TNFSF15基因單核苷酸多態(tài)性及其表達與原發(fā)性膽汁性膽管炎的關(guān)聯(lián)性研究
發(fā)布時間:2021-08-09 03:27
目的:本研究擬探索人腫瘤壞死因子樣配體1A(TNF-like ligand 1A,TL1A)的水平及腫瘤壞死因子超家族15(tumor necrosis factor superfamily 15,TNFSF15)基因單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism,SNP)與原發(fā)性膽汁性膽管炎(primary biliary cholangitis,PBC)發(fā)病的關(guān)系,并對關(guān)聯(lián)分析陽性的SNP位點進行功能預(yù)測,以期為今后篩查PBC高危人群及發(fā)現(xiàn)新的治療靶點提供線索。方法:1、收集PBC患者和健康對照者外周靜脈血,分離血漿和血細胞,密度梯度離心法分離外周血單個核細胞(Peripheral Blood Mononuclear Cell,PBMC),提取基因組DNA和RNA。2、酶聯(lián)免疫吸附試驗(enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA)檢測健康對照者和PBC患者外周血血漿TL1A的水平。3、實時熒光定量PCR檢測PBC患者和健康對照者PBMC中TNFSF15基因mRNA的相對表達量。4、篩選目標SNP位點。應(yīng)用Sanger...
【文章來源】:遵義醫(yī)科大學(xué)貴州省
【文章頁數(shù)】:68 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
線性免疫印跡法檢測結(jié)果示意圖
遵義醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文高琪28圖(a)圖(b)注:圖(a)為ELISA檢測TL1A柱狀圖,圖(b)為TL1A的標準曲線。圖2-2ELISA檢測各實驗組血漿中TL1A結(jié)果Fig2-2TheresultsofTL1AexpressionlevelinplasmabythemethodofELISA2.3.2應(yīng)用ROC曲線評估血漿TL1A水平預(yù)測PBC的價值應(yīng)用受試者工作特征曲線(receiveroperatingcharacteristiccurve,ROC)計算曲線下面積,評價血漿TL1A濃度水平預(yù)測PBC的價值。血漿TL1A濃度水平預(yù)測PBC的ROC曲線下面積為0.838,大于機會參考下面積(P<0.05),說明血漿TL1A水平對于診斷PBC具有顯著的意義且具有一定的準確性,ROC曲線圖見圖2-3。圖2-3血漿TL1A水平預(yù)測PBC的ROC曲線Fig2-3TheROCcurveofPlasmaTL1AlevelpredictsofPBC2.4TNFSF15基因mRNA的相對表達2.4.1總RNA的濃度、純度及完整性
遵義醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文高琪29瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果顯示:28S、18S和5S條帶清晰且28S和18S亮度比約為2:1,結(jié)果如圖2-4。微量核酸檢測分光光度計檢測結(jié)果顯示:所有RNA樣本的A260/A280比值在1.9~2.1,濃度在60~200ng/μl,表明RNA的純度、濃度和完整性較好。圖2-4RNA瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果Fig2-4TheresultsofagarosegelelectrophoresisofRNA2.4.2TNFSF15基因和內(nèi)參基因的擴增曲線及熔解曲線擴增曲線的CT值在15~35之間,曲線拐點清楚,整體平行性好。熔解曲線為一單一峰,表明反應(yīng)無特異性擴增。結(jié)果見下圖2-5。注:圖A為TNFSF15基因和GAPDH內(nèi)參基因擴增曲線;圖B為TNFSF15基因和GAPDH內(nèi)參基因熔解曲線。圖2-5擴增曲線、熔解曲線Fig2-5Amplificationcurve,meltingcurve2.4.3實時熒光定量PCR結(jié)果PBC組TNFSF15基因mRNA的相對表達量高于健康對照組2.975倍,兩組間差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05),結(jié)果見表2-4和圖2-6所示。AB28S18S5SGAPDHTNFSF15TNFSF15GAPDH
本文編號:3331267
【文章來源】:遵義醫(yī)科大學(xué)貴州省
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【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
線性免疫印跡法檢測結(jié)果示意圖
遵義醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文高琪28圖(a)圖(b)注:圖(a)為ELISA檢測TL1A柱狀圖,圖(b)為TL1A的標準曲線。圖2-2ELISA檢測各實驗組血漿中TL1A結(jié)果Fig2-2TheresultsofTL1AexpressionlevelinplasmabythemethodofELISA2.3.2應(yīng)用ROC曲線評估血漿TL1A水平預(yù)測PBC的價值應(yīng)用受試者工作特征曲線(receiveroperatingcharacteristiccurve,ROC)計算曲線下面積,評價血漿TL1A濃度水平預(yù)測PBC的價值。血漿TL1A濃度水平預(yù)測PBC的ROC曲線下面積為0.838,大于機會參考下面積(P<0.05),說明血漿TL1A水平對于診斷PBC具有顯著的意義且具有一定的準確性,ROC曲線圖見圖2-3。圖2-3血漿TL1A水平預(yù)測PBC的ROC曲線Fig2-3TheROCcurveofPlasmaTL1AlevelpredictsofPBC2.4TNFSF15基因mRNA的相對表達2.4.1總RNA的濃度、純度及完整性
遵義醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文高琪29瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果顯示:28S、18S和5S條帶清晰且28S和18S亮度比約為2:1,結(jié)果如圖2-4。微量核酸檢測分光光度計檢測結(jié)果顯示:所有RNA樣本的A260/A280比值在1.9~2.1,濃度在60~200ng/μl,表明RNA的純度、濃度和完整性較好。圖2-4RNA瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果Fig2-4TheresultsofagarosegelelectrophoresisofRNA2.4.2TNFSF15基因和內(nèi)參基因的擴增曲線及熔解曲線擴增曲線的CT值在15~35之間,曲線拐點清楚,整體平行性好。熔解曲線為一單一峰,表明反應(yīng)無特異性擴增。結(jié)果見下圖2-5。注:圖A為TNFSF15基因和GAPDH內(nèi)參基因擴增曲線;圖B為TNFSF15基因和GAPDH內(nèi)參基因熔解曲線。圖2-5擴增曲線、熔解曲線Fig2-5Amplificationcurve,meltingcurve2.4.3實時熒光定量PCR結(jié)果PBC組TNFSF15基因mRNA的相對表達量高于健康對照組2.975倍,兩組間差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05),結(jié)果見表2-4和圖2-6所示。AB28S18S5SGAPDHTNFSF15TNFSF15GAPDH
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