本文關(guān)鍵詞：水曲柳FmGT8家族基因生物信息及表達(dá)模式分析

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【摘要】：為研究水曲柳糖基轉(zhuǎn)移酶8家族(glycosyltransferases,FmGT8)基因結(jié)構(gòu)特征及編碼蛋白性質(zhì),揭示其時空表達(dá)模式以及對應(yīng)拉處理的響應(yīng)機制,在獲得4個水曲柳FmGT8基因的基礎(chǔ)上,應(yīng)用生物信息學(xué)軟件對Fm GT8及其編碼蛋白進(jìn)行詳細(xì)的分析;選擇5—9月的水曲柳葉子、木質(zhì)部以及外皮樣本,利用實時熒光定量PCR分析FmGT8基因的表達(dá)模式;對水曲柳分別進(jìn)行1、3、7 d的應(yīng)拉處理,分析Fm GT8基因轉(zhuǎn)錄表達(dá)對應(yīng)拉處理的響應(yīng)模式。結(jié)果顯示:獲得了3個FmGT8全長基因(FmGT8-1,FmGT8-2,FmGT8-3)和1個Fm GT8基因片段(Fm GT8-4),已上傳至NCBI并獲得登錄號分別為KP307672、KP307673、KP307674、KP307675。FmGT8-1、FmGT8-2、FmGT8-3在木質(zhì)部中表達(dá)量最高,Fm GT8-4在外皮中的表達(dá)量最高;FmGT8-1、FmGT8-2、FmGT8-3均在6月的相對表達(dá)量達(dá)到最高,Fm GT8-4在9月表達(dá)量最高。4個基因在應(yīng)拉處理材料中的表達(dá)模式各不相同,但均對應(yīng)拉處理有響應(yīng)。FmGT8-1、FmGT8-2、FmGT8-4在應(yīng)拉受力面的表達(dá)量最高,FmGT8-3在應(yīng)壓受力面表達(dá)量最高,說明FmGT8具有時空特異性。研究結(jié)果表明FmGT8家族基因可能參與了細(xì)胞壁與木質(zhì)素的合成。
【作者單位】： 東北林業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】： 水曲柳 FmGT 時空表達(dá) 應(yīng)拉木 生物信息學(xué)
【基金】：“十二五”國家科技支撐計劃(2012BAD21B0201-7) 國家重點實驗室創(chuàng)新項目(2013B04)
【分類號】：S792.41
【正文快照】： 糖基轉(zhuǎn)移酶(glycosyltransferases,GTs)是多糖合成中的關(guān)鍵酶[1],參與細(xì)胞壁組分(纖維素、半纖維素和果膠)的合成,催化多種分子的糖基化,參與植物發(fā)育、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、防御等生物學(xué)過程[2-5]。根據(jù)序列同源性、特征結(jié)構(gòu)域、疏水簇分析以及催化特異性等一系列特征,可將糖基轉(zhuǎn)移酶分，

本文編號：827582