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基于COⅠ基因序列的東、黃海區(qū)野生與養(yǎng)殖大黃魚遺傳多樣性分析

發(fā)布時(shí)間:2017-08-24 04:04

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【摘要】:為研究野生與養(yǎng)殖大黃魚(Larimichthys crocea)群體的遺傳多樣性,對大黃魚8個(gè)野生群體及6個(gè)養(yǎng)殖群體共336個(gè)樣本的線粒體COⅠ基因部分序列進(jìn)行了擴(kuò)增和測序分析。實(shí)驗(yàn)最終獲得序列片段長621 bp,總變異位點(diǎn)38個(gè),簡約信息位點(diǎn)23個(gè),單變異位點(diǎn)15個(gè),其中野生群體包含38個(gè)變異位點(diǎn),占總變異的100%,養(yǎng)殖群體包含8個(gè)變異位點(diǎn),占總變異的21.05%。在所有樣本中共檢測出單倍型34個(gè),單倍型多樣性為0.587,核苷酸多樣性為0.00194,野生及養(yǎng)殖群體單倍型多樣性指數(shù)分別為0.714~0.952、0.000~0.581。大黃魚養(yǎng)殖與野生兩個(gè)組群間的遺傳分化指數(shù)為0.04982,占總變異的4.98%,差異極顯著(P0.01),組群間群體間的變異占1.46%(P0.05),群體內(nèi)的變異占93.56%(P0.01)。以上結(jié)果表明,大黃魚的遺傳變異主要來自于群體內(nèi),養(yǎng)殖群體的遺傳多樣性顯著低于野生群體,兩者的遺傳多樣性程度均處于較低水平,養(yǎng)殖群體間或野生群體間不存在顯著的遺傳分化,而養(yǎng)殖與野生兩大組群間存在著顯著的遺傳分化。此外,通過對群體遺傳結(jié)構(gòu)及進(jìn)化樹的分析表明,東、黃海大黃魚應(yīng)屬于同一地理種群,但兩者間存在較低程度的遺傳分化現(xiàn)象,黃海的大黃魚群體遺傳多樣性高于東海群體。本研究可為大黃魚種質(zhì)資源的保護(hù)和恢復(fù)提供理論依據(jù)。
【作者單位】: 農(nóng)業(yè)部東海與遠(yuǎn)洋漁業(yè)資源開發(fā)利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室中國水產(chǎn)科學(xué)研究院東海水產(chǎn)研究所;
【關(guān)鍵詞】大黃魚 COⅠ基因 遺傳多樣性 遺傳分化 群體
【基金】:公益性行業(yè)(農(nóng)業(yè))科研專項(xiàng)(201303047) 中央級科研院所基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)項(xiàng)目(東2012T05) 水產(chǎn)種質(zhì)資源平臺(tái)(2014DKA30470)
【分類號】:S917.4
【正文快照】: 大黃魚(Larimichthys crocea)隸屬于鱸形目(Perciformes)、石首魚科(Sciaenidae)、黃魚屬,俗稱黃魚、黃瓜魚、黃花魚等,為暖溫性集群洄游性魚類[1-2]。在中國南至雷州半島,北達(dá)山東半島的海域以及朝鮮西南部外海均有分布[3]。大黃魚曾位居中國傳統(tǒng)的“四大海產(chǎn)”之首,有“海水

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本文編號:729080

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