本文關(guān)鍵詞：人巨細(xì)胞病毒US31基因序列特征分析及B細(xì)胞表位預(yù)測(cè)

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【摘要】：目的:分析人巨細(xì)胞病毒(HCMV)US31基因序列,預(yù)測(cè)US31基因編碼蛋白的B細(xì)胞優(yōu)勢(shì)表位。方法:基于US31基因編碼蛋白的氨基酸序列,結(jié)合親水性參數(shù)、可及性參數(shù)、抗原性參數(shù)、柔韌性參數(shù)及二級(jí)結(jié)構(gòu)方案對(duì)HCMV US31基因編碼各型蛋白的B細(xì)胞表位進(jìn)行預(yù)測(cè),參照已建立的預(yù)測(cè)方法綜合評(píng)價(jià)US31基因B細(xì)胞優(yōu)勢(shì)表位。結(jié)果:US31核苷酸序列變異較少,大部分是同義突變,氨基酸序列高度保守;其編碼蛋白全長(zhǎng)為162個(gè)氨基酸,相對(duì)分子質(zhì)量20 k D,等電點(diǎn)7.66,為可溶性蛋白,二級(jí)結(jié)構(gòu)中以無規(guī)則卷曲為主。經(jīng)綜合分析,US31基因的B細(xì)胞優(yōu)勢(shì)表位可能存在于氨基酸序列N端的5~19、32~47、58~68、110~124區(qū)段。結(jié)論:多參數(shù)預(yù)測(cè)HCMV p US31的B細(xì)胞優(yōu)勢(shì)表位,為進(jìn)一步研究蛋白特征、制備單克隆抗體及表位疫苗提供依據(jù)。
【作者單位】： 溫州醫(yī)科大學(xué)微生物學(xué)與免疫學(xué)教研室分子病毒與免疫研究所熱帶醫(yī)學(xué)研究所;溫州醫(yī)科大學(xué)第二臨床醫(yī)學(xué)院;溫州醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院胃腸外科;
【關(guān)鍵詞】： 人巨細(xì)胞病毒 US基因 B細(xì)胞表位
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(81472308,81672707) 浙江省大學(xué)生新苗計(jì)劃(2014R413058,2015R413069)
【分類號(hào)】：R373
【正文快照】： 2016-04-25人巨細(xì)胞病毒(human cytomegalovirus,HCMV)屬皰疹病毒科β亞科,為雙鏈DNA病毒,基因組全長(zhǎng)約230~240 kb,含208個(gè)開放讀碼框,由長(zhǎng)獨(dú)特序列(unique long domains,UL)和短獨(dú)特序列(uniqueshort domains,US)2個(gè)片段組成。US31基因是US1基因家族成員,5’端和3’端分別與U，

本文編號(hào)：629758