本文關(guān)鍵詞：金針菇單核體DAN3和M與其雜交雙核體G1菌絲階段基因表達(dá)差異的轉(zhuǎn)錄組初步分析

  更多相關(guān)文章： 菌絲 轉(zhuǎn)錄組 差異表達(dá)基因 GO功能分析 KEGG pathway分析

【摘要】：以金針菇(Flammulinavelutipes)單核菌株DAN3的基因組為參考,完成單核體DAN3和M及其雜交雙核體G1在菌絲階段的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序與數(shù)據(jù)分析,比較兩個(gè)樣本間的差異基因,并對(duì)差異基因進(jìn)行GO功能分析和KEGG pathway分析。結(jié)果表明:兩個(gè)樣本中共有顯著性差異表達(dá)的基因86個(gè),其中,在G1中呈上調(diào)、下調(diào)表達(dá)的基因數(shù)分別為41、45個(gè),有2個(gè)基因在G1中特異表達(dá)。GO功能分析結(jié)果表明,86個(gè)差異基因中有40個(gè)基因比對(duì)上了GO功能注釋,其中18個(gè)基因在G1中呈上調(diào)表達(dá);單一生物過(guò)程和催化活性為顯著性富集的功能,相關(guān)基因在G1中呈上調(diào)表達(dá)。KEGG pathway分析結(jié)果表明,22個(gè)差異基因被定位到17條Pathway,其中10個(gè)基因在G1中呈上調(diào)表達(dá),包括賴氨酸代謝途徑對(duì)應(yīng)基因,3_M和G1菌絲樣品中賴氨酸含量分別為1.70×103 ng/mg和1.06×103 ng/mg,說(shuō)明G1中上調(diào)的基因可能與之降解相關(guān);DNA復(fù)制是顯著性富集的代謝途徑,相關(guān)基因在G1中呈下調(diào)表達(dá)。
【作者單位】： 上海海洋大學(xué)食品學(xué)院;上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院食用菌研究所農(nóng)業(yè)部南方食用菌資源利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室國(guó)家食用菌工程技術(shù)研究中心國(guó)家食用菌加工技術(shù)研發(fā)中心上海市農(nóng)業(yè)遺傳育種重點(diǎn)開(kāi)放實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】： 菌絲 轉(zhuǎn)錄組 差異表達(dá)基因 GO功能分析 KEGG pathway分析
【基金】：國(guó)家科技支撐項(xiàng)目(2013BAD16802)資助
【分類號(hào)】：S646.15
【正文快照】： 金針菇(Flammulinavelutipes(Fr.)Sing),是著名的食、藥兩用真菌,不僅味道鮮美,且含有多種對(duì)人體有益的成分[1],為我國(guó)產(chǎn)量最高的工廠化生產(chǎn)菇種。作為典型的四極異宗結(jié)合的真菌[2],金針菇雙核菌絲的形成由兩對(duì)交配型因子A、B控制[3]。A、B因子都不同的單核菌絲質(zhì)配,形成具有

【相似文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

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3 宋文華;陳明杰;宋春艷;張美彥;陳祥;林楠;鮑大鵬;;一個(gè)香菇單核體的B位點(diǎn)結(jié)構(gòu)的分子解析[A];第九屆全國(guó)食用菌學(xué)術(shù)研討會(huì)摘要集[C];2010年

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8 程水明;;來(lái)自香菇雙核體中兩組成型核不對(duì)稱恢復(fù)的遺傳分析(英文)[A];首屆全國(guó)食用菌中青年專家學(xué)術(shù)交流會(huì)論文集[C];2006年

中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前3條

1 徐凱;基于分子標(biāo)記手段輔助靈芝育種的研究[D];南京農(nóng)業(yè)大學(xué);2014年

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3 秦娟;金針菇子實(shí)體顏色在單孢及測(cè)交后代群體中遺傳分化研究[D];南京農(nóng)業(yè)大學(xué);2012年

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本文編號(hào)：792693