本文關(guān)鍵詞：一色齒毛菌錳過氧化物酶2基因克隆及生物信息學(xué)分析

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【摘要】：錳過氧化物酶(manganese peroxidase,Mn P)是由一系列同功酶組成的木質(zhì)素降解酶。我們前期工作克隆了一色齒毛菌(Cerrena unicolor)Mn P1基因序列。在此基礎(chǔ)上,本研究采用簡(jiǎn)并PCR、染色體步移和RACE等技術(shù)對(duì)C.unicolor mnp2基因(Cu-mnp2)序列進(jìn)行克隆。同時(shí),采用生物信息學(xué)軟件對(duì)Cu-mnp2的基因結(jié)構(gòu)、Cu-Mn P2的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)及多物種Mn Ps蛋白質(zhì)序列的系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系進(jìn)行分析�？寺〉玫�3 053 bp的Cu-mnp2 DNA序列(Gen Bank:JX270806.1)和1 429 bp的Cu-mnp2 c DNA序列(Gen Bank:JQ782580.1)。序列分析結(jié)果顯示,Cu-mnp2 DNA序列包含14個(gè)外顯子和13個(gè)內(nèi)含子,啟動(dòng)子區(qū)域包含TATA-BOX、SP1和AP1等作用元件;Cu-mnp2 c DNA序列包含71 bp的5'UTR、230 bp的3'UTR以及1 128 bp的開放閱讀框(ORF)。Cu-mnp2 ORF序列的BLAST比對(duì)結(jié)果表明,Cu-mnp2與Trametes versicolor FP-101664 SS1 mnp序列覆蓋度為53%,序列相似性為65%;與Heterobasidion irregulare mnp、C.unicolor mnp1等c DNA序列都有較高的序列相似性。Cu-mnp2的ORF編碼(Gen Bank:AFK91530.1)由340個(gè)氨基酸殘基組成的多肽鏈(CuMn P2)。Cu-Mn P2蛋白質(zhì)序列的BLAST比對(duì)和蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)均顯示,Cu-Mn P2包含Mn2+、Ga2+、血紅素及芳香底物結(jié)合位點(diǎn)。對(duì)包含Cu-Mn P1、Cu-Mn P2蛋白質(zhì)序列在內(nèi)的多物種Mn Ps蛋白質(zhì)序列的系統(tǒng)發(fā)育分析表明,多物種的Mn Ps分為兩大類群,分別為包含4個(gè)二硫鍵的短Mn Ps和包含5個(gè)二硫鍵的長(zhǎng)Mn Ps。其中,Cu-Mn P1與Cu-Mn P2均屬于短Mn Ps,Cu-Mn P2與Trametes versicolor Mr P的蛋白質(zhì)序列親緣關(guān)系最近。通過Cu-mnp2基因的克隆和序列分析,對(duì)繼續(xù)研究C.uniclor的Mn P同工酶基因結(jié)構(gòu)和功能奠定基礎(chǔ)。
【作者單位】： 貴州大學(xué)林學(xué)院;東北林業(yè)大學(xué)林學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】： 一色齒毛菌 錳過氧化物酶 染色體步移 c DNA末端快速擴(kuò)增(RACE) 生物信息學(xué)
【基金】：貴州大學(xué)引進(jìn)人才項(xiàng)目(貴大人基合字(2015)No.67)資助~~
【分類號(hào)】：Q78;Q55
【正文快照】： 貴州大學(xué)引進(jìn)人才項(xiàng)目(貴大人基合字(2015)No.67)資助*聯(lián)系人Tel:18285193278;E-mail:chifengyucun@163.comReceived:August 27,2016;Revised:September 29,2016;Accepted:October 10,2016Supported by Guizhou University Project Introduction of Talent((2015)No.67)*Corre

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本文編號(hào)：991829