發(fā)布時間：2017-10-08 04:00

  本文關鍵詞：一色齒毛菌錳過氧化物酶2基因克隆及生物信息學分析

  更多相關文章： 一色齒毛菌 錳過氧化物酶 染色體步移 c DNA末端快速擴增(RACE) 生物信息學

【摘要】：錳過氧化物酶(manganese peroxidase,Mn P)是由一系列同功酶組成的木質(zhì)素降解酶。我們前期工作克隆了一色齒毛菌(Cerrena unicolor)Mn P1基因序列。在此基礎上,本研究采用簡并PCR、染色體步移和RACE等技術對C.unicolor mnp2基因(Cu-mnp2)序列進行克隆。同時,采用生物信息學軟件對Cu-mnp2的基因結構、Cu-Mn P2的蛋白質(zhì)結構及多物種Mn Ps蛋白質(zhì)序列的系統(tǒng)進化關系進行分析�？寺〉玫�3 053 bp的Cu-mnp2 DNA序列(Gen Bank:JX270806.1)和1 429 bp的Cu-mnp2 c DNA序列(Gen Bank:JQ782580.1)。序列分析結果顯示,Cu-mnp2 DNA序列包含14個外顯子和13個內(nèi)含子,啟動子區(qū)域包含TATA-BOX、SP1和AP1等作用元件;Cu-mnp2 c DNA序列包含71 bp的5'UTR、230 bp的3'UTR以及1 128 bp的開放閱讀框(ORF)。Cu-mnp2 ORF序列的BLAST比對結果表明,Cu-mnp2與Trametes versicolor FP-101664 SS1 mnp序列覆蓋度為53%,序列相似性為65%;與Heterobasidion irregulare mnp、C.unicolor mnp1等c DNA序列都有較高的序列相似性。Cu-mnp2的ORF編碼(Gen Bank:AFK91530.1)由340個氨基酸殘基組成的多肽鏈(CuMn P2)。Cu-Mn P2蛋白質(zhì)序列的BLAST比對和蛋白質(zhì)三維結構均顯示,Cu-Mn P2包含Mn2+、Ga2+、血紅素及芳香底物結合位點。對包含Cu-Mn P1、Cu-Mn P2蛋白質(zhì)序列在內(nèi)的多物種Mn Ps蛋白質(zhì)序列的系統(tǒng)發(fā)育分析表明,多物種的Mn Ps分為兩大類群,分別為包含4個二硫鍵的短Mn Ps和包含5個二硫鍵的長Mn Ps。其中,Cu-Mn P1與Cu-Mn P2均屬于短Mn Ps,Cu-Mn P2與Trametes versicolor Mr P的蛋白質(zhì)序列親緣關系最近。通過Cu-mnp2基因的克隆和序列分析,對繼續(xù)研究C.uniclor的Mn P同工酶基因結構和功能奠定基礎。
【作者單位】： 貴州大學林學院;東北林業(yè)大學林學院;
【關鍵詞】： 一色齒毛菌 錳過氧化物酶 染色體步移 c DNA末端快速擴增(RACE) 生物信息學
【基金】：貴州大學引進人才項目(貴大人基合字(2015)No.67)資助~~
【分類號】：Q78;Q55
【正文快照】： 貴州大學引進人才項目(貴大人基合字(2015)No.67)資助*聯(lián)系人Tel:18285193278;E-mail:chifengyucun@163.comReceived:August 27,2016;Revised:September 29,2016;Accepted:October 10,2016Supported by Guizhou University Project Introduction of Talent((2015)No.67)*Corre

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本文編號：991829