本文關鍵詞：基因功能富集分析的研究進展

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【摘要】：基因功能的富集分析已成為高通量組學數(shù)據分析的常規(guī)手段,對于揭示生物醫(yī)學分子機制具有重要意義.目前已有上百種基因功能富集分析的方法和工具.根據所解決的問題和算法的原理,這些方法可大體分為過代表分析、功能集打分、基于通路拓撲結構和基于網絡拓撲結構4大類.本文對這4大類方法的原理及其中的典型方法進行了綜述,并討論了基因功能富集分析結果的冗余性問題及建立標準數(shù)據集的必要性.
【作者單位】： 復旦大學生命科學學院生物統(tǒng)計學與計算生物學系;復旦大學附屬兒科醫(yī)院;
【關鍵詞】： 組學數(shù)據 功能富集 冗余性 標準數(shù)據集
【基金】：國家自然科學基金(批準號:91231116,31071113,30971643) 國家重點基礎研究發(fā)展計劃(批準號:2012CB316505,2010CB529505)資助
【分類號】：Q811.4
【正文快照】： 隨著高通量測序技術的飛速發(fā)展及相關技術的廣泛應用,生物醫(yī)學相關研究領域已進入了大規(guī)模組學數(shù)據呈指數(shù)增長的后基因組時代[1].一方面,這使得生物醫(yī)學研究得以從單個基因的分析轉變?yōu)橄到y(tǒng)水平上的研究,對于揭示生物醫(yī)學的基本分子機制具有重要推動作用.但另一方面,如此龐大

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