本文關(guān)鍵詞：巴西橡膠樹CCaMK基因家族成員的鑒定和表達(dá)分析

  更多相關(guān)文章： 巴西橡膠樹 CCaMK 基因家族 結(jié)構(gòu)與進(jìn)化 表達(dá)分析

【摘要】：鈣/鈣調(diào)素依賴型蛋白激酶(CCa MK,calcium-and calmodulin-dependent protein kinase)是一種鈣離子結(jié)合蛋白,在鈣信號傳導(dǎo)過程中起重要作用。本研究以已發(fā)表的CCa MK序列作為檢索序列,對橡膠樹和其他5種植物(木薯、水稻、楊樹、蓖麻和擬南芥)的基因組和轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進(jìn)行全面搜索,鑒定得到6個CCa MK基因,其中包括一個橡膠樹CCa MK基因,命名為Hb CCa MK1。序列分析發(fā)現(xiàn):5種植物的CCa MK氨基酸序列同源性較高,為73%~94%�；蚪Y(jié)構(gòu)分析發(fā)現(xiàn),Hb CCa MK1和所分析的其他植物CCa MK一樣均,含有6個內(nèi)含子、1個蛋白激酶結(jié)構(gòu)域和3個EF-hand結(jié)構(gòu)域;從結(jié)構(gòu)和進(jìn)化上看,Hb CCa MK1和蓖麻、木薯2種植物的CCa MK具有較近的親緣關(guān)系;在表達(dá)方面,Hb CCa MK1在橡膠樹根中表達(dá)豐度最高,其次為樹葉和花;另外,Hb CCa MK1的表達(dá)還與葉片發(fā)育、真菌侵染和低溫脅迫有關(guān)。
【作者單位】： 中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院橡膠研究所;海南大學(xué)農(nóng)學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】： 巴西橡膠樹 CCaMK 基因家族 結(jié)構(gòu)與進(jìn)化 表達(dá)分析
【基金】：國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(No.31400565)
【分類號】：S794.1
【正文快照】： 所有生物都依賴于復(fù)雜的信號傳遞網(wǎng)絡(luò)來調(diào)控自身代謝和對環(huán)境的適應(yīng)性。在眾多信號傳遞途徑中,鈣離子作為細(xì)胞內(nèi)第二信使發(fā)揮著重要作用[1-3]。一些鈣離子感受器或鈣離子結(jié)合蛋白能夠識別瞬間2肖小虎(1982~),男,博士,主要研究方向?yàn)橹参锓肿由飳W(xué)。3通訊作者,E-mail:chaorong

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1 林秀琴;鄧軍;袁坤;王真輝;楊禮富;;巴西橡膠樹葉片蛋白樣品的制備及質(zhì)譜初步分析[J];熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué);2009年04期

2 李輝亮;郭冬;彭世清;;巴西橡膠樹14-3-3蛋白基因的克隆及表達(dá)分析[J];熱帶作物學(xué)報;2010年09期

3 陳鑫;朱家紅;張治禮;;巴西橡膠樹鈣調(diào)蛋白基因的克隆及表達(dá)分析[J];中國農(nóng)學(xué)通報;2011年22期

4 趙平娟;安鋒;林位夫;謝貴水;莫業(yè)勇;;大力開展巴西橡膠樹替代產(chǎn)膠植物及技術(shù)研發(fā)的建議[J];中國農(nóng)學(xué)通報;2012年34期

5 劉金河;巴西橡膠樹的水分狀況與生長和產(chǎn)膠量的關(guān)系[J];生態(tài)學(xué)報;1982年03期

6 F·Halle;吳繼林;郝秉中;;巴西橡膠樹的生長節(jié)奏[J];熱帶作物譯叢;1983年05期

7 ;《熱帶作物研究》1993年總目錄 Ⅰ.巴西橡膠樹[J];熱帶作物研究;1993年04期

8 周鐘毓;對我國“九五”巴西橡膠樹育種工程研究的設(shè)想[J];云南熱作科技;1995年04期

9 劉世彪,林位夫,郝秉中;巴西橡膠樹不同高度導(dǎo)管的結(jié)構(gòu)特征及其對嫁接樹導(dǎo)管結(jié)構(gòu)的影響[J];熱帶作物學(xué)報;2000年04期

10 劉世彪,林位夫;巴西橡膠樹生長和導(dǎo)管結(jié)構(gòu)與橡膠產(chǎn)量的關(guān)系[J];熱帶作物學(xué)報;2002年03期

中國重要會議論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 羅雪華;鄒碧霞;吳菊群;楊俐蘋;;氮素對巴西橡膠樹花藥苗生長及氮代謝、光合作用的影響[A];中國植物營養(yǎng)與肥料學(xué)會2010年學(xué)術(shù)年會論文集[C];2010年

2 史敏晶;吳繼林;郝秉中;譚海燕;田維敏;;巴西橡膠樹樹皮單寧細(xì)胞結(jié)構(gòu)和發(fā)育的研究[A];生態(tài)文明建設(shè)中的植物學(xué)：現(xiàn)在與未來——中國植物學(xué)會第十五屆會員代表大會暨八十周年學(xué)術(shù)年會論文集——第3分會場：植物分子生物學(xué)與基因組學(xué)[C];2013年

3 陳學(xué)俊;王英;高和瓊;莊南生;;巴西橡膠樹單染色體微克隆文庫的構(gòu)建及鑒定[A];中國作物學(xué)會2013年學(xué)術(shù)年會論文摘要集[C];2013年

4 劉世彪;林位夫;郝秉中;吳繼林;胡正海;;巴西橡膠樹嫁接接合區(qū)接穗和砧木徑向生長差異的研究[A];中國植物學(xué)會七十周年年會論文摘要匯編（1933—2003）[C];2003年

5 王立豐;;光差異調(diào)控巴西橡膠樹茉莉酸信號途徑和橡膠生物合成關(guān)鍵酶的基因表達(dá)[A];第八屆全國光生物學(xué)學(xué)術(shù)會議論文摘要集[C];2013年

6 李惠波;周堂英;;橡膠樹新品種云研77-2和云研77-4的細(xì)胞學(xué)鑒定及育種歷程總結(jié)[A];云南省熱帶作物學(xué)會第七次代表大會暨2009年學(xué)術(shù)年會會議材料[C];2009年

7 邱海燕;王英;高和瓊;莊南生;;巴西橡膠樹橡膠延長因子(REF)基因的原位PCR物理定位[A];2012年中國作物學(xué)會學(xué)術(shù)年會論文摘要集[C];2012年

8 官錦燕;王英;高和瓊;莊南生;;巴西橡膠樹SUT家族部分基因物理定位的研究[A];中國作物學(xué)會2013年學(xué)術(shù)年會論文摘要集[C];2013年

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10 高佳佳;王英;高和瓊;莊南生;;巴西橡膠樹膠乳轉(zhuǎn)化酶基因HbNIN1和HbNIN2物理定位的研究[A];中國作物學(xué)會2013年學(xué)術(shù)年會論文摘要集[C];2013年

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1 鄧柳紅;巴西橡膠樹膠乳特異表達(dá)基因分離與克隆[D];華南熱帶農(nóng)業(yè)大學(xué);2004年

2 張云霞;巴西橡膠樹HbMyb1調(diào)控基因的克隆及表達(dá)[D];華南熱帶農(nóng)業(yè)大學(xué);2005年

3 周s，

本文編號：950493