本文關(guān)鍵詞：云南地方水稻品種抗稻瘟病基因Pita功能區(qū)段序列變異分析

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【摘要】：稻瘟病抗性基因序列變異的分析與認(rèn)識是挖掘水稻抗稻瘟病基因資源的基礎(chǔ)。對來源于云南省56個縣(市)的218份地方稻品種稻瘟病抗性基因Pita第二編碼區(qū)功能位點區(qū)段的609個堿基進(jìn)行了測序分析。結(jié)果表明,所有供試品種在此序列上有18個變異位點,存在46種DNA單倍型和28種蛋白類型,其中DNA單倍型Pita-H1、Pita-H2、Pita-H6頻率較高,三者比例分別為17.89%、29.82%、20.18%,合計67.89%,是云南的優(yōu)勢單倍型,而其他單倍型頻率較低,頻率0.46%~3.67%。攜帶Pita抗性基因(編碼區(qū)第2752位功能位點堿基為G)的品種共61個,占供試材料的27.98%,其中39個品種(占63.93%)與越南抗性品種Tetep序列一致。Pita抗性基因在水稻各亞種和生態(tài)型中的分布是不平衡的,秈稻中的頻率為35.06%,粳稻中為24.11%,水稻中31.03%,陸稻中21.92%,黏稻中30.77%,糯稻中18.37%。Pita抗性基因在云南省廣泛分布,36縣(市)檢測到了Pita抗性基因,但南部地區(qū)頻率高于其他地區(qū),且有的縣頻率較高,呈小集中的特點,海拔2200m以上的7個品種未能檢測到Pita抗性基因。
【作者單位】： 云南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院生物技術(shù)與種質(zhì)資源研究所/云南省農(nóng)業(yè)生物技術(shù)重點實驗室/農(nóng)業(yè)部西南作物基因資源與種質(zhì)創(chuàng)制重點實驗室;
【關(guān)鍵詞】： 稻 云南 稻瘟病 Pita
【基金】：國家基礎(chǔ)研究計劃資助項目(2012FY110200) 國家自然科學(xué)基金資助項目(31360331)
【分類號】：S435.111.41
【正文快照】： 稻瘟病是全世界各稻區(qū)最為嚴(yán)重的病害之一。云南地方稻種資源Pita基因包含功能位點的區(qū)段由于稻瘟病菌的高度變異性和不穩(wěn)定性,新育成的進(jìn)行測序分析,明確Pita抗性基因的多樣性,以及具有單一抗性基因的抗性品種在推廣種植幾年后就品種攜帶Pita抗性基因的情況,積累種質(zhì)資源基因

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