反向斑點雜交技術快速檢測結(jié)核分枝桿菌八種藥物耐藥性的研究
本文關鍵詞:反向斑點雜交技術快速檢測結(jié)核分枝桿菌八種藥物耐藥性的研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:耐藥結(jié)核病尤其是耐多藥結(jié)核病(multi-drug resistant tuberculosis,MDR-TB,)及廣泛耐藥結(jié)核病(extensively drug resistant tuberculosis,XDR-TB,)的出現(xiàn)和流行成為了全球重點關注的公共衛(wèi)生問題及社會問題。長期以來,以細菌培養(yǎng)為基礎的傳統(tǒng)藥敏試驗被視為金標準廣泛應用于臨床,但其耗時長,結(jié)核病患者在初期得不到及時有效的治療而延誤病情。新興的分子生物學方法在部分一線抗結(jié)核藥物中已經(jīng)取得了良好的檢測效果,幾乎可以與表型藥敏試驗相媲美,但它們需要特殊的儀器試劑,且在二線藥物檢測中應用較少。而反向斑點雜交(Reverse dot blot hybridization,RDBH)是一種基于基因擴增上的分子雜交技術,具有快速、簡便、高效、直觀等特點。本研究旨在建立一種能同時檢測結(jié)核分枝桿菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)對四種一線和四種二線抗結(jié)核藥物耐藥性的RDBH技術,以實現(xiàn)耐藥結(jié)核病的全面快速檢測,為有效防治耐藥結(jié)核病提供新的技術手段。分別針對結(jié)核分枝桿菌八種藥物,包括四種一線抗結(jié)核藥抗結(jié)核藥異煙肼(Isoniazid,INH)、利福平(Rifampicin,RIF)、鏈霉素(Streptomycin,SM)、乙胺丁醇(Ethambutol,EMB)和四種二線抗結(jié)核藥氧氟沙星(Ofloxacin,OFX)、卡那霉素(Kanamycin,KAN)、阿米卡星(Amikacin,AMK)、卷曲霉素(Capreomycin,CPM),主要耐藥相關基因及常見的突變位點,設計合成46條氨基標記的特異性寡核苷酸探針。通過小樣本試驗優(yōu)化RDBH技術條件,建立RDBH技術,并對326株和170株MTB臨床分離株分別進行一線、二線抗結(jié)核藥物耐藥性檢測,采用比例法藥敏試驗和DNA測序結(jié)果作對照,初步評價該技術的檢測效能。經(jīng)過實驗條件的反復優(yōu)化,最終確定了探針序列、探針終濃度為0.5?M、雜交鹽離子濃度為5×SSPE/0.1%SDS、最適雜交溫度60℃、洗膜溫度50℃、POD-TMB為顯色體系。同時應用比例法藥敏試驗、DNA測序和RDBH技術分別對326株和170株MTB臨床分離株進行了INH、RIF、SM、EMB四種一線抗結(jié)核藥物和OFX、KAN、AMK、CPM四種二線抗結(jié)核藥物的耐藥性檢測,以比例法作參照,RDBH檢測INH、RIF、SM、EMB、OFX、KAN、AMK和CPM的敏感度分別為84.5%(185/219)、86.5%(166/192)、72.3%(120/166)、55.4%(51/92)、62.8%(59/94)、56.0%(14/25)、61.5%(8/13)和45.0%(9/20);特異度分別為95.3%(102/107)、95.5%(128/134)、91.3%(146/160)、82.1%(192/234)、100.0%(76/76)、100.0%(145/145)、98.7%(155/157)和99.3%(149/150);Kappa值分別為0.75、0.80、0.63、0.37、0.60、0.68、0.57和0.37;以DNA測序為為參照,八種藥物耐藥性檢出率分別為97.9%(189/193)、97.7%(171/175)、97.8%(134/137)、82.0%(91/111)和93.7%(59/63)、92.9%(13/14)、90.0%(9/10)、90.0%(9/10);特異度分別為99.2%(132/133)、97.4%(148/152)、100.0%(189/189)、99.1%(213/215)和100.0%(107/107)、99.4%(155/156)、99.4%(159/160)、99.4%(159/160);Kappa值分別為0.97、0.96、0.98、0.84、0.95、0.92、0.89和0.89。本研究建立的反向斑點雜交技術對結(jié)核分枝桿菌八種藥物的耐藥性具有良好檢測效果,為開發(fā)快速檢測耐藥性試劑盒奠定基礎,在結(jié)核病一、二線八種抗結(jié)核藥物耐藥性檢測和監(jiān)測上具有良好的應用前景。
【關鍵詞】:結(jié)核分枝桿菌 反向斑點雜交技術 耐藥性 耐藥相關基因
【學位授予單位】:南華大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2015
【分類號】:R378.911
【目錄】:
- 摘要4-7
- ABSTRACT7-12
- 縮略詞12-14
- 第1章 緒論14-18
- 第2章 材料與方法18-34
- 2.1 實驗材料18-21
- 2.2 實驗方法21-34
- 第3章 結(jié)果34-66
- 3.1 反向斑點雜交技術檢測結(jié)核分枝桿菌耐藥性條件的建立與優(yōu)化34-40
- 3.2 一線抗結(jié)核藥物耐藥性試驗檢測結(jié)果40-55
- 3.3 二線抗結(jié)核藥物耐藥性試驗檢測結(jié)果55-66
- 第4章 討論66-76
- 4.1 目前MTB藥物敏感性試驗方法比較分析66
- 4.2 反向斑點雜交技術檢測MTB耐藥性條件優(yōu)化66-67
- 4.3 反向斑點雜交技術快速檢測結(jié)核分枝桿菌一線藥物耐藥性67-71
- 4.4 反向斑點雜交技術快速檢測結(jié)核分枝桿菌二線藥物耐藥性71-76
- 第5章 結(jié)論76-78
- 參考文獻78-84
- 文獻綜述84-96
- 參考文獻92-96
- 作者攻讀學位期間的科研成果96-97
- 資助本論文的科研項目97-98
- 致謝98
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5 金法祥 ,李水法;紹興市甲型副傷寒沙門菌耐藥性檢測[J];醫(yī)學文選;2001年05期
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8 應英;海島漁民甲型副傷寒沙門菌耐藥性監(jiān)測[J];江西醫(yī)學檢驗;2005年02期
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4 葉衛(wèi)紅;劉翠銀;;268例革蘭陰性桿菌肺炎的病原菌分布及耐藥性監(jiān)測[A];湖北省暨武漢市微生物學會分析微生物專業(yè)委員會第十屆第五次學術會議論文匯編[C];2008年
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