本文關(guān)鍵詞：馬尾松GGPPS基因克隆及序列分析

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【摘要】：r{牛兒基r{牛兒基焦磷酸合成酶(GGPPS)是萜烯類物質(zhì)合成的關(guān)鍵酶之一,本研究通過同源序列檢索分析設(shè)計(jì)引物,從馬尾松幼苗針葉組織中克隆到其GGPPS基因,命名為Pma GGPPS,該基因c DNA長1 143bp,開放閱讀區(qū)編碼380個(gè)氨基酸。Pma GGPPS編碼的蛋白質(zhì)序列分析顯示具有Trans IPPS結(jié)構(gòu)域及FARM、SARM兩個(gè)富含天冬氨酸區(qū)域,序列特點(diǎn)與GGPPS蛋白的酶學(xué)功能相符。同源性分析結(jié)果顯示Pma GGPPS核酸序列與其他兩種松屬植物GGPPS基因同源性達(dá)到99%以上,Pma GGPPS編碼蛋白與挪威云杉等植物中GGPPS蛋白同源性也在69%以上。對(duì)Pma GGPPS編碼蛋白進(jìn)行理化性質(zhì)及結(jié)構(gòu)的生物信息學(xué)分析,結(jié)果顯示該蛋白為一種無信號(hào)肽、無跨膜區(qū)的堿性蛋白質(zhì),二級(jí)結(jié)構(gòu)由16段α-螺旋組成,三級(jí)結(jié)構(gòu)同源建模顯示與歐薄荷的異聚r{牛兒基焦磷酸合酶大亞基同源性最高。系統(tǒng)進(jìn)化樹分析顯示該蛋白與紅豆杉、銀杏親緣關(guān)系較近。本研究中克隆得到Pma GGPPS基因?yàn)樯钊胙芯科湓谒芍铣傻挠绊懙於嘶A(chǔ),同時(shí)根據(jù)GGPPS基因設(shè)計(jì)熒光定量引物并優(yōu)化反應(yīng)條件,為下一步研究基因表達(dá)水平與產(chǎn)脂力關(guān)系提供了理論依據(jù)和技術(shù)參考。
【作者單位】： 廣西林業(yè)科學(xué)研究院廣西優(yōu)良用材林資源培育重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】： 馬尾松 r{牛兒基r{牛兒基焦磷酸合成酶(GGPPS) 基因克隆 熒光定量PCR
【基金】：廣西自然科學(xué)基金項(xiàng)目(2014GXNSFBA118106) 廣西林科院基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)項(xiàng)目(201419)
【分類號(hào)】：S791.248
【正文快照】： 針葉樹可分泌大量有特殊氣味的樹脂,也稱之為松脂,是松樹生理代謝的次生產(chǎn)物,也是重要的工業(yè)原料,長期以來為人們所研究和開發(fā)利用[1]。全世界約有20種產(chǎn)脂力較高的松樹被用作主要采脂樹種,馬尾松(Pinus massoniana)是中國最主要的采脂樹種,有90%以上的松脂采自馬尾松[2~3]。

【相似文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 胡銀崗;林凡云;王士強(qiáng);何蓓如;;糜子抗旱節(jié)水相關(guān)基因PmMYB的克隆及表達(dá)分析[J];遺傳;2008年03期

2 李順成,龐有志;天然基因克隆的制備[J];洛陽農(nóng)專學(xué)報(bào);1994年02期

3 劉羽;趙傳志;李長生;李翠;王興軍;;花生HIR基因的克隆表達(dá)與進(jìn)化分析[J];山東農(nóng)業(yè)科學(xué);2014年05期

4 馬現(xiàn)永,曹永長,舒鼎銘,畢英佐;肌肉生成抑制因子基因的克隆、表達(dá)及動(dòng)物免疫實(shí)驗(yàn)[J];中國科學(xué)C輯:生命科學(xué);2004年06期

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6 史仁玖;殷s，

本文編號(hào)：849015