美洲水貂刺鼠信號蛋白基因SNPs檢測及其與毛色表型的關(guān)聯(lián)分析
發(fā)布時(shí)間:2017-09-29 09:17
本文關(guān)鍵詞:美洲水貂刺鼠信號蛋白基因SNPs檢測及其與毛色表型的關(guān)聯(lián)分析
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【摘要】:旨在檢測刺鼠信號蛋白(Agouti signaling protein,Agouti)基因外顯子2、內(nèi)含子2、外顯子3及部分內(nèi)含子3的單核苷酸多態(tài)性(Single nucleotide polymorphisms,SNPs)在不同毛色美洲水貂群體中的分布,探討該基因變異與水貂被毛顏色表型的相關(guān)性。以金州黑水貂、吉林白水貂、銀藍(lán)水貂、咖啡水貂和珍珠色水貂共計(jì)430個(gè)樣本的血液基因組DNA為模板,采用PCR擴(kuò)增和Sanger雙脫氧鏈終止測序技術(shù),對Agouti基因序列進(jìn)行SNPs檢測,并將突變位點(diǎn)與水貂毛色表型進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析。結(jié)果表明,獲得的美洲水貂Agouti基因長度為2 510bp,內(nèi)含子2存在4個(gè)SNPs:g.18GA、g.159AG、g.235GT和g.1189CT,部分內(nèi)含子3檢測到6個(gè)SNPs:g.252CT、g.290AC、g.298GC、g.340AG、g.343TC和g.379TC,在外顯子2和3區(qū)域并未檢測到SNPs位點(diǎn)。關(guān)聯(lián)分析表明,Agouti基因7個(gè)SNPs(內(nèi)含子2:g.1189CT;內(nèi)含子3:g.252CT、g.290AC、g.298GC、g.340AG、g.343TC和g.379TC)位點(diǎn)的基因型均與水貂毛色表型極顯著相關(guān)(P0.000 1),且部分內(nèi)含子3中的5個(gè)SNPs位點(diǎn)(g.290AC、g.298GC、g.340AG、g.343TC和g.379TC)可能處于緊密連鎖狀態(tài)。研究結(jié)果初步表明,Agouti基因可能是影響美洲水貂被毛顏色的候選基因或與決定毛色性狀主效基因相連鎖的分子標(biāo)記。
【作者單位】: 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院特產(chǎn)研究所吉林省特種經(jīng)濟(jì)動物分子生物學(xué)省部共建國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】: 美洲水貂 Agouti基因 毛色表型 單核苷酸多態(tài)性 關(guān)聯(lián)分析
【基金】:國家重點(diǎn)基礎(chǔ)研究發(fā)展計(jì)劃-973項(xiàng)目(2012CB722907) 水貂優(yōu)良種質(zhì)資源及選育技術(shù)引進(jìn)-948項(xiàng)目(2014-Z8)
【分類號】:S865.22
【正文快照】: 哺乳動物皮膚、被毛的顏色和鳥類的羽色是一種重要的質(zhì)量性狀,也是動物形態(tài)選擇、品種歸屬識別及鑒定的重要依據(jù)之一[1]。野生美洲水貂(Neo-vison vison)全身被毛一致,呈深褐色,在家養(yǎng)條件下稱為標(biāo)準(zhǔn)貂,彩色水貂是深褐色標(biāo)準(zhǔn)貂的突變型,目前已出現(xiàn)30多個(gè)毛色突變基因(包括復(fù)等
【相似文獻(xiàn)】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前4條
1 李彤;美洲水貂體溫調(diào)節(jié)的發(fā)育[J];毛皮動物飼養(yǎng);1983年02期
2 ;產(chǎn)地信息[J];農(nóng)技服務(wù);1998年06期
3 夏式X&;;致初學(xué)養(yǎng)貂者[J];山西農(nóng)業(yè)科學(xué);1982年04期
4 ;[J];;年期
,本文編號:941214
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