PON1基因多態(tài)性與人類長壽、CHD相關(guān)性研究
發(fā)布時間:2017-09-29 07:47
本文關(guān)鍵詞:PON1基因多態(tài)性與人類長壽、CHD相關(guān)性研究
更多相關(guān)文章: PON1 TNF-α IL-6 人類長壽 meta分析 PON1 rs854560 單核苷酸多態(tài)性 冠心病
【摘要】:目的探討PON1 rs662.rs854560.TNF-αrs1800629.IL-6 rs1800795位點多態(tài)性與人類長壽相關(guān)性,為衰老分子機制研究及治療衰老相關(guān)疾病提供遺傳學(xué)依據(jù)。方法通過檢索網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫里關(guān)于PON1.IL-6.TNF-a基因多態(tài)性與長壽相關(guān)性的病例對照文獻數(shù)據(jù),統(tǒng)計PON1 rs662.rs854560.IL-6 rs1 800795.TNF-a rs1 800629位點的基因型及基因頻率,采用Meta分析軟件包Stata/SE軟件9.0,計算OR值及95% CI置信區(qū)間,分層分析候選基因多態(tài)性與長壽的相關(guān)性。結(jié)果對PON1 rs662加性隨機效應(yīng)模型合并,OR=1.080,95%CI=0.989.1.179, P=0.088;顯性隨機效應(yīng)模型合并,OR=1.099,95%CI=0.975.1.240,P=0.124;隱性固定效應(yīng)模型合并,RR vs.QQ+RQ合并計算后OR=1.102,95%CI=0.947-1.283,P=0.210;在提高長壽標(biāo)準(zhǔn)(≥93)情況下,加性隨機效應(yīng)模型合并,OR=1.025, 95%CI=0.939-1.119, P=0.580;顯性隨機效應(yīng)模型合并,OR=1.034,95% CI=0.904-1.182,P=0.625;隱性固定效應(yīng)模型合并,OR=1.044,95%CI=0.880-1.239, P=0.622.對PON 1 rs854560加性隨機效應(yīng)模型合并,OR=0.946,95%CI=0.746-1.200,P=0.245;顯性隨機效應(yīng)模型合并,OR=0.951,95%CI=0.836-1.08l,P=0.442;隱性固定效應(yīng)模型合并,OR=0.887,95%CI=0.731-1.077,P=0.225;在提高長壽標(biāo)準(zhǔn)(≥93)情況下,加性隨機效應(yīng)模型合并,OR=1.071,95%CI=0.951-0.845,P=0.408;顯性固定效應(yīng)模型合并OR=0.977,95%CI=0.830-1.151,P=0.783;隱性隨機效應(yīng)模型合并,OR=0.839,95%CI=0.612-1.152,P=0.278。對TNF-a rs1800629加性固定效應(yīng)模型合并,OR=0.98,95%CI=0.79-1.22,P=0.852;顯性固定效應(yīng)模型合并,O R=0.97,95%CI=0.75.1.24,P=0.791:隱性固定效應(yīng)模型合并,OR=1.061,95%CI=0.507-2.217,P=0.876;隱性固定效應(yīng)模型合并,OR=1.061,95%CI=0.507-2.217,P=0.876;在提高長壽標(biāo)準(zhǔn)(≥90)情況下,加性固定效應(yīng)模型合并,OR=0.920,95%CI=0.699-1.211,P=0.554;顯性隨機效應(yīng)模型合并,OR=0.899,95%CI=0.661-1.222,P=0.496;隱性隨機效應(yīng)模型合并,OR=1.069,95%CI=0.297-3.844,P=0.918:性別亞組分層下,男性(≥80),加性固定效應(yīng)模型合并,OR=0.930,95%CI=0.580-1.480,P=0.792;顯性隨機效應(yīng)模型合并,OR=0.928,95%CI=0.578-1.490,P=0.758;隱性隨機效應(yīng)模型合并,OR=1.312,95%CI=0.266-6.482,P=0.739。對IL-6 rs1800795加性隨機效應(yīng)模型合并,OR=1.068,95%CI=0.918-1.243,P=0.396;顯性隨機效應(yīng)模型合并,OR=1.089,95%CI=0.929-1.277,P=0.292;隱性隨機效應(yīng)模型合并,OR=1.026.95%CI=0.818-1.288,P=0.824;在提高長壽標(biāo)準(zhǔn)(≥90)情況下,顯性隨機效應(yīng)模型合并,OR=1.097,95%CI=0.842-1.427,P=0.494;性別亞組分層下,男性(≥80歲),顯性隨機效應(yīng)模型合并,OR=1.083,95%CI =0.803-1.460, P=0.601;分層分析女性組,長壽標(biāo)準(zhǔn)(≥80),顯性隨機效應(yīng)模型合并,OR:1.156,95%CI=0.932-1.434,P=0.187;分層分析,長壽標(biāo)準(zhǔn)(≥100),加性隨機效應(yīng)模型合并,OR=1.244,95%CI=0.998-1.550,P=0.052;顯性隨機效應(yīng)模型合并,OR=1.276,95%CI=0.941-1.732,P=0.117;隱性隨機效應(yīng)模型合并,OR=1.511, 95%CI=0.864-2.641,P=0.148;分層分析男性組,長壽標(biāo)準(zhǔn)(≥100),顯性隨機效應(yīng)模型合并計算后OR=0.70,95%CI=0.35-1.38,P=0.30;性別民族年齡亞亞組中,意大利男性(≥100),OR=2.02,95%CI=1.25-3.26,P=0.004。結(jié)論PON 1 rs662.rs854560.TNF-a rs 1800629及IL-6 rs1800795多態(tài)性與白種人群長壽相關(guān)性并不顯著,但IL-6 rs1800795多態(tài)性與意大利民族男性長壽顯著相關(guān)(P=0.004).這一研究結(jié)果可能受基因與基因以及環(huán)境的交互影響,其他因素包括性別、地理梯度、地理位置、地中海飲食習(xí)慣、運動鍛煉也能調(diào)控人類達到極限壽命,闡釋PON 1 rs662.rs854560.TNF-a rs 1800629及IL-6 rs 1800795多態(tài)性與長壽的關(guān)系需要更多研究數(shù)據(jù)去進一步論證。目的探討云南地區(qū)人群PON1基因rs854560位點多態(tài)性與冠心病(CHD)相關(guān)性,為冠心病的早期診斷及治療提供遺傳學(xué)依據(jù)。方法分別收集云南地區(qū)CHD病人及健康人血樣131例和305例。提取DNA,采用基質(zhì)輔助激光解吸附電離飛行時間質(zhì)譜分析技術(shù)進行分型檢測,運用SPSS 20.0軟件包分析PON1基因rs854560位點多態(tài)性與CHD發(fā)病風(fēng)險的相關(guān)性,并進一步針對吸煙人群和糖尿病人群進行分層分析。結(jié)果1.首先采用Logistic回歸分析PON1 rs854560基因多態(tài)性與冠心病發(fā)病風(fēng)險的相關(guān)性。研究表明,PON1 rs854560 位點 LM vs.LL, OR=1.049, 95% CI=0.477-2.295, P=0.881:MM vs. LL, OR=0.815, 95% CI=0.071-27.16, P=0.816; MM+LM vs.LL, OR=1.013, 95% CI=0.468-2.204, P=0.978。1.1以吸煙對人群分層分析。吸煙組中,LM vs.LL, OR=0.821,95% CI=0.260-2.625, P=0.718: MM vs.LL,數(shù)據(jù)無效,無法比較(0病例);MM+LM vs. LL, OR=0.821, 95% CI=0.260-2.625, P=0.718。不吸煙組中,LM vs.LLOR=1.253, 95% CI=0.433-3.627, P=0.679; MM vs.LL,OR=1.202, 95% CI=0.067-29.517, P=0.967; MM+LM vs.LL, OR=1.170, 95% CI=0.418-3.366, P=0.778。1.2以糖尿病對人群分層分析。糖尿病組中,LM vs.LL,OR=2.566,95%CI=0.855-8.560, P=0.171;MM vs.LL,OR=4.693, 95% CI=0.161-116.397, P=0.385; MM+LM vs.LL, OR=2.454, 95% CI=0.773-7.880, P=0.178。非糖尿病組中,LM vs. LL,OR=0.765, 95% CI=0.310-1.942, P=0.577:MM vs.LL, OR=0.855,95% CI=0.054-21.067, P=0.912; MM+LM vs.LL, OR=0.748, 95% CI=0.278-1.840,P=0.509。進一步針對有糖尿病的冠心病組與無糖尿病的冠心病組比較,LM vs.LL OR=3.263, 95% CI=0.830-13.424, P=0.089:MM vs.LL,數(shù)據(jù)無效,無法比較(0病例);MM+LM vs.LL, OR=3.263, 95% CI=0.830-13.424, P=0.089。1.3以吸煙和糖尿病對人群同時分層分析。在不吸煙人群中,有糖尿病冠心病組與無糖尿病冠心病組比較,LM vs.LL,OR=2.533,95%CI=O.378-16.708,P=0.354; MM vs.LL,數(shù)據(jù)無效,無法比較(0病例);MM+LM vs.LL,OR=2.533,95% CI=0.378-16.708,P=0.354。有糖尿病有冠心病組與無糖尿病無冠心病組比較,LM vs. LL,OR=2.381,95%CI=0.491一11.699,P=0.296:MM vs.LL,OR=5.547,95% CI=0.257-138.059,P=0.332:MM+LM vs.LL,OR=2.224,95%CI=0.455-10.856,P=0.777。無糖尿病有冠心病組中,無糖尿病無冠心病組比較,LM vs.LL,OR=0.952, 95%CI=0.363-3.454,P=0.945:MM vs.LL,OR=1.449,95%CI=0.159-36.644, P=0.825:MM+LM vs.LL,OR=0.889,95%CI=0.257-3.200,P=0.817。在吸煙人群中,有糖尿病冠心病組與無糖尿病有冠心病組比較,LM vs.LL, OR=4.669,95%CI=O.673-32.360,P=0.169;MM vs.LL,數(shù)據(jù)無效,無法比較(0病例);MM+LM vs.LL,OR=4.669,95%CI=0.673-32.360,P=0.169。有糖尿病冠心病組與無糖尿病無冠心病組比較,LM vs.LL,OR=2.564,95%CI=0.461-14.184, P=0.280;MM vs.LL,數(shù)據(jù)無效,無法比較(0病例);MM+LM vs.LL, OR=2.564, 95%CI=0.461-14.184,P=0.280。無糖尿病冠心病組與無糖尿病無冠心病組比較,LMvs.LL,OR=0.549,95%CI=0.144-2.161,P=0.393;MM vs.LL,數(shù)據(jù)無效,無法比較(0病例);MM+LM vs.LL,OR=0.549,95%CI=0.144-2.161,P=0.393。2.其次采用基因直接計數(shù)法和卡方分布檢驗比較分析冠心病組與對照組的基因型和基因頻率,結(jié)果顯示基因型:X2=0.452,P=0.798;等位基因:X2=0.007, OR=0.969,95%CI=0.457-2.065,P=0.934。2.1以吸煙對人群分層。在吸煙亞組中,冠心病組與對照組相比較,基因型:X2=0.904,P=0.636;等位基因:X2=0.134,OR=0.808,95%CI=0.258-2.527,P=0.714。在不吸煙亞組中,冠心病組與對照組相比較,基因型:X2=0.464,P=0.793;等位基因:X2=0.026,OR=1.087,95%CI=0.390.3.029,P=0.873。2.2以糖尿病對人群分層。有糖尿病的冠心病組與無糖尿病的冠心病組相比較,基因型:X2=3.400,P=0.065;等位基因:X2=3.265,OR=3.152,95%CI=0.854-11.637,P=0.071;有糖尿病的冠心病組與無糖尿病無冠心病組相比較,基因型:X2=2.797,P=0.247;等位基因:X2=2.113,OR=2.220,95%CI=0.737-6.681,P=0.146;無糖尿病的冠心病組與無糖尿病無冠心病組相比較,基因型:X2=0.683,P=0.711;等位基因:X2=0.577,OR=0.704,95%CI=0.284-1.747,P=0.447。2.3以吸煙和糖尿病對人群同時分層。在不吸煙人群中,有糖尿病的冠心病組與無糖尿病的冠心病組相比較,基因型:X2=0.944,P=0.331;等位基因:X2=0.904,OR=2.385,95%CI=0.378-15.034,P=0.342;有糖尿病的冠心病組與無糖尿病無冠心病組相比較,基因型:X2=1.278,P=0.528;等位基因:X2=0.815,OR=1.99,95%CI=0.434-9.123,P=0.367;無糖尿病的冠心病組與無糖尿病無冠心病組相比較,基因型:X2=0.23,P=0.892;等位基因:X2=0.08,OR=0.835,95%CI=0.238.2.923,P=0.777。2.4在吸煙人群中,有糖尿病的冠心病組與無糖尿病的冠心病組相比較,基因型:X2=2.83,P=0.093;等位基因:X2=2.747,OR=4.259,95%CI=0.665-27.275,P=0.099;有糖尿病的冠心病組與無糖尿病無冠心病組相比較,基因型:X2=1.235,P=0.267;等位基因:X2=1.170,0R=2.389,95%CI=0.471-12.117,P=0.279;無糖尿病的冠心病組與無糖尿病無冠心病組相比較,基因型:X2=0.754,P=0.385:等位基因:X2=0.725,OR=0.561,95%CI=0.146-2.159,P=0.394.結(jié)論PON 1 rs854560多態(tài)性與云南地區(qū)人群冠心病的發(fā)病風(fēng)險相關(guān)性不顯著,但該位點攜帶M有提高同時患冠心病和糖尿病的發(fā)病風(fēng)險趨勢(P=0.089)。結(jié)果可能受其他未知復(fù)雜因素和研究樣本量影響,包括遺傳、環(huán)境、地理、溫度、飲食、高血壓史、糖尿病史、代謝異常、飲水、職業(yè)等諸多復(fù)雜因素,需要更多研究數(shù)據(jù)闡釋PON1rs854560與心血管疾病發(fā)病風(fēng)險的關(guān)系。
【關(guān)鍵詞】:PON1 TNF-α IL-6 人類長壽 meta分析 PON1 rs854560 單核苷酸多態(tài)性 冠心病
【學(xué)位授予單位】:昆明理工大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號】:R339.36;R394
【目錄】:
- 摘要 16-8
- AbstractⅠ8-10
- 摘要 210-13
- Abstract Ⅱ13-22
- 縮略表 122-24
- 縮略表 224-26
- 第一部分 PON1、TNF-α、IL-6基因多態(tài)性與人類長壽相關(guān)性研究26-82
- 第一章 緒論26-34
- 1.1 長壽與衰老26-28
- 1.2 與長壽密切相關(guān)的熱門基因28-32
- 1.3 薈萃分析PON1、TNF-α、IL-6與長壽相關(guān)性的意義32-34
- 第二章 實驗材料與方法34-36
- 2.1 文獻的檢索34
- 2.2 研究文獻收集和排除的標(biāo)準(zhǔn)34-35
- 2.3 整理數(shù)據(jù)進行統(tǒng)計分析35-36
- 第三章 實驗結(jié)果36-74
- 3.1 研究文獻的納入結(jié)果36-38
- 3.2 PON1基因rs662多態(tài)性與長壽相關(guān)性的Meta分析結(jié)果38-45
- 3.2.1 異質(zhì)性的檢驗38-40
- 3.2.2 文獻發(fā)表偏倚的評估40-41
- 3.2.3 選取樣本含量的敏感性分析41
- 3.2.4 數(shù)據(jù)合并計算41-45
- 3.3 PON1基因rs854560多態(tài)性與長壽相關(guān)性的Meta分析結(jié)果45-53
- 3.3.1 異質(zhì)性的檢驗45-47
- 3.3.2 文獻發(fā)表偏倚的評估47-48
- 3.3.3 選取樣本含量的敏感性分析48
- 3.3.4 數(shù)據(jù)合并計算48-53
- 3.4 TNF-α基因rs1800629多態(tài)性與長壽相關(guān)性的Meta分析結(jié)果53-62
- 3.4.1 異質(zhì)性的檢驗53-55
- 3.4.2 文獻發(fā)表偏倚的評估55-56
- 3.4.3 選取樣本含量的敏感性分析56
- 3.4.4 數(shù)據(jù)合并計算56-62
- 3.5 IL-6基因rs1800795多態(tài)性與長壽相關(guān)性的Meta分析結(jié)果62-74
- 3.5.1 異質(zhì)性的檢驗62-65
- 3.5.2 文獻發(fā)表偏倚的評估65-66
- 3.5.3 選取樣本含量的敏感性分析66
- 3.5.4 數(shù)據(jù)合并計算66-74
- 第四章 討論74-80
- 第五章 結(jié)論與展望80-82
- 5.1 結(jié)論80
- 5.2 展望80-82
- 第二部分 PON1基因rs854560多態(tài)性與云南地區(qū)人群CHD相關(guān)性研究82-116
- 第一章 緒論82-88
- 1.1 長壽與冠心病82-83
- 1.2 與CHD密切相關(guān)的熱門基因PON183-86
- 1.3 探究PON1與CHD相關(guān)性的意義86-88
- 第二章 實驗材料與方法88-98
- 2.1 實驗的材料88-91
- 2.1.1 主要的試劑與藥品88-89
- 2.1.2 主要的儀器與設(shè)備89
- 2.1.3 實驗溶液的配制89-91
- 2.2 方法91-98
- 2.2.1 血樣的收集和樣本信息的采集91
- 2.2.2 樣本外周血的基因組DNA抽提(酚-氯仿提取法)91-92
- 2.2.3 基因分型92-96
- 2.2.4 統(tǒng)計分析96-98
- 第三章 實驗結(jié)果分析98-110
- 3.1 樣本的TOF檢測原始結(jié)果98-99
- 3.2 制作數(shù)據(jù)表格99-101
- 3.3 研究對象選入的一般信息101
- 3.4 冠心病組和健康組信息的對比101-102
- 3.5 樣本等位基因和基因型頻率的分析結(jié)果102-110
- 3.5.1 PON1基因的rs854560(L55M)位點102
- 3.5.2 PON1基因rs854560多態(tài)性與冠心病相關(guān)性102-103
- 3.5.3 對吸煙和糖尿病分層分析103-110
- 第四章 討論110-114
- 第五章 結(jié)論與展望114-116
- 5.1 結(jié)論114
- 5.2 展望114-116
- 致謝116-118
- 參考文獻118-130
- 附錄A 攻讀學(xué)位期間公開發(fā)表學(xué)術(shù)論文情況130
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,本文編號:940830
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