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沙棘WRI1轉(zhuǎn)錄因子基因的生物信息學(xué)分析

發(fā)布時(shí)間:2017-09-27 09:26

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【摘要】:以構(gòu)建的沙棘(Hippophae rhamnoides Linn.)不同組織轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫(kù)為基礎(chǔ),分離得到1個(gè)沙棘WRI1轉(zhuǎn)錄因子編碼基因,命名為Hr WRI1,利用生物信息學(xué)方法對(duì)其基因結(jié)構(gòu)、理化性質(zhì)、保守域、信號(hào)肽、亞細(xì)胞定位、磷酸化位點(diǎn)和高級(jí)結(jié)構(gòu)等進(jìn)行了預(yù)測(cè)和較為全面的分析。結(jié)果表明,該成員含有1 206 bp的完整開(kāi)放閱讀框,編碼401個(gè)氨基酸組成的不穩(wěn)定親水蛋白,無(wú)信號(hào)肽和跨膜結(jié)構(gòu)域,存在多個(gè)磷酸化位點(diǎn),定位于細(xì)胞核中,高級(jí)結(jié)構(gòu)以無(wú)規(guī)則卷曲為主。與不同植物中已報(bào)道的同源WRI1轉(zhuǎn)錄因子進(jìn)行多重序列比對(duì)后,發(fā)現(xiàn)它們?cè)诤怂崤c氨基酸水平均高度同源,并且具有相同的結(jié)構(gòu)域。
【作者單位】: 大連民族大學(xué)環(huán)境與資源學(xué)院/資源植物研究所;
【關(guān)鍵詞】沙棘(Hippophae rhamnoides Linn.) WRI基因 生物信息學(xué)
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31570681)
【分類(lèi)號(hào)】:S793.6;Q943.2
【正文快照】: 沙棘屬(Hippophae)系林奈于1753年以沙棘(Hippophae rhamnoides Linn.)為模式建立的。沙棘又名醋柳、酸刺等,為胡頹子科沙棘屬落葉灌木或小喬木,是一種新興的小漿果類(lèi)樹(shù)種[1,2]。近年來(lái),植物油脂的需求量越來(lái)越多,利用基因工程技術(shù)提高油料作物中植物油的含量已經(jīng)成為最有發(fā)展

【相似文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條

1 吳曉梅;吳雄熊;陳明訓(xùn);;擬南芥WRI1基因的克隆及其植物反義載體的構(gòu)建[J];江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué);2010年03期

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本文編號(hào):928897

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