本文關(guān)鍵詞：安徽省艾滋病重點(diǎn)監(jiān)測(cè)人群的HCV基因型分布特征調(diào)查

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【摘要】：目的闡明安徽省艾滋病重點(diǎn)監(jiān)測(cè)人群(DUS、MSM、FSW、STD、DRV、MPO、PRG、YST)的HCV基因型分布特征,分析并比較不同人群的HCV基因型分布是否存在差異;闡述安徽省HCV基因型在人群的性別、年齡和感染途徑等社會(huì)人口學(xué)特征中的分布差異性,為分析HCV傳播和流行提供科學(xué)依據(jù)。方法本研究采取橫斷面調(diào)查的方法,南北中共選取蕪湖、安慶、宿州、阜陽、合肥五個(gè)地級(jí)市為調(diào)查點(diǎn);根據(jù)全國艾滋病哨點(diǎn)監(jiān)測(cè)方案,在2012年至2014年4月1日-6月30日期間分別采用滾雪球(DUS和MSM)、分層比例抽樣和動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)(FSW)、動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)(STD、DRV、PRG)、網(wǎng)絡(luò)招募(MSM)和分階段整群抽樣(YST)5種不同抽樣方法對(duì)監(jiān)測(cè)人群進(jìn)行HCV抗體篩查。本研究蕪湖市共篩查6098人,抗-HCV陽性37人,從中收集樣本28份血清;安慶市共篩查4421人,抗-HCV陽性24人,從中收集樣本22份血清;宿州市共篩查2216人,抗-HCV陽性18人,從中收集樣本13份血清;阜陽市共篩查3784人,抗-HCV陽性48人,從中收集樣本35份血清;合肥市共篩查9700人,抗-HCV陽性291人,從中收集樣本265份血清。將2012-2014年全部HCV抗體陽性者共363份血清進(jìn)行RT-PCR檢測(cè),提取RNA并對(duì)其擴(kuò)增,擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行測(cè)序后用于基因比對(duì)及分型。所有監(jiān)測(cè)人群的招募對(duì)象在進(jìn)行知情同意后,進(jìn)行匿名問卷調(diào)查。另外,本研究還收集合肥和滁州醫(yī)院門診及住院病例抗-HCV陽性血漿進(jìn)行核酸檢測(cè),并對(duì)其基本信息進(jìn)行登記。血清學(xué)檢測(cè)包括HCVRNA的提取和擴(kuò)增;分子生物學(xué)包括HCV核酸擴(kuò)增產(chǎn)物測(cè)序和基因型分型。測(cè)定序列拼接使用Contig Express/Chromas Pro和Bio Edit軟件;基因型判別通過運(yùn)用Mega6.0的臨近法與Genbank中的標(biāo)準(zhǔn)株全基因序列比對(duì),共同構(gòu)建HCV NS5B和CE2區(qū)段系統(tǒng)進(jìn)化樹。調(diào)查資料運(yùn)用Epi Data 3.1建立數(shù)據(jù)庫,錄入數(shù)據(jù),采用SPSS17.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,統(tǒng)計(jì)分析方法主要包括頻數(shù)分布、正態(tài)性檢驗(yàn)、χ2檢驗(yàn)和方差分析。結(jié)果1.篩查艾滋病重點(diǎn)監(jiān)測(cè)人群共26219人,抗-HCV陽性共418人,其中DUS 1770人(抗-HCV陽性286人)、FSW 4648人(抗-HCV陽性39人)、STD4866人(抗-HCV陽性32人)、MSM 2871(抗-HCV陽性21人)、DRV 813人(抗-HCV陽性2人)、MPO 3209人(抗-HCV陽性23人)、PRG 4000人(抗-HCV陽性12人)、YST 4042人(抗-HCV陽性3人),抗體陽性率分別為16.16%(DUS)、0.84%(FSW)、0.66%(STD)、0.73%(MSM)、0.25%(DRV)、0.72%(MPO)、0.30%(PRG)和0.07%(YST)。本研究從中共收集363份血清,對(duì)各類人群HCV抗體陽性標(biāo)本進(jìn)行核酸檢測(cè),共檢出核酸陽性214份(DUS 152份、FSW 22份、STD 17份、MSM 9份、MPO 9份、PRG 4份和DRV 1份),YST未檢出HCV核酸陽性。核酸檢出率分別為57.36%(DUS)、70.59%(FSW)、76.19%(STD)、66.67%(MSM)、100%(DRV)、45.00%(MPO)、44.44%(PRG)和0.00%(YST)。所收集的16份抗-HCV陽性血漿,共檢出核酸8份。2.研究結(jié)果顯示,DUS人群中HCV單獨(dú)基因型共有八種,混合基因型三種,各型所占比例分別為:3b型39.47%、3a型21.71%、1b型11.84%、6n型9.21%、6a型6.58%、6u型3.29%、2a型2.63%和1a型0.66%,混合型1b/3b型和2a/3b型均占1.32%,3a/3b型占1.35%;FSW人群中HCV基因型共有五種,所占比例分別是1b型56.52%,6a型21.74%,3a型13.04%,2a和3b亞型,均為4.35%;MSM人群中有三種HCV基因型,1b型75.00%,2a和6a亞型具有相同比例,均占12.50%;STD人群中也檢出三種HCV基因型,各型所占比例分別為1b型70.59%,6a型23.53%和6n型5.88%;DRV人群中僅檢出1份HCV RNA陽性標(biāo)本,HCV基因型為1b亞型;MPO人群中檢出兩種HCV基因型,分別為1b型55.56%和2a型44.44%;PRG人群中共檢出4例,1a型2例,占50.00%,3a和6a各檢出1例,均占25.00%;GP人群中也檢出兩種HCV基因型,分別為1b型75.00%和2a型25.00%。研究中未發(fā)現(xiàn)4、5和7型三種基因型。3.正確HCV基因分型且性別資料明確的149份吸毒人群樣本中,男性100名,以3b型為主,其次為3a型,分別占38.00%和22.00%,6型和1型也占相當(dāng)大比例,分別為21.00%和15.00,混合型僅檢出1份;女性49名,也以3b型為主,3a型次之,所占比例分別為44.90%和22.45%,6型和混合型所占比例較小,分別為14.29%和10.20%。丙肝患者中男性3名,女性5名,以1b型(37.5%)為主,其次是2a(62.5%)型。由于研究例數(shù)限制及監(jiān)測(cè)人群的特點(diǎn),僅對(duì)吸毒人群(DUS)和丙型肝炎患者(GP)的157份樣本進(jìn)行HCV基因型的性別特征進(jìn)行匯總分析,經(jīng)確切概率檢驗(yàn),HCV基因型在兩種人群性別中的分布無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(F=9.589,P0.05)。4.吸毒人群HCV基因型在年齡上的分布特征表現(xiàn)為:45歲年齡組的不同HCV基因型所占的比例分別為3b型(37.21%)、3a(22.48%)、6型(20.16%)1型(13.18%)和混合型(4.65%),2a亞型所占比例最小(2.33%);≥45歲年齡組的HCV基因型所占的比例分別為,3b型(60.00%)、3a型(20.00%)、6型(10.00%)和1型(10.00%),混合基因型在該年齡組沒有檢出。HCV基因型在吸毒人群兩個(gè)年齡組中的總體分布差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=6.159,P0.05);但感染3型在兩年齡組中均有較高比例,混合基因型僅見于低年齡組。FSW、STD、MSM人群中小于45歲年齡組的HCV基因型分布以1b型為主(28份),其次為6型(10份);45歲及以上年齡組的HCV基因型只有1型(3份)和6型(1份),2型和3型在該年齡組中未檢測(cè)出。DRV、MPO、PRG和GP人群中小于45歲年齡組的HCV基因型分布以1b型(7份)為主,2a型次之(3份),3b型在該年齡組中未檢測(cè)出;45歲及以上年齡組的HCV基因型僅有1b(7份)和2a(3份)亞型,3型和6型在該年齡組中均未檢測(cè)出。以上分析可以看出,1型在除吸毒人群以外的7類人群的兩年齡組中均有較高比例;但6型僅在FSW、STD、MSM人群的兩年齡組有較高比例,且2型和3型在高年齡組中未檢測(cè)出;2a型僅在DRV、MPO、PRG和GP人群的兩年齡組中有較高比例,而3型和6型在高年齡組中均未檢測(cè)出。年齡(計(jì)量資料)滿足正態(tài)分布,平均年齡(35.4±9.46)歲,采用單因素方差分析,差異不具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(F=1.012,P0.05)。5.219份抗-HCV陽性人群中,68.04%有吸毒傳播史,21.92%為性傳播,10.05%來自其他感染途徑如輸血和其他不明原因的傳播路徑。經(jīng)確切概率檢驗(yàn),HCV基因型在不同感染途徑中的分布存在統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(F=98.046,P0.01)。吸毒途徑傳播中HCV基因型主要為3(3a/3b)型和6(6a/6n/6u),分別占62.42%和18.79%,其次是1型(1a/1b)(12.75%),2a型占有較小比例(2.01%);經(jīng)性接觸傳播包括FSW、MSM和STD人群,其HCV基因型分布以1型為主(64.58%),其次為6型(22.92%),2型和3型也占有一定比例,分別為4.17%和8.33%;其他感染途徑包括DRV、PRG、GP和MPO三類人群,主要為輸血和不明原因的傳播,其HCV基因型主要以1型(63.64%)和2型(27.27%)為主,3型(4.55%)和6型(4.55%)均占較小比例。6.HCV NS5B區(qū)測(cè)出216份序列,C/E2區(qū)測(cè)出178份,兩區(qū)同測(cè)出172份,165份樣本兩區(qū)測(cè)出分型結(jié)果一致,可以確定基因型,基因分型總體一致率為95.93%(165/172);7份兩區(qū)測(cè)出分型結(jié)果不一致,混合基因型分別為1b/3b混合型2份、3a/3b混合型3份和2a/3b混合型2份。結(jié)論安徽省艾滋病重點(diǎn)監(jiān)測(cè)人群中流行的HCV單獨(dú)基因亞型有1a、1b、2a、3a、3b、6a、6n和6u共8種,目前尚未見安徽省對(duì)1a型、3型、6型及混合型的文獻(xiàn)報(bào)道;本研究未發(fā)現(xiàn)4、5和7型三種基因型。不同人群中基因型分布具有明顯差異,DUS人群中主要流行的HCV基因型為3b型;性接觸人群(FSW、MSM、STD)中主要流行的基因型為1b型和6型(6a、6n和6u),其他人群(MPO、GP和DRV)中基因型分布主要為1b和2a亞型。HCV基因型的不同人群的性別無明顯差異,但其年齡差異較明顯,且不同感染途徑的基因型分布具有顯著差異。
【關(guān)鍵詞】：肝炎病毒 丙肝 高危人群 一般人群 基因型 基因分型
【學(xué)位授予單位】：安徽醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號(hào)】：R512.91
【目錄】：

• 中英文縮略詞表6-7
• 中文摘要7-11
• 英文摘要11-17
• 1 前言17-23
• 2 研究目的、對(duì)象和方法23-37
• 2.1 研究目的23
• 2.2 研究對(duì)象23-27
• 2.3 研究內(nèi)容27
• 2.4 研究方法與步驟27-31
• 2.5 基因分型及構(gòu)建進(jìn)化樹31-34
• 2.6 數(shù)據(jù)錄入及分析34-35
• 2.7 質(zhì)量控制35-36
• 2.8 技術(shù)路線圖36-37
• 3 研究結(jié)果37-50
• 3.1 艾滋病重點(diǎn)監(jiān)測(cè)人群檢測(cè)概況37-38
• 3.2 不同人群HCV基因型分布的流行病學(xué)特征38-48
• 3.3 HCV NS5B區(qū)與C/E2區(qū)基因分型結(jié)果比較48-50
• 4 討論50-54
• 5 結(jié)論54-55
• 參考文獻(xiàn)55-62
• 附錄62-63
• 致謝63-65
• 文獻(xiàn)綜述65-78
• 參考文獻(xiàn)71-78
• 附件178-103
• 附件2103

【參考文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前5條

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本文編號(hào)：1011507