本文關(guān)鍵詞：宮頸上皮內(nèi)瘤變進(jìn)展相關(guān)基因的生物信息學(xué)分析

  更多相關(guān)文章： 宮頸上皮內(nèi)瘤變 進(jìn)展 表達(dá)譜 基因芯片 生物信息學(xué)

【摘要】：目的:基于芯片數(shù)據(jù)采用生物信息學(xué)方法,挖掘與宮頸上皮內(nèi)瘤變(cervical intraepithelial neoplasia,CIN)進(jìn)展相關(guān)的信號通路和潛在差異表達(dá)基因。方法:在GEO數(shù)據(jù)庫中篩選CIN進(jìn)展相關(guān)m RNA表達(dá)譜芯片數(shù)據(jù),并通過生物信息學(xué)方法進(jìn)行再次分析。結(jié)果:在GEO數(shù)據(jù)庫獲得GSE63514、GSE51993芯片數(shù)據(jù),將共同差異表達(dá)基因信號通路富集獲得Wnt、Endocytosis、Vibrio cholerae infection與CIN進(jìn)展顯著相關(guān)的3條信號通路,及調(diào)控這些信號通路的14個差異表達(dá)基因。通過生物學(xué)注釋與文本挖掘,發(fā)現(xiàn)3個基因與CIN進(jìn)展相關(guān),另有9個基因與腫瘤的進(jìn)展和復(fù)發(fā)相關(guān)。通過Gene Mania工具分析發(fā)現(xiàn)所有篩選的基因都與已知的CIN相關(guān)基因互作形成蛋白互作網(wǎng)絡(luò)。其中CCND2和TGFBR2與多個已知基因存在直接互作。結(jié)論:通過對芯片數(shù)據(jù)再次分析,篩選出3條信號通路及14個差異表達(dá)基因與CIN進(jìn)展相關(guān)。
【作者單位】： 廣西醫(yī)科大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院婦瘤科 區(qū)域性高發(fā)腫瘤早期防治研究教育部重點實驗室;
【關(guān)鍵詞】： 宮頸上皮內(nèi)瘤變 進(jìn)展 表達(dá)譜 基因芯片 生物信息學(xué)
【基金】：國家衛(wèi)生和計劃生育委員會公益性行業(yè)科研專項項目(編號:201402010)~~
【分類號】：R737.33
【正文快照】： 宮頸癌的形成是由炎癥到宮頸上皮內(nèi)瘤變(cer-vical intraepithelial neoplasia,CIN)最后發(fā)展到浸潤癌的連續(xù)演變過程,演變時間需10~25年。由于開展細(xì)胞學(xué)檢查聯(lián)合乳頭瘤病毒(human papillomavirus,HPV)檢測,使CIN易早期發(fā)現(xiàn),降低了宮頸癌的發(fā)病率。高危HPV感染是宮頸癌和CIN的

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本文編號：719125