基于磁共振多參數(shù)成像的影像組學(xué)模型預(yù)測肺腺癌表皮生長因子受體基因突變狀態(tài)的臨床研究
發(fā)布時間:2021-03-31 07:35
目的通過前瞻性選取92例肺腺癌患者并統(tǒng)計(jì)其臨床資料及影像學(xué)征象,篩選與肺腺癌表皮生長因子受體(EGFR)基因突變狀態(tài)相關(guān)的臨床預(yù)測因素及影像征象,比較基于T2WI、DWI、ADC的影像組學(xué)模型及聯(lián)合臨床因素的列線圖對術(shù)前預(yù)測肺腺癌EGFR突變狀態(tài)的價值。方法前瞻性選取2015年11月至2019年9月經(jīng)病理證實(shí)的肺腺癌患者92例,其中男53例,女39例,年齡27~79歲,平均57.65±10.90歲;EGFR突變型51例,未突變型41例,臨床分期:I期34例,II期14例,III期20例,IV期24例,所有患者在術(shù)前一周內(nèi)均行胸部MRI掃描,掃描序列包括T2WI序列、EPI-DWI(b=0、800s/mm2)序列并生成相應(yīng)的ADC圖。統(tǒng)計(jì)92例患者的臨床資料包括:年齡、性別、吸煙史、臨床分期、術(shù)前1周內(nèi)癌胚抗原,糖類抗原125及糖類抗原153;統(tǒng)計(jì)92例患者的MRI影像學(xué)征象包括:腫瘤所在的分葉,腫瘤最大徑線,分葉征,毛刺征,胸膜凹陷征及ADC值。應(yīng)用SPSS統(tǒng)計(jì)軟件分別對EGFR突變型和EGFR未突變型型兩組患者的臨床資料和影像學(xué)征象進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,篩選與肺腺癌EG...
【文章來源】:廣州醫(yī)科大學(xué)廣東省
【文章頁數(shù)】:69 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
肺腺癌患者病灶ROI放置示意圖
材料與方法15七、數(shù)據(jù)規(guī)范化整理及圖像預(yù)處理(1)數(shù)據(jù)規(guī)范化整理:所有病例的原始數(shù)據(jù)(DICOM)放在一個文件夾;所有勾畫的ROI單獨(dú)放在一個文件夾(命名一一對應(yīng)),勾畫的ROI保存為“命名_Merge.nii”,壓縮文件格式(后綴為.gz)需要在ITK-SNAP里面進(jìn)行解壓縮,為了后面處理數(shù)據(jù)可以快速讓患者臨床指標(biāo)與組學(xué)特征對應(yīng)上,為每例患者進(jìn)行編號。(2)圖像預(yù)處理(圖2,3):將所有病例的原始圖像及分割的腫瘤ROI文件(.nii格式)導(dǎo)入美國GE公司AK軟件(ArtificialIntelligentKit,A.K.),在預(yù)處理模塊(ImagePreprocessing)中選擇如下參數(shù):MR模態(tài)重采樣(Resample):X-Spacing、Y-Spacing、Z-Spacing均設(shè)定為1.000mm,強(qiáng)度歸一化(IntensityStandardization)中:GrayLevelDiscretization:DesiredMinimum:0.0,DesiredMaximum:255.0;GreyDiscretization:64。圖2:AK軟件MRI圖像預(yù)處理模塊界面。
廣州醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文16圖3:圖a、b、c為T2WI、DWI及ADC序列預(yù)處理前的圖像,圖d、e、f為T2WI、DWI及ADC序列預(yù)處理后的圖像。八、影像組學(xué)特征提取將預(yù)處理后的圖像和相應(yīng)的ROI導(dǎo)入AK分析軟件并選擇直方圖特征(Histogram)、形態(tài)學(xué)特征(FormFactorFeatures)、灰度共生矩陣(GLCM)、Haralick特征、灰度游程矩陣(GLRLM)、灰度連通區(qū)域矩陣(GLSZM)6大類特征參數(shù)進(jìn)行特征提齲每個病例的每個序列共提取了396個圖像特征,包括42個直方圖特征、9個形態(tài)特征、144個GLCM特征、10個Haralick特征、180個GLRLM特征和11個GLSZM特征(圖4)。圖4:AK軟件特征參數(shù)選擇界面。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]CT影像組學(xué)特征預(yù)測晚期肺腺癌表皮生長因子受體突變狀態(tài)及表皮生長因子受體酪氨酸激酶抑制劑治療敏感性的效能[J]. 楊春生,陳衛(wèi)東,鞏貫忠,李振江,仇清濤,尹勇. 中華腫瘤雜志. 2019 (04)
[2]非小細(xì)胞肺癌EGFR基因少見突變及靶向治療進(jìn)展[J]. 王鴦,李敏,胡成平. 中華醫(yī)學(xué)雜志. 2019 (02)
[3]CT影像組學(xué)在非小細(xì)胞肺癌臨床分期中的價值[J]. 何蘭,黃燕琪,馬澤蘭,梁翠珊,黃曉媚,程梓軒,梁長虹,劉再毅. 中華放射學(xué)雜志. 2017 (12)
[4]定量影像學(xué)在肺癌放/化療療效評估中的應(yīng)用[J]. 焦玉新,任艷萍,鄭向鵬. 中國肺癌雜志. 2017(06)
[5]表觀彌散系數(shù)與非小細(xì)胞肺癌預(yù)后分子生物學(xué)指標(biāo)的相關(guān)性分析[J]. 張丹,陳康,譙智慧,謝兵,陳偉,熊瑋. 第三軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報. 2017(09)
[6]基于文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)的近5年放射組學(xué)研究熱點(diǎn)分析[J]. 王敏,宋彬,黃子星,胡富碧,陳婕. 中華放射學(xué)雜志. 2016 (12)
[7]肺癌CT影像學(xué)征象與EGFR基因突變相關(guān)性的研究進(jìn)展[J]. 劉穎,葉兆祥. 臨床放射學(xué)雜志. 2015(10)
本文編號:3111059
【文章來源】:廣州醫(yī)科大學(xué)廣東省
【文章頁數(shù)】:69 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
肺腺癌患者病灶ROI放置示意圖
材料與方法15七、數(shù)據(jù)規(guī)范化整理及圖像預(yù)處理(1)數(shù)據(jù)規(guī)范化整理:所有病例的原始數(shù)據(jù)(DICOM)放在一個文件夾;所有勾畫的ROI單獨(dú)放在一個文件夾(命名一一對應(yīng)),勾畫的ROI保存為“命名_Merge.nii”,壓縮文件格式(后綴為.gz)需要在ITK-SNAP里面進(jìn)行解壓縮,為了后面處理數(shù)據(jù)可以快速讓患者臨床指標(biāo)與組學(xué)特征對應(yīng)上,為每例患者進(jìn)行編號。(2)圖像預(yù)處理(圖2,3):將所有病例的原始圖像及分割的腫瘤ROI文件(.nii格式)導(dǎo)入美國GE公司AK軟件(ArtificialIntelligentKit,A.K.),在預(yù)處理模塊(ImagePreprocessing)中選擇如下參數(shù):MR模態(tài)重采樣(Resample):X-Spacing、Y-Spacing、Z-Spacing均設(shè)定為1.000mm,強(qiáng)度歸一化(IntensityStandardization)中:GrayLevelDiscretization:DesiredMinimum:0.0,DesiredMaximum:255.0;GreyDiscretization:64。圖2:AK軟件MRI圖像預(yù)處理模塊界面。
廣州醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文16圖3:圖a、b、c為T2WI、DWI及ADC序列預(yù)處理前的圖像,圖d、e、f為T2WI、DWI及ADC序列預(yù)處理后的圖像。八、影像組學(xué)特征提取將預(yù)處理后的圖像和相應(yīng)的ROI導(dǎo)入AK分析軟件并選擇直方圖特征(Histogram)、形態(tài)學(xué)特征(FormFactorFeatures)、灰度共生矩陣(GLCM)、Haralick特征、灰度游程矩陣(GLRLM)、灰度連通區(qū)域矩陣(GLSZM)6大類特征參數(shù)進(jìn)行特征提齲每個病例的每個序列共提取了396個圖像特征,包括42個直方圖特征、9個形態(tài)特征、144個GLCM特征、10個Haralick特征、180個GLRLM特征和11個GLSZM特征(圖4)。圖4:AK軟件特征參數(shù)選擇界面。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]CT影像組學(xué)特征預(yù)測晚期肺腺癌表皮生長因子受體突變狀態(tài)及表皮生長因子受體酪氨酸激酶抑制劑治療敏感性的效能[J]. 楊春生,陳衛(wèi)東,鞏貫忠,李振江,仇清濤,尹勇. 中華腫瘤雜志. 2019 (04)
[2]非小細(xì)胞肺癌EGFR基因少見突變及靶向治療進(jìn)展[J]. 王鴦,李敏,胡成平. 中華醫(yī)學(xué)雜志. 2019 (02)
[3]CT影像組學(xué)在非小細(xì)胞肺癌臨床分期中的價值[J]. 何蘭,黃燕琪,馬澤蘭,梁翠珊,黃曉媚,程梓軒,梁長虹,劉再毅. 中華放射學(xué)雜志. 2017 (12)
[4]定量影像學(xué)在肺癌放/化療療效評估中的應(yīng)用[J]. 焦玉新,任艷萍,鄭向鵬. 中國肺癌雜志. 2017(06)
[5]表觀彌散系數(shù)與非小細(xì)胞肺癌預(yù)后分子生物學(xué)指標(biāo)的相關(guān)性分析[J]. 張丹,陳康,譙智慧,謝兵,陳偉,熊瑋. 第三軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報. 2017(09)
[6]基于文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)的近5年放射組學(xué)研究熱點(diǎn)分析[J]. 王敏,宋彬,黃子星,胡富碧,陳婕. 中華放射學(xué)雜志. 2016 (12)
[7]肺癌CT影像學(xué)征象與EGFR基因突變相關(guān)性的研究進(jìn)展[J]. 劉穎,葉兆祥. 臨床放射學(xué)雜志. 2015(10)
本文編號:3111059
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