采用藥物生物信息學(xué)方法探討生姜防治2019年新型冠狀病毒疾�。–OVID-19）的作用機(jī)制。以生姜3種活性成分（6-姜辣素、8-姜酚和10-姜酚）為研究對(duì)象,采用化學(xué)相似性搜索方法預(yù)測(cè)潛在作用靶蛋白,同時(shí)采用人工數(shù)據(jù)挖掘病毒性肺炎疾病相關(guān)蛋白,并用String 11.0構(gòu)建蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)。由交集獲得生姜活性治療病毒性肺炎疾病的核心靶蛋白,通過(guò)Omicshare和DAVID數(shù)據(jù)庫(kù)分別對(duì)核心靶蛋白的基因本體富集和KEGG通路分析,采用Cytoscape構(gòu)建生姜"活性成分-靶點(diǎn)-通路"網(wǎng)絡(luò)圖。結(jié)果顯示,生姜活性成分涉及168個(gè)靶點(diǎn),病毒性肺炎疾病相關(guān)蛋白有253個(gè)。由交集獲得的18個(gè)核心靶蛋白與生姜防治病毒性肺炎相關(guān)。GO富集分析表明核心蛋白作用與炎癥反應(yīng)和免疫調(diào)節(jié)、細(xì)胞因子介導(dǎo)受體等有關(guān)。核心靶蛋白參與的KEGG通路有21條,涉及病毒感染、趨化因子通路和眾多癌癥通路等。研究結(jié)果表明生姜活性成分是通過(guò)多靶點(diǎn)和多通路對(duì)機(jī)體起整體調(diào)控作用。本研究為生姜防控COVID-19提供理論依據(jù),也為飲食調(diào)理提供參考。 

【文章來(lái)源】：中國(guó)食品學(xué)報(bào). 2020,20(12)北大核心EICSCD

【文章頁(yè)數(shù)】：9 頁(yè)

【部分圖文】：

活性成分的預(yù)測(cè)靶蛋白分布餅圖

圖1 活性成分的預(yù)測(cè)靶蛋白分布餅圖在Drug Bank數(shù)據(jù)庫(kù)中分別查到小分子藥物丁螺環(huán)酮（Buspirone），齊留通（Ziltuton）和甲潑尼龍（Methylprednisolone）可分別作用于HTR1A,ALOX5和HSD11B1蛋白。將這3個(gè)小分子藥物的SMILE化學(xué)結(jié)構(gòu)上傳到Swiss Target Prediction進(jìn)行預(yù)測(cè)，可發(fā)現(xiàn)目標(biāo)蛋白在預(yù)測(cè)結(jié)果中分別排第4位，第1位和第13位（表2），說(shuō)明Swiss Target Prediction方法學(xué)具有較高的準(zhǔn)確性。

以“viral pneumonia”為關(guān)鍵詞，從CTD數(shù)據(jù)庫(kù)中檢索并審核得到34個(gè)病毒性肺炎疾病相關(guān)蛋白集。同樣從Gene Card數(shù)據(jù)庫(kù)中檢索到4 078個(gè)原始數(shù)據(jù)，為提高準(zhǔn)確度和減少工作量，本研究以相關(guān)性得分>15篩選并刪掉重復(fù)值等，確定239個(gè)疾病相關(guān)蛋白集。這2個(gè)蛋白集合并，最終獲得253個(gè)與病毒性肺炎疾病相關(guān)的蛋白。這253個(gè)構(gòu)成了一個(gè)非常復(fù)雜的蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)（圖2）。表3列有其涉及到的前10種生物過(guò)程，均與免疫系統(tǒng)調(diào)節(jié)和細(xì)胞因子反應(yīng)等密切相關(guān)。2.3 生姜活性成分防治病毒性肺炎的靶點(diǎn)確認(rèn)

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]Molecular immune pathogenesis and diagnosis of COVID-19[J]. Xiaowei Li,Manman Geng,Yizhao Peng,Liesu Meng,Shemin Lu.  Journal of Pharmaceutical Analysis. 2020(02)
[2]新型冠狀病毒肺炎防治中的辛開(kāi)苦降之法[J]. 龐穩(wěn)泰,張立雙,楊豐文,黃明,鄭文科,張俊華,張伯禮.  中華中醫(yī)藥學(xué)刊. 2020(03)
[3]新型冠狀病毒肺炎中醫(yī)病理研究[J]. 張?jiān)骑w,趙鵬飛,沈體雁.  中醫(yī)學(xué)報(bào). 2020(04)
[4]中藥預(yù)防新型冠狀病毒肺炎策略與分析[J]. 倪力強(qiáng),陶弘武,楊小林,張杰,倪行健.  中華中醫(yī)藥學(xué)刊. 2020(04)
[5]基于數(shù)據(jù)挖掘的《瘟疫論》《廣瘟疫論》用藥規(guī)律分析[J]. 王賽,白明,苗明三.  中藥藥理與臨床. 2020(02)
[6]抗新型冠狀病毒方劑基于花生四烯酸代謝通路防治“細(xì)胞因子風(fēng)暴”的研究[J]. 任越,姚美村,霍曉乾,谷宇,朱衛(wèi)星,喬延江,張燕玲.  中國(guó)中藥雜志. 2020(06)
[7]張伯禮：中醫(yī)藥在防治新型冠狀病毒肺炎全過(guò)程發(fā)揮作用[J]. 高樹明,馬英,楊豐文,張俊華,于春泉.  天津中醫(yī)藥. 2020(02)
[8]中醫(yī)藥防治新型冠狀病毒肺炎方證規(guī)律分析[J]. 龐穩(wěn)泰,金鑫瑤,龐博,楊豐文,王輝,劉春香,鄭文科,張俊華.  中國(guó)中藥雜志. 2020(06)
[9]基于Mpro和PLP篩選潛在抗新型冠狀病毒中藥研究[J]. 馬婧,霍曉乾,陳茜,朱衛(wèi)星,姚美村,喬延江,張燕玲.  中國(guó)中藥雜志. 2020(06)
[10]基于臨床經(jīng)驗(yàn)和分子對(duì)接技術(shù)的抗新型冠狀病毒中醫(yī)組方快速篩選模式及應(yīng)用[J]. 牛明,王睿林,王仲霞,張萍,柏兆方,景婧,郭玉明,趙旭,湛小燕,張子騰,宋雪艾,秦恩強(qiáng),王伽伯,肖小河.  中國(guó)中藥雜志. 2020(06)



本文編號(hào)：3580750