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基于PCR-DGGE分析宣威火腿的細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)

發(fā)布時間:2021-09-03 19:37
  以不同加工年份(1年、2年和3年)的宣威火腿為對象,采用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)-變性梯度凝膠電泳(polymerase chain reaction-denaturing gradient gel electrophorsis,PCR-DGGE)技術(shù),通過PCR擴增、優(yōu)勢條帶切膠、克隆測序等研究不同加工年份宣威火腿表面及內(nèi)部的細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)及多樣性,為進一步研究宣威火腿品質(zhì)提供理論依據(jù)。結(jié)果表明:馬胃葡萄球菌、木糖葡萄球菌、表皮葡萄球菌、戊糖葡萄球菌等葡萄球菌屬以及嗜鹽四聯(lián)球菌、變異微球菌等是宣威火腿中的主要細(xì)菌,其中葡萄球菌屬和嗜鹽四聯(lián)球菌分別為宣威火腿中的優(yōu)勢菌屬與優(yōu)勢菌種;宣威火腿中還檢測出了未培養(yǎng)細(xì)菌。多樣性分析表明,加工3年的宣威火腿表面細(xì)菌群落多樣性最高,加工1年火腿表面細(xì)菌群落多樣性最低。加工3年火腿內(nèi)部細(xì)菌群落多樣性最高,加工2年火腿內(nèi)部細(xì)菌群落多樣性最低。 

【文章來源】:食品研究與開發(fā). 2020,41(23)北大核心

【文章頁數(shù)】:7 頁

【部分圖文】:

基于PCR-DGGE分析宣威火腿的細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)


宣威火腿樣品細(xì)菌DNA電泳圖

火腿,宣威,細(xì)菌,樣品


宣威火腿樣品細(xì)菌組16S r DNA的PCR擴增結(jié)果見圖2。以GC-338F和518R為引物,從不同加工年份宣威火腿的表面和內(nèi)部6個樣品中提取的總DNA為模板進行16S r DNA片段擴增,得到200 bp的DNA片段(圖2),所有樣品條帶清晰,符合DGGE分析。

示意圖,火腿,宣威,圖譜


用DGGE圖譜中條帶數(shù)來反映細(xì)菌多樣性,泳道中各條帶均代表一種不同的細(xì)菌,條帶亮度用來反映細(xì)菌的豐富度[16]。由圖3和圖4可以看出,明顯分離的條帶有40條,顯示出宣威火腿中豐富的細(xì)菌種類,其中1年腿表面有16個主要條帶,內(nèi)部有16個;2年腿表面有23個,內(nèi)部有15個;3年腿表面有29個,內(nèi)部有22個,多數(shù)條帶為每個泳道共有,說明有共有的細(xì)菌類型存在于不同加工年份宣威火腿表面和內(nèi)部。另外共有條帶的亮度也存在一定的差異,說明其中細(xì)菌群落數(shù)量存在差異。圖4 宣威火腿樣品的DGGE條帶強度示意圖

【參考文獻】:
期刊論文
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博士論文
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碩士論文
[1]飼養(yǎng)密度對籠養(yǎng)蛋雞小腸組織結(jié)構(gòu)和盲腸細(xì)菌種群的影響[D]. 趙乾宇.黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué) 2015



本文編號:3381735

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