蘇云金芽胞桿菌轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子CodY的體外靶基因的篩選
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更多相關(guān)文章: CodY 靶基因 Avi-tag技術(shù) 蘇云金芽胞桿菌 生物素 調(diào)控
【摘要】:【目的】利用Avi-tag和Pulldown技術(shù)建立體外靶基因篩選的新方法,在蘇云金芽胞桿菌YBT-1520基因組范圍內(nèi)進行體外高通量篩選轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子CodY的靶基因,為深入研究CodY在蘇云金芽胞桿菌中的功能及調(diào)控網(wǎng)絡(luò)打下基礎(chǔ)。【方法】用Avi-tag技術(shù)對CodY蛋白進行體外生物素標記,酶切蘇云金芽胞桿菌YBT-1520總DNA并在兩端加上便于測序的adapter序列,用鏈霉親和素樹脂篩選與CodY蛋白相互作用的靶基因!窘Y(jié)果】在蘇云金芽胞桿菌中得到了46條CodY可以直接作用的靶序列,分析發(fā)現(xiàn)CodY在蘇云金芽胞桿菌中主要調(diào)控氨基酸代謝、糖代謝、脂肪酸代謝、轉(zhuǎn)運、調(diào)控、DNA修復(fù)、雙組份調(diào)控等的轉(zhuǎn)錄。【結(jié)論】本研究采用的Avi-tag技術(shù)具有特異性強、操作簡單、成本低等優(yōu)勢,為轉(zhuǎn)錄因子體外靶序列的高通量篩選提供新的方法;蘇云金芽胞桿菌中CodY靶基因的篩選為其他微生物中CodY的功能研究打下基礎(chǔ)。
【作者單位】: 華中農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)技術(shù)學(xué)院農(nóng)業(yè)微生物學(xué)國家重點實驗室;
【關(guān)鍵詞】: CodY 靶基因 Avi-tag技術(shù) 蘇云金芽胞桿菌 生物素 調(diào)控
【基金】:國家自然科學(xué)基金(30900016) 湖北省自然科學(xué)基金(2014CFB931)~~
【分類號】:Q933
【正文快照】: 蘇云金芽胞桿菌(Bacillus thuringiensis,簡稱轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子3 4][。研究發(fā)現(xiàn)蘇云金芽胞桿菌Bt)是桿狀、革蘭氏陽性菌,在細胞穩(wěn)定期產(chǎn)芽胞cod Y突變株不能形成完整的芽胞和伴胞晶體,和殺蟲晶體蛋白(Insecticidal crystal proteins,Cod Y蛋白作為全局性轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子在Bt中主要調(diào)
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本文編號:967068
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