GATA轉(zhuǎn)錄因子普遍存在于真核生物中,它參與一些重要的生物學過程,例如,在植物光響應調(diào)控、細胞分裂素響應、抵抗生物脅迫及非生物脅迫、葉綠素合成以及碳、氮代謝等扮演著重要的角色,這些生物學過程與作物產(chǎn)量密切相關。在其他生物中有關于GATA轉(zhuǎn)錄因子的報道很多,然而在番茄中有關GATA轉(zhuǎn)錄因子的分析較少。所以本研究旨在對番茄中GATA轉(zhuǎn)錄因子進行全面的挖掘鑒定,通過生物信息學分析明確家族基因相關特征,對番茄抗逆相關的家族成員進行篩選鑒定,并對部分抗逆應答顯著的基因進行功能驗證。旨在為番茄抗逆基因的研究和利用奠定基礎。具體結(jié)果如下:(1)本研究通過生物信息學的手段,鑒定獲得了30個番茄GATA轉(zhuǎn)錄因子家族成員。這些家族成員被分為4個亞族。其中大部分成員結(jié)構保守。染色體定位分析表明,番茄GATA轉(zhuǎn)錄因子在番茄12條染色體上均有分布,但數(shù)量不同。(2)對第I亞族的14個番茄GATA成員進行了的組織特異性表達模式分析。結(jié)果顯示,這些基因在番茄的各個組織中表達是有差異的。同一基因在不同組織中的表達量不同,不同基因在同一組織中的表達量也不相同。例如,SlGATA11基因幾乎僅在花中表達。(3)本研究選取...

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【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖3-1番茄、擬南芥GATA蛋白家族系統(tǒng)進化樹

族按照系統(tǒng)進化樹分類的結(jié)果命名，其中番茄的GATA轉(zhuǎn)錄因子家族成員在各個體分布情況如下：I（14個），分別為SlGATA2、SlGATA6、SlGATA7、SlGATA9、SATA12、SlGATA13、SlGATA15、SlGATA17、SlGATA19、SlGATA2....

圖3-2番茄GATA蛋白家族的保守結(jié)構域序列比對Fig.3-2ComparisonofconserveddomainsequencesofGATAproteinfamilyintomato3.1.4番茄GATA蛋白家族的保守序列分析和基因結(jié)構分析

部分氨基酸位點是保守的，如，His-9，Met-20，Arg-22，Gly-26，Pro-27，Arg-28，Leu-，第IV亞族中的氨基酸位點保守性較好,如Gly-5，Pro-6，Tyr-8，His-9，Gly-11，Val-1hr-13，Ser-14，Leu-19，Tr....

圖3-3番茄GATA基因家族保守元件分析

圖3-3番茄GATA基因家族保守元件分析Fig.3-3AnalysisofconservedmotifsofGATAgenefamilyintomato番茄GATA第I亞族內(nèi)含子的個數(shù)在1（SlGATA2、SlGATA6、SlGATA9、S....

圖3-4番茄GATA基因家族基因結(jié)構分析

圖3-4番茄GATA基因家族基因結(jié)構分析Fig.3-4GeneticstructureanalysisofGATAgenefamilyintomato3.1.5番茄GATA基因家族染色體定位分析通過染色體定位圖發(fā)現(xiàn)（圖3-5），在番茄12個....

本文編號：4004593