】：慢性乙型肝炎病毒(Hepatitis B virus,HBV)感染引起的原發(fā)性肝癌涉及多種基因、轉(zhuǎn)錄本和蛋白質(zhì)的相互作用及調(diào)控。從單個基因的角度來看,某個基因的表達量的改變只能對肝癌發(fā)生發(fā)展的局部作出解釋而無法從整體行為進行深入和全面的探索,無法滿足高度復(fù)雜性的調(diào)控研究需要。篩選乙肝相關(guān)性肝癌的基因芯片數(shù)據(jù)獲取差異表達基因后,應(yīng)用加權(quán)基因共表達網(wǎng)絡(luò)分析算法構(gòu)建基因共表達網(wǎng)絡(luò),識別與肝癌發(fā)生相關(guān)的模塊,利用可視化篩選樞紐基因,并針對樞紐基因進行基因本體富集分析和初步驗證。富集分析和文獻挖掘一致發(fā)現(xiàn),某些樞紐基因確實與多種癌癥的發(fā)生與發(fā)展存在顯著的關(guān)聯(lián)。權(quán)重基因共表達網(wǎng)絡(luò)分析方法被證明是一個高效的系統(tǒng)生物學(xué)方法,應(yīng)用該方法發(fā)現(xiàn)了新的HBV相關(guān)性肝癌樞紐基因。經(jīng)實驗驗證,發(fā)現(xiàn)樞紐基因SHARPIN促進細胞遷移。該研究對肝癌發(fā)生的調(diào)控機制以及發(fā)現(xiàn)HBV慢性感染導(dǎo)致肝癌的新型診斷標志物和(或)藥物作用靶點提供了新的視野。
【作者單位】： 湖北工業(yè)大學(xué)中德生物醫(yī)學(xué)中心;
【關(guān)鍵詞】： 乙型肝炎病毒(HBV) HBV相關(guān)性肝癌 GO分析 WGCNA 共表達模塊 樞紐基因 SHARPIN
【基金】：湖北省自然科學(xué)基金重點項目(No.2014CFA075) 武漢市科技局應(yīng)用基礎(chǔ)研究項目(No.2015060101010033)
【分類號】：R735.7;R512.62
【正文快照】： 據(jù)普查資料顯示,肝癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)的年死亡率僅次于胃癌和肺癌,成為威脅人類健康的重要腫瘤疾病之一,而全球60%~80%的肝癌與乙肝病毒感染相關(guān)[1-3]。HCC表現(xiàn)出地理區(qū)域相關(guān)的差異特征,約占腫瘤的4%[4]。目前,應(yīng)用于臨床的抗肝癌藥物有限,分子機制的研究發(fā)展

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本文編號：1037240