調(diào)控人骨橋蛋白的miRNA預(yù)測(cè)研究
本文關(guān)鍵詞:調(diào)控人骨橋蛋白的miRNA預(yù)測(cè)研究
更多相關(guān)文章: 微小RNA 骨橋蛋白 生物信息學(xué) 靶基因預(yù)測(cè)
【摘要】:目的利用生物信息學(xué)方法預(yù)測(cè)調(diào)控人骨橋蛋白的微小RNA(miRNA),為進(jìn)一步實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證特定miRNA和人骨橋蛋白基因之間的關(guān)系提供依據(jù)。方法分別應(yīng)用miRGen Targets和miRanda數(shù)據(jù)庫(kù)確定與人骨橋蛋白有密切關(guān)系的miRNA分子。結(jié)果經(jīng)miRGen Targets數(shù)據(jù)庫(kù)預(yù)測(cè)出28個(gè)miRNA分子可能作用于人骨橋蛋白基因;miRanda數(shù)據(jù)庫(kù)顯示miR-539,miR-181,miR-340,miR-376c和miR-154 5個(gè)miRNAs在人骨橋蛋白的負(fù)調(diào)控過(guò)程可能發(fā)揮作用;將兩個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)結(jié)果交集后發(fā)現(xiàn)miR-539,miR-181,miR-33b和miR-377 4個(gè)miRNA分子最有可能參與調(diào)控人骨橋蛋白。結(jié)論利用生物信息學(xué)軟件可對(duì)調(diào)控人骨橋蛋白的miRNA進(jìn)行預(yù)測(cè),為研究骨橋蛋白的功能和生物學(xué)特性提供新手段。
【作者單位】: 包頭醫(yī)學(xué)院第一附屬醫(yī)院神經(jīng)外科;
【關(guān)鍵詞】: 微小RNA 骨橋蛋白 生物信息學(xué) 靶基因預(yù)測(cè)
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(81360164) 內(nèi)蒙古自然科學(xué)基金項(xiàng)目(2014MS0806)
【分類號(hào)】:R3416
【正文快照】: 骨橋蛋白(osteopontin,OPN)是1985年Franzen和Heinegard[1]從小牛長(zhǎng)骨分離出來(lái)的一種骨基質(zhì)蛋白。OPN在人體組織細(xì)胞中分布廣泛,特別是在骨的活躍沉積和礦化區(qū),且不同階段的成骨細(xì)胞均能合成和分泌OPN分子。OPN參與多種生理和病理過(guò)程[2]。OPN被認(rèn)為是成骨細(xì)胞成熟分化的標(biāo)志,
【相似文獻(xiàn)】
中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條
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,本文編號(hào):774831
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