分枝桿菌噬菌體Guo1環(huán)狀基因組特征及生物學(xué)特性分析
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【摘要】:【目的】初步研究分枝桿菌噬菌體Guo1環(huán)狀基因組特征及生物學(xué)特性�!痉椒ā坎捎螟B槍法和重疊群組裝策略完成Guo1全基因組測(cè)序;使用DNAStar、t RNAscan-SE、Promoter predictions、TRF、Glimmer、BLAST軟件分別對(duì)噬菌體的一般基因組學(xué)特征、t RNA、啟動(dòng)子、串聯(lián)重復(fù)序列和編碼基因進(jìn)行分析;運(yùn)用BLAST軟件檢索與Guo1基因組相似的噬菌體并構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,推斷Guo1的分群;測(cè)定最佳感染復(fù)數(shù)、一步生長(zhǎng)曲線以及對(duì)紫外線、氯仿、酒精、溫度、p H的敏感性�!窘Y(jié)果】噬菌體Guo1的基因組為全長(zhǎng)40 086 nt的環(huán)狀雙鏈DNA,屬于G群分枝桿菌噬菌體;含有59個(gè)推定基因,7個(gè)啟動(dòng)子序列和3個(gè)串聯(lián)重復(fù)序列;Guo1對(duì)紫外線有較強(qiáng)抵抗性,對(duì)酒精、氯仿和高溫敏感,最適溫度為37°C,最適p H為7.0,最佳感染復(fù)數(shù)為0.01,潛伏期120 min,裂解期120 min,裂解量為47個(gè)�!窘Y(jié)論】Guo1是首次發(fā)現(xiàn)的具有環(huán)狀雙鏈DNA結(jié)構(gòu)的G群分枝桿菌噬菌體,完成了Guo1的全基因組測(cè)序,并初步分析了Guo1的基因組特征和生物學(xué)特性。
【作者單位】: 重慶醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院呼吸與危重癥醫(yī)學(xué)科;
【關(guān)鍵詞】: Guo 分枝桿菌噬菌體G群 環(huán)狀基因組 生物學(xué)特性
【基金】:國(guó)家“十二五”重大專項(xiàng)課題(No.2012ZX10003-009) 國(guó)家臨床重點(diǎn)�?茖m�(xiàng)經(jīng)費(fèi)資助項(xiàng)目(No.衛(wèi)辦醫(yī)政函[2012]649號(hào))
【分類號(hào)】:Q93
【正文快照】: 2012年WHO公布的疫情顯示:2011年全球新增結(jié)核病人900萬,值得注意的是印度和中國(guó)的耐藥結(jié)核占到全世界的60%[1],我國(guó)也是全球第二大結(jié)核病高負(fù)擔(dān)國(guó)家,發(fā)病人數(shù)一直位于甲、乙類傳染病前列[2]。結(jié)核病治療面臨著易復(fù)發(fā)和病程遷延兩大難題,臨床上常采用長(zhǎng)療程化療來徹底清除結(jié)核
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本文編號(hào):323059
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