目的應用模擬表位策略研究柯薩奇病毒A組16型(Coxsackievirus A16,CA16)抗原表位。方法分別以具有中和活性的抗CA16單克隆抗體2C6、4F9、1D8為靶分子,在噬菌體12肽庫中淘選可與之特異性結合的陽性克隆,對淘選得到的陽性克隆進行序列測定和比對,并采用Phage ELISA法進行特異性鑒定。同時利用生物信息學方法對CA16衣殼蛋白理化性質(zhì)進行分析,并與陽性噬菌體多肽序列和結構進行比對,預測CA16中和抗原表位。結果經(jīng)噬菌體12肽庫篩選,單克隆抗體2C6、4F9、1D8淘選陽性噬菌體富集率分別為2.39×10³、1.32×10⁴和3.762×10,獲得可與單克隆抗體2C6、4F9、1D8結合的陽性克隆分別為10、11、6種,其中各組共有基序分別為K+X+WW和N/Q+S/T+Y/F/W、K+X+WW+D/E、T+X+P+W。Phage ELISA特異性鑒定陽性克隆肽CA1和CB1、FB3和FC3、DA1和DA2、DA5分別強特異性結合單克隆抗體2C6、4F9、1D8。經(jīng)計算機預測分析,確定了主要位于CA16 VP1 80...

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 主要試劑
    1.2 噬菌體肽庫的液相親和篩選
    1.3 陽性噬菌體克隆肽序列分析
    1.4 陽性噬菌體克隆的特異性鑒定
    1.5 CA16抗原中和表位分析
        1.5.1 CA16抗原蛋白分析
        1.5.2 CA16抗原表位預測
        1.5.3 CA16中和抗原表位定位
        1.5.4 可視化分析
2 結果
    2.1 噬菌體肽庫的液相親和淘選
    2.2陽性噬菌體克隆肽序列分析
    2.3 陽性噬菌體克隆的特異性鑒定
    2.4 CA16抗原中和表位分析
        2.4.1 CA16抗原蛋白分析
        2.4.2 CA16抗原表位預測
        2.4.3 CA16中和抗原表位定位
        2.4.4 可視化分析
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