發(fā)布時間：2017-09-29 07:31

  本文關(guān)鍵詞：番茄MADS-box基因Lemads1的可變剪接與表達模式分析

  更多相關(guān)文章： 可變剪接 番茄 MADS-box Lemads

【摘要】：可變剪接(alternative splicing)是真核基因轉(zhuǎn)錄的普遍現(xiàn)象和重要調(diào)控方式,在生物體的各種生理過程中發(fā)揮著重要的作用。植物轉(zhuǎn)錄因子MADS-box基因在植物生長發(fā)育中發(fā)揮重要作用。番茄(Solanum lycopersicum L.)SEPALLATA(SEP)亞族基因Lemads1是1個在番茄果實成熟過程中具有關(guān)鍵作用的MADS-box家族成員,但至今尚未見其轉(zhuǎn)錄剪接模式的詳細報道。本研究發(fā)現(xiàn),Lemads1基因在轉(zhuǎn)錄時存在可變剪接現(xiàn)象,并檢測到4種Lemads1可變剪接轉(zhuǎn)錄本,其擴增長度依次為:699 bp、741 bp、1 404 bp和1 539 bp。剪接方式有外顯子選擇性切除和內(nèi)含子保留兩種。這4種轉(zhuǎn)錄本編碼長度為232 aa、246 aa和266 aa的3種蛋白質(zhì)。氨基酸序列比對和系統(tǒng)進化分析結(jié)果表明,這3種蛋白序列的差異主要集中在C區(qū),但并不影響它們的系統(tǒng)進化地位。在進化上,它們?nèi)詫儆赟EP亞家族LOFSEP亞支中的FBP9/23分支,與它們親緣關(guān)系最近的番茄SEP類蛋白是SLMBP21。Lemads1反義RNA轉(zhuǎn)基因植株表型觀察結(jié)果表明,該基因可能參與番茄果實成熟和萼片發(fā)育過程;而組織特異性表達分析表明,該基因的4種轉(zhuǎn)錄本具有相似但并不完全相同的表達模式,它們都在萼片和果實中高表達,但在這2個組織發(fā)育過程中的表達變化卻有明顯差異。暗示這些可變剪接轉(zhuǎn)錄本在萼片和果實發(fā)育過程中扮演了不同的角色。本研究提供了番茄Lemads1基因存在可變剪切的重要信息,對該基因功能的深度發(fā)掘具有指導(dǎo)意義。
【作者單位】： 山西大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】： 可變剪接 番茄 MADS-box Lemads
【基金】：國家自然科學(xué)基金項目(No.31501772)~~
【分類號】：Q943.2
【正文快照】： 在自然界中,大部分由真核生物DNA轉(zhuǎn)錄而來的前體mRNA(pre-mRNAs)都包含外顯子(exons)和分布在外顯子之間的非編碼區(qū)域內(nèi)含子(introns)兩部分[1]。前體mRNA的正確編輯對于真核生物體至關(guān)重要。但對于很多基因來說,前體mRNA的剪接方式并不是唯一的。同一條前體mRNA可能通過不同，

本文編號：940749